More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_21430 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  62.27 
 
 
548 aa  687    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  63.84 
 
 
548 aa  687    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  64.94 
 
 
536 aa  732    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  100 
 
 
541 aa  1105    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  58.18 
 
 
550 aa  655    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  42.3 
 
 
553 aa  395  1e-108  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  38.88 
 
 
554 aa  390  1e-107  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  41.79 
 
 
545 aa  391  1e-107  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  38.79 
 
 
553 aa  387  1e-106  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.802406 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  40.82 
 
 
559 aa  384  1e-105  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  41.21 
 
 
543 aa  383  1e-105  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  39.93 
 
 
558 aa  379  1e-104  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  41.35 
 
 
551 aa  378  1e-103  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  43.36 
 
 
560 aa  379  1e-103  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  40.04 
 
 
557 aa  373  1e-102  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  42.59 
 
 
539 aa  372  1e-102  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  41.78 
 
 
552 aa  372  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  42.22 
 
 
554 aa  370  1e-101  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  42.4 
 
 
548 aa  369  1e-101  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  39.89 
 
 
570 aa  371  1e-101  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  41.68 
 
 
558 aa  370  1e-101  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  41.34 
 
 
553 aa  368  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  39.7 
 
 
562 aa  366  1e-100  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  40.67 
 
 
551 aa  366  1e-100  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  40.19 
 
 
545 aa  367  1e-100  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  40 
 
 
542 aa  364  2e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  39.02 
 
 
543 aa  363  4e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  42.06 
 
 
553 aa  363  4e-99  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  40 
 
 
543 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  40 
 
 
542 aa  362  8e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  39.41 
 
 
555 aa  360  3e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  39.22 
 
 
543 aa  360  3e-98  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  37.55 
 
 
540 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  38.23 
 
 
560 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  41.4 
 
 
551 aa  355  1e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  36.98 
 
 
542 aa  354  2e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  40.98 
 
 
547 aa  350  5e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  37.74 
 
 
559 aa  348  2e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  40.11 
 
 
541 aa  347  3e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  37.38 
 
 
557 aa  347  4e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  42.48 
 
 
549 aa  347  5e-94  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  41.92 
 
 
554 aa  346  6e-94  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  38.07 
 
 
563 aa  345  8.999999999999999e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  42.21 
 
 
550 aa  343  4e-93  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  37.66 
 
 
558 aa  343  5e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  39.7 
 
 
552 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  37.9 
 
 
529 aa  334  2e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  37.1 
 
 
529 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  36.38 
 
 
530 aa  324  3e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  35.84 
 
 
535 aa  323  5e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  39.12 
 
 
500 aa  323  5e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  35.02 
 
 
536 aa  320  3e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.116367 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  36.33 
 
 
536 aa  318  1e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  34.66 
 
 
547 aa  318  2e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  36.48 
 
 
532 aa  318  2e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  34.27 
 
 
538 aa  317  3e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.257749 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  37.04 
 
 
527 aa  317  3e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  37.48 
 
 
558 aa  312  9e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  35.83 
 
 
537 aa  309  9e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  36.01 
 
 
552 aa  306  4.0000000000000004e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  36.04 
 
 
527 aa  306  6e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  33.21 
 
 
554 aa  305  1.0000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  34.23 
 
 
527 aa  301  1e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0363344 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  35.81 
 
 
548 aa  300  4e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  34.52 
 
 
533 aa  299  1e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  37.07 
 
 
535 aa  292  1e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  34.09 
 
 
528 aa  289  7e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  34.27 
 
 
555 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  31.93 
 
 
567 aa  280  4e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  33.02 
 
 
561 aa  280  4e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  33.97 
 
 
530 aa  277  3e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.316899 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  32.47 
 
 
546 aa  276  6e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  33.46 
 
 
531 aa  276  7e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  31.85 
 
 
559 aa  271  2.9999999999999997e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  32.34 
 
 
553 aa  270  5e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  32.34 
 
 
553 aa  270  5e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  32.28 
 
 
525 aa  264  3e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  33.27 
 
 
523 aa  264  4e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  32.45 
 
 
528 aa  263  4.999999999999999e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.203796 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  32.78 
 
 
542 aa  261  2e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  32.83 
 
 
519 aa  259  7e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89309  predicted protein  33.83 
 
 
526 aa  258  1e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.140079  normal  0.133549 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  33.46 
 
 
525 aa  254  3e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  31.55 
 
 
542 aa  254  3e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  31.88 
 
 
551 aa  247  3e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49114  predicted protein  33.4 
 
 
527 aa  246  9.999999999999999e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.024249  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  32.59 
 
 
558 aa  244  3e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  30.81 
 
 
570 aa  243  9e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  31.76 
 
 
568 aa  240  5.999999999999999e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  31.4 
 
 
577 aa  238  2e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  28.82 
 
 
560 aa  226  6e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  29.8 
 
 
553 aa  224  4e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.672282 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  29.16 
 
 
563 aa  221  3e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34150  predicted protein  28.91 
 
 
541 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00879554  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22666  predicted protein  29.28 
 
 
546 aa  211  3e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03610  t-complex protein 1, theta subunit (tcp-1-theta), putative  28.82 
 
 
547 aa  204  3e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  28.36 
 
 
558 aa  203  6e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02460  t-complex protein 1, zeta subunit (tcp-1-zeta), putative  27.36 
 
 
552 aa  200  6e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830505  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01851  t-complex protein 1, theta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09740)  28.25 
 
 
581 aa  194  3e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03070  t-complex protein 1, zeta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09590)  28.44 
 
 
539 aa  191  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.470693 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>