292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_44269 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_44269  predicted protein  100 
 
 
247 aa  499  1e-140  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.743811 
 
 
-
 
NC_006686  CND00610  protein-binding protein, putative  43.36 
 
 
249 aa  177  2e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.188766  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_5762  predicted protein  45.45 
 
 
236 aa  176  5e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11001  AI-BP family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G08360)  52.78 
 
 
186 aa  143  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000466447  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86160  predicted protein  37 
 
 
285 aa  100  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120619  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0083  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.62 
 
 
524 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0086  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.2 
 
 
523 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1640  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.17 
 
 
542 aa  86.7  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0283025 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1583  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33 
 
 
512 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0797204 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.69 
 
 
524 aa  84  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1024  YjeF-related protein-like  31.16 
 
 
528 aa  84.3  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0366  putative sugar kinase  34.3 
 
 
502 aa  83.2  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1837  yjeF related protein  34.43 
 
 
523 aa  82.4  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1401  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.48 
 
 
507 aa  80.5  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.324731  normal  0.9044 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0648  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.82 
 
 
518 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.15 
 
 
509 aa  79  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.29 
 
 
513 aa  79  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  36.16 
 
 
522 aa  78.6  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2277  hypothetical protein  35.47 
 
 
479 aa  77.8  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1520  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.62 
 
 
501 aa  75.9  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000211008 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.63 
 
 
532 aa  75.9  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1145  YjeF-related protein-like protein  33.87 
 
 
495 aa  76.3  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0478432  normal  0.107568 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2405  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.58 
 
 
478 aa  75.9  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.104844  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3237  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.06 
 
 
546 aa  75.9  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.271613 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0723  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.72 
 
 
511 aa  75.5  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191783  normal  0.257286 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.26 
 
 
504 aa  74.3  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1683  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.92 
 
 
467 aa  74.3  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1126  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.18 
 
 
504 aa  74.3  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000000000609405  decreased coverage  0.000000000191646 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1934  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 
514 aa  73.9  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000050145 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19611  fused sugar kinase/uncharacterized domain-containing protein  34.1 
 
 
533 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0831835 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33 
 
 
519 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.63 
 
 
524 aa  73.2  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0947  hypothetical protein  33.97 
 
 
515 aa  72.8  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1846  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.92 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2384  hypothetical protein  32.93 
 
 
522 aa  72.4  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  30.99 
 
 
492 aa  72  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0976  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.81 
 
 
512 aa  70.5  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000105274  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1519  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.35 
 
 
556 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.025545 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1880  YjeF-related protein  26.67 
 
 
481 aa  69.7  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.523049  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1273  hypothetical protein  31.89 
 
 
511 aa  69.3  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.485715  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1984  hypothetical protein  32.26 
 
 
487 aa  68.9  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1204  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.81 
 
 
523 aa  68.9  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.128075  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.15 
 
 
528 aa  67.8  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1332  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.58 
 
 
476 aa  68.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.977936  normal  0.520853 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.65 
 
 
515 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0878  hypothetical protein  31.38 
 
 
507 aa  67.4  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1191  YjeF-related protein-like protein  33.77 
 
 
449 aa  67.4  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.5 
 
 
521 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2373  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.17 
 
 
507 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  28.92 
 
 
511 aa  67  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3587  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.42 
 
 
496 aa  67  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.439263  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3410  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.27 
 
 
556 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.802721  normal  0.621844 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.65 
 
 
500 aa  66.2  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2191  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.66 
 
 
522 aa  66.2  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755695  normal  0.636409 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  31 
 
 
530 aa  66.2  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0751  YjeF family protein  28.11 
 
 
463 aa  66.2  0.0000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.553827  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.64 
 
 
514 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0048  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.16 
 
 
468 aa  65.5  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2329  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.86 
 
 
507 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896222  normal  0.257652 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0491  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.41 
 
 
504 aa  65.1  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0936655  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.29 
 
 
501 aa  64.7  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  31 
 
 
514 aa  65.1  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  29.5 
 
 
490 aa  64.7  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.85 
 
 
479 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2650  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.66 
 
 
507 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  30.2 
 
 
517 aa  64.3  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.85 
 
 
520 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0995  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.22 
 
 
531 aa  63.9  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1272  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.54 
 
 
530 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0216258 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.13 
 
 
515 aa  63.9  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1346  hypothetical protein  31.08 
 
 
458 aa  63.9  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.212301  hitchhiker  0.000869519 
 
 
-
 
NC_004310  BR1006  YjeF family protein  30.15 
 
 
501 aa  63.5  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0973  YjeF family protein  30.15 
 
 
501 aa  63.5  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.826646  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.25 
 
 
510 aa  63.5  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.68 
 
 
521 aa  63.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0322  sugar kinase  29.68 
 
 
466 aa  63.2  0.000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1617  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.5 
 
 
514 aa  63.2  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.865669  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.42 
 
 
499 aa  62.8  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1912  YjeF-related protein-like protein  32 
 
 
487 aa  62.4  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133146  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1309  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.78 
 
 
528 aa  62.4  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.303647  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2039  carbohydrate kinase YjeF-like protein  29.1 
 
 
490 aa  62  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.86 
 
 
517 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2570  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.29 
 
 
513 aa  61.6  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0989158  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.27 
 
 
530 aa  61.6  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1020  YjeF-related protein-like  28 
 
 
525 aa  62  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0522551  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  28.72 
 
 
512 aa  61.6  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1246  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.68 
 
 
541 aa  61.2  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.05 
 
 
533 aa  60.5  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.35 
 
 
501 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  29.15 
 
 
519 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.63 
 
 
499 aa  60.8  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1386  hypothetical protein  31.33 
 
 
521 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2774  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.18 
 
 
520 aa  61.2  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.966522  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.37 
 
 
485 aa  60.1  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182796  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  30.65 
 
 
515 aa  60.1  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1517  YjeF-related protein-like  32.97 
 
 
581 aa  60.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.126424 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.41 
 
 
502 aa  60.1  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.43 
 
 
515 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  31.98 
 
 
524 aa  59.7  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  30.43 
 
 
510 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>