More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_30177 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_30177  carboxylic acid transporter protein  100 
 
 		 520 aa  1072    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0149724  normal  0.0565304 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85334  Carboxylic acid transporter protein homolog  42.74 
 
 		 493 aa  395  1e-109  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06703  sugar transporter family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05550)  45.34 
 
 		 495 aa  383  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.186153  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01360  carboxylic acid transport protein, putative  39.86 
 
 		 542 aa  302  9e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00179855  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06095  carboxylic acid transport protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09450)  33.33 
 
 		 514 aa  239  1e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.749433  hitchhiker  0.00628385 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01350  lactate transporter, putative  38.73 
 
 		 547 aa  230  4e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.19632  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2527  major facilitator family transporter  31.93 
 
 		 408 aa  210  6e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.039546  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1785  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  32.4 
 
 		 408 aa  209  8e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0134  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  32.17 
 
 		 408 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1761  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  32.17 
 
 		 408 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1032  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  32.17 
 
 		 408 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1274  major facilitator family transporter  32.17 
 
 		 406 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116564  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1959  major facilitator family transporter  32.17 
 
 		 408 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1806  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  32.17 
 
 		 408 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0391  major facilitator superfamily MFS_1  31.45 
 
 		 417 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21713  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0396  major facilitator superfamily MFS_1  31.45 
 
 		 417 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.786385  decreased coverage  4.1004499999999995e-20 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1056  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 406 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0388  major facilitator superfamily MFS_1  31.45 
 
 		 417 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000620465 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1512  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 406 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075206 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1536  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 406 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0409  major facilitator superfamily MFS_1  31.36 
 
 		 417 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000062799 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0451  major facilitator superfamily transporter  31.36 
 
 		 417 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.82484e-20 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1718  major facilitator transporter  34.39 
 
 		 406 aa  202  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658229  hitchhiker  0.000872615 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4676  major facilitator transporter  34.48 
 
 		 420 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573448  normal  0.215223 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1458  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 406 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2559  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2772  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 406 aa  201  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0243448  normal  0.307117 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1418  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 406 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4761  major facilitator transporter  35.32 
 
 		 410 aa  198  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1678  major facilitator superfamily MFS_1  32.73 
 
 		 406 aa  196  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.251673 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2477  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 		 416 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0137  major facilitator superfamily MFS_1  34.77 
 
 		 403 aa  192  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2187  major facilitator superfamily MFS_1  31.74 
 
 		 416 aa  190  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0329536  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1698  major facilitator transporter  32.38 
 
 		 407 aa  188  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11931  sialic acid transport integral membrane protein nanT  31.79 
 
 		 422 aa  176  7e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1653  major facilitator superfamily MFS_1  31.96 
 
 		 430 aa  147  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.389792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 446 aa  106  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04141  predicted transporter  27.56 
 
 		 405 aa  99  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3722  General substrate transporter  27.56 
 
 		 405 aa  99  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04104  hypothetical protein  27.56 
 
 		 405 aa  99  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4405  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 431 aa  87  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2637  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 455 aa  85.1  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3660  putative sialic acid transporter  21.75 
 
 		 495 aa  84.7  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723795  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2527  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.730064  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  23.6 
 
 		 409 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  23.06 
 
 		 409 aa  82  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  22.82 
 
 		 409 aa  80.1  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1618  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 458 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 449 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  23.95 
 
 		 429 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3601  putative sialic acid transporter  20.37 
 
 		 496 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3529  putative sialic acid transporter  20.37 
 
 		 496 aa  78.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3698  putative sialic acid transporter  20.37 
 
 		 496 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3531  putative sialic acid transporter  20.37 
 
 		 496 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  23.18 
 
 		 425 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3636  putative sialic acid transporter  20.37 
 
 		 496 aa  77.4  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0462  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 452 aa  77  0.0000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.042885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  23.28 
 
 		 425 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1242  putative sialic acid transporter  23.62 
 
 		 426 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.364649 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1407  putative sialic acid transporter  21.3 
 
 		 510 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1227  putative sialic acid transporter  23.62 
 
 		 426 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1197  putative sialic acid transporter  23.62 
 
 		 426 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51150  cis,cis-muconate transporter MucK  22.39 
 
 		 451 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000851184 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3519  putative sialic acid transporter  20.93 
 
 		 496 aa  74.3  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1298  putative sialic acid transporter  21.09 
 
 		 510 aa  74.3  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3412  putative sialic acid transporter  20.72 
 
 		 496 aa  74.3  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.510281  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2770  putative sialic acid transporter  21.09 
 
 		 510 aa  74.3  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00045382 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 		 458 aa  74.3  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3706  putative sialic acid transporter  20.93 
 
 		 496 aa  74.3  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.322469  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  20.81 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7161  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 456 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6046  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 446 aa  73.6  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03084  sialic acid transporter  20.72 
 
 		 496 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0482  sialic acid transporter  20.72 
 
 		 496 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03035  hypothetical protein  20.72 
 
 		 496 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0482  putative sialic acid transporter  20.72 
 
 		 496 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4541  putative sialic acid transporter  20.93 
 
 		 496 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.315393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3552  putative sialic acid transporter  20.72 
 
 		 496 aa  72.8  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0255  major facilitator transporter  23.2 
 
 		 395 aa  72  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.299198 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  27.91 
 
 		 449 aa  72.4  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0219  cis,cis-muconate transport protein MucK  22.87 
 
 		 427 aa  72  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0199  cis,cis-muconate transport protein MucK  22.87 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217293  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  22.91 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  27.4 
 
 		 454 aa  70.9  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1353  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 448 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.418078 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  23.24 
 
 		 435 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  23.15 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2085  major facilitator superfamily transporter  26.96 
 
 		 501 aa  70.5  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00714059  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2055  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  30.06 
 
 		 401 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.205311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 423 aa  70.1  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0012  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 527 aa  70.1  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0658  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 447 aa  70.1  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.848878  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 		 398 aa  69.7  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 429 aa  70.1  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  26.64 
 
 		 452 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 436 aa  69.3  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3052  benzoate MFS transporter  24.24 
 
 		 452 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1342  major facilitator superfamily transporter  25.61 
 
 		 450 aa  69.7  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4365  cis,cis-muconate transporter MucK  23.3 
 
 		 450 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>