244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_16281 on replicon NC_011692
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011692  PHATRDRAFT_16281  predicted protein  100 
 
 
84 aa  174  5e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.398668  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10765  Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G (eIF3g)(Translation initiation factor eIF3 p33 subunit homolog)(eIF3 p33 homolog)(Eukaryotic translation initiation factor 3 RNA-binding subunit)(eIF-3 RNA-binding subunit) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0B3]  57.32 
 
 
289 aa  109  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0100571 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6420  predicted protein  54.76 
 
 
264 aa  104  5e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0177398  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01460  eukaryotic translation initiation factor 3, subunit 4 delta, 44kDa, putative  47.67 
 
 
290 aa  80.1  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.588501  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80765  predicted protein  45.78 
 
 
271 aa  74.3  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.547807  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2332  RNP-1 like RNA-binding protein  38.46 
 
 
108 aa  58.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.200874 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  38.46 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  42.31 
 
 
88 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  39.74 
 
 
109 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  41.03 
 
 
101 aa  57.8  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  38.96 
 
 
82 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03870  transformer-2-beta isoform 3, putative  43.08 
 
 
277 aa  57.4  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  37.18 
 
 
92 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  37.18 
 
 
92 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0251  RNA-binding protein, RNP-1  37.5 
 
 
107 aa  57  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.425967  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1404  RNA-binding region RNP-1  37.18 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.187524  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  38.46 
 
 
90 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09671  RNA-binding protein RbpD  37.18 
 
 
104 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  35.9 
 
 
102 aa  56.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_9858  predicted protein  40.62 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0809817  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  38.46 
 
 
88 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4342  RNP-1 like RNA-binding protein  40.26 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621123  hitchhiker  0.00155097 
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  41.77 
 
 
97 aa  55.5  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  37.84 
 
 
125 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  37.18 
 
 
99 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  39.74 
 
 
94 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  38.46 
 
 
105 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  39.74 
 
 
95 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0128  RNA-binding region RNP-1  37.18 
 
 
103 aa  55.1  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1645  RNA recognition motif-containing protein  37.18 
 
 
95 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1499  RNA-binding region RNP-1  43.55 
 
 
100 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212691  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  38.46 
 
 
98 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  41.94 
 
 
90 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_8270  predicted protein  37.33 
 
 
84 aa  53.9  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  42.62 
 
 
96 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  37.18 
 
 
99 aa  53.5  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1510  RNA recognition motif-containing protein  35.9 
 
 
81 aa  53.5  0.0000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.206818  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  35.06 
 
 
90 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  38.46 
 
 
99 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  37.66 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  38.75 
 
 
83 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15501  RNA-binding protein RbpD  37.1 
 
 
96 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_8174  predicted protein  32.94 
 
 
98 aa  52.4  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.184967 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2883  putative RNA binding protein  42.11 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000182039  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  35.9 
 
 
88 aa  52  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2093  RNP-1 like RNA-binding protein  36.36 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  37.18 
 
 
103 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  35.9 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_710  predicted protein  38.71 
 
 
874 aa  52.4  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  35.9 
 
 
89 aa  52  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  33.33 
 
 
97 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12693  predicted protein  38.03 
 
 
151 aa  52  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689101  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  35.9 
 
 
98 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  35.9 
 
 
98 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  32.05 
 
 
90 aa  51.2  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  32.05 
 
 
104 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34381  predicted protein  35.62 
 
 
319 aa  51.2  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.693095  normal  0.168449 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  35.06 
 
 
94 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  35.06 
 
 
94 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  35.9 
 
 
250 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  35.9 
 
 
250 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0980  RNA-binding region RNP-1  40.32 
 
 
81 aa  50.8  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.000651233  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  34.62 
 
 
111 aa  50.8  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  32.05 
 
 
90 aa  50.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  44.44 
 
 
89 aa  50.4  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  35.06 
 
 
90 aa  50.4  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1009  glycine-rich RNA binding protein  36.99 
 
 
128 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000973374  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 
89 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  33.77 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02490  hypothetical protein  42.62 
 
 
287 aa  50.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.471511  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1139  RNA binding protein  36.99 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000522116  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0944  RNP-1 like RNA-binding protein  41.56 
 
 
117 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51283  predicted protein  34.52 
 
 
328 aa  49.7  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  37.66 
 
 
87 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  33.77 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2901  RNP-1 like RNA-binding protein  36.36 
 
 
102 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86797  predicted protein  36.21 
 
 
838 aa  48.9  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1118  RNP-1 like RNA-binding protein  35.9 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.761285  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  34.62 
 
 
102 aa  49.3  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11941  peptidylprolyl isomerase  33.33 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  normal  0.27768 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 
207 aa  49.7  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48043  predicted protein  33.33 
 
 
233 aa  49.3  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.111526  normal  0.12113 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  36 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  42.62 
 
 
552 aa  48.5  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1324  RNA-binding protein  32 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  32.89 
 
 
90 aa  48.5  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02989  glycine-rich RNA-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08580)  32.88 
 
 
128 aa  48.1  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0108473  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  33.33 
 
 
112 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_8445  predicted protein  39.34 
 
 
67 aa  48.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0140  RNP-1-like RNA-binding protein  32.47 
 
 
152 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000056681  normal  0.0664394 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90501  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein) (PABP) (ARS consensus binding protein ACBP-67) (Polyadenylate tail-binding protein)  39.39 
 
 
632 aa  48.1  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.528167  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4357  RNP-1 like RNA-binding protein  35.06 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1038  RNP-1 like RNA-binding protein  31.17 
 
 
98 aa  48.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  31.65 
 
 
162 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  33.33 
 
 
107 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  37.1 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_8269  predicted protein  32.47 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50098  predicted protein  36.23 
 
 
572 aa  47.8  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442075  normal  0.11137 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>