88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_52351 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00418  urea transporter (Dur3), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04870)  54.23 
 
 		 693 aa  689    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.798545 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52351  urea active transport protein  100 
 
 		 724 aa  1479    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0516586  normal  0.828998 
 
 
-
 
NC_006686  CND00530  urea transporter, putative  43.79 
 
 		 674 aa  531  1e-149  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.45321  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07373  solute symporter family transporter (AFU_orthologue; AFUA_6G03200)  43.87 
 
 		 699 aa  487  1e-136  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02598  urea active transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17570)  39.32 
 
 		 680 aa  450  1e-125  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.811341 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119678  predicted protein  38.22 
 
 		 709 aa  437  1e-121  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29213  urea transport protein  37.44 
 
 		 668 aa  410  1e-113  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0581449 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20424  urea transporter  37.11 
 
 		 704 aa  395  1e-108  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32520  Urea active transport protein  36.23 
 
 		 658 aa  395  1e-108  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07557  conserved hypothetical protein  35.78 
 
 		 692 aa  389  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314115  hitchhiker  0.00246133 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57505  urea transport protein  34.44 
 
 		 668 aa  384  1e-105  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20443  normal  0.667471 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_768  predicted protein  37.43 
 
 		 643 aa  379  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530084  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49064  urea transport protein  35.88 
 
 		 679 aa  376  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.427526  normal  0.0261396 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55023  urea permease  33.44 
 
 		 659 aa  358  1.9999999999999998e-97  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.410596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2635  sodium/solute transporter family urea transporter  27.76 
 
 		 476 aa  110  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.451328 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2263  sodium/solute transporter family urea transporter  27.79 
 
 		 474 aa  108  4e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0029  Na+/solute symporter  27.29 
 
 		 488 aa  102  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.080483 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0779  Na+/solute symporter  25.47 
 
 		 482 aa  99  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0182  Na+/solute symporter  25.23 
 
 		 478 aa  94  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01880  Na+/proline symporter  24.6 
 
 		 587 aa  84.7  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1604  Na+/solute symporter  25.94 
 
 		 556 aa  82  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0772243 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  25.84 
 
 		 474 aa  79  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0248  Na+/solute symporter  23.06 
 
 		 500 aa  74.3  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30460  Na+/proline symporter  24.09 
 
 		 554 aa  73.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0720305  normal  0.147602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3587  Na+/solute symporter  23.26 
 
 		 556 aa  67.8  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  26.15 
 
 		 482 aa  62.4  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.06 
 
 		 523 aa  61.6  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  21.52 
 
 		 490 aa  60.8  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  24.27 
 
 		 483 aa  60.8  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  27.42 
 
 		 487 aa  58.5  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  26.26 
 
 		 482 aa  57.4  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  26.36 
 
 		 483 aa  56.6  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  23.26 
 
 		 475 aa  55.1  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  21.92 
 
 		 472 aa  54.7  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  22.25 
 
 		 464 aa  54.3  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  24.36 
 
 		 493 aa  54.3  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2070  Na+/solute symporter  25.53 
 
 		 489 aa  53.1  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  25.86 
 
 		 484 aa  52.8  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  23 
 
 		 482 aa  51.6  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  23.93 
 
 		 482 aa  50.8  0.00008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  24.43 
 
 		 461 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  23.41 
 
 		 596 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  25.91 
 
 		 592 aa  49.7  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.97 
 
 		 548 aa  49.7  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2416  Na+/solute symporter  38.14 
 
 		 575 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1911  Na+/solute symporter  25.6 
 
 		 460 aa  50.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504205  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1786  Na+/solute symporter  25.13 
 
 		 483 aa  49.3  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.483787  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  23.16 
 
 		 476 aa  48.5  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  24.03 
 
 		 495 aa  48.5  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  23.96 
 
 		 462 aa  48.1  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  25.53 
 
 		 479 aa  48.1  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  21.97 
 
 		 527 aa  47.8  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0686  Na+/solute symporter  26.4 
 
 		 507 aa  47.8  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.663287  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  23.68 
 
 		 483 aa  47.8  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60304  urea transport protein  25.19 
 
 		 520 aa  47  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.087993 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2874  sodium/panthothenate symporter  29.27 
 
 		 495 aa  47  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  30.09 
 
 		 492 aa  46.6  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  24.47 
 
 		 492 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  22.88 
 
 		 488 aa  46.2  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  24.47 
 
 		 492 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0036  Na+ symporter  25.96 
 
 		 537 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  24.47 
 
 		 493 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3686  sodium/panthothenate symporter  23.66 
 
 		 483 aa  46.2  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.925299  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  24.47 
 
 		 493 aa  46.2  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  23.26 
 
 		 597 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  24.47 
 
 		 493 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1156  sodium/proline symporter  24.04 
 
 		 486 aa  45.8  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.307204  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  29.79 
 
 		 520 aa  45.8  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3321  sodium/panthothenate symporter  25.68 
 
 		 494 aa  45.8  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  26.42 
 
 		 486 aa  45.8  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  21.65 
 
 		 497 aa  45.4  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1379  acetate permease  25.54 
 
 		 574 aa  45.1  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.644113  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3844  sodium/panthothenate symporter  20.92 
 
 		 483 aa  44.7  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3448  Na+/solute symporter  24.41 
 
 		 495 aa  45.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.08 
 
 		 533 aa  45.1  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2052  Na+/solute symporter  23.81 
 
 		 702 aa  44.7  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.698797  normal  0.324787 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  22.77 
 
 		 529 aa  44.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  24.21 
 
 		 492 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  22.81 
 
 		 492 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  24.47 
 
 		 492 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0672  Na+/solute symporter  21.08 
 
 		 633 aa  44.3  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1264  sodium:proline symporter (proline permease)  21.75 
 
 		 639 aa  43.9  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0939  hypothetical protein  21.8 
 
 		 1157 aa  43.9  0.009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.186942 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3911  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.49 
 
 		 554 aa  44.3  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215473  normal  0.0942004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2624  acetate permease  28.66 
 
 		 520 aa  43.9  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.332014  normal  0.410104 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  23.53 
 
 		 562 aa  43.9  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2637  acetate permease  28.66 
 
 		 520 aa  43.9  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0134816  normal  0.110643 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2487  acetate permease  28.66 
 
 		 520 aa  43.9  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.869989  normal  0.753083 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>