71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_73960 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009048  PICST_73960  predicted protein  100 
 
 
1335 aa  2712    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.847897 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03490  leucine repeat containing protein, putative  29.23 
 
 
765 aa  169  2.9999999999999998e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02459  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G10390)  29.08 
 
 
1780 aa  162  5e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.186892 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  30.07 
 
 
1266 aa  96.7  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  29.82 
 
 
531 aa  77.8  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  25.71 
 
 
1351 aa  73.2  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  30.35 
 
 
384 aa  72  0.00000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  27.87 
 
 
766 aa  68.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  27.87 
 
 
755 aa  68.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  28.28 
 
 
1744 aa  68.9  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  27.87 
 
 
779 aa  67.8  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  27.87 
 
 
765 aa  67.8  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  28.42 
 
 
772 aa  67.8  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  26.79 
 
 
355 aa  67.8  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  27.87 
 
 
760 aa  67.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  27.32 
 
 
766 aa  66.6  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  27.93 
 
 
772 aa  66.2  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  27.96 
 
 
643 aa  66.2  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  27.87 
 
 
542 aa  65.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  27.23 
 
 
760 aa  65.1  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3741  hypothetical protein  27.25 
 
 
421 aa  65.1  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162842  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  29.32 
 
 
354 aa  63.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  34.4 
 
 
1070 aa  63.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  28.27 
 
 
1088 aa  63.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  34.4 
 
 
1070 aa  63.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  31.87 
 
 
347 aa  63.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  31.72 
 
 
1015 aa  63.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  27.87 
 
 
1041 aa  63.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  26.05 
 
 
1085 aa  60.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3007  leucine-rich repeat-containing protein  30.4 
 
 
789 aa  60.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.165879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3049  leucine-rich repeat-containing protein  30.4 
 
 
789 aa  60.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14518  predicted protein  27.41 
 
 
279 aa  59.3  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.76 
 
 
1107 aa  58.9  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  23.58 
 
 
1112 aa  58.2  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4750  internalin protein  28.64 
 
 
995 aa  57.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000909405 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  28.03 
 
 
867 aa  57  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0463  internalin protein  29.67 
 
 
954 aa  55.8  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0349325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0608  internalin protein  28.71 
 
 
1012 aa  55.5  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  24.89 
 
 
565 aa  53.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0782  leucine-rich repeat-containing protein  26.22 
 
 
535 aa  53.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  27.86 
 
 
993 aa  52.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  25.59 
 
 
1024 aa  52  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28748  predicted protein  31.58 
 
 
935 aa  52  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1158  leucine-rich repeat-containing protein  25.97 
 
 
539 aa  52  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0603774  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_006686  CND03590  enzyme regulator, putative  29.41 
 
 
374 aa  51.2  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  30.04 
 
 
788 aa  51.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  29.75 
 
 
631 aa  50.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  29.23 
 
 
508 aa  50.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  30.8 
 
 
788 aa  50.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44011  predicted protein  32.02 
 
 
899 aa  50.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0173538  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0822  LRR-like protein  24.6 
 
 
523 aa  50.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.297337  normal  0.386181 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  30.04 
 
 
788 aa  50.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1188  hypothetical protein  47.54 
 
 
1389 aa  50.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  27.56 
 
 
1052 aa  50.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  24.33 
 
 
1749 aa  50.8  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00409  Leucine Rich Repeat domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04960)  26.11 
 
 
807 aa  50.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000909963  normal  0.437099 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2893  chitinase II  34.02 
 
 
587 aa  49.3  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000583173  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0025  effector protein YopM  26.96 
 
 
388 aa  48.9  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012796  normal  0.260783 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35741  predicted protein  33.33 
 
 
1370 aa  48.5  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0907  protein of unknown function/lipoprotein, putative  31.58 
 
 
877 aa  48.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0467  cell wall anchor domain-containing protein  26.32 
 
 
1011 aa  47.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  25.6 
 
 
692 aa  47.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  22.91 
 
 
2132 aa  46.6  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_002950  PG0350  internalin-related protein  29.3 
 
 
484 aa  46.6  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0909966 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29610  predicted protein  31.74 
 
 
630 aa  46.6  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.926539  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  27.71 
 
 
1344 aa  46.6  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1473  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  30.84 
 
 
341 aa  46.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  49.09 
 
 
1679 aa  45.8  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  28.33 
 
 
858 aa  45.8  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2003  internalin-related protein  26.18 
 
 
424 aa  45.4  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000199876  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  27.34 
 
 
482 aa  45.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>