149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0111 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0111  capsular polysacharride biosynthesis gene, putative  100 
 
 		 422 aa  873    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000821148 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0472  putative capK protein  28.95 
 
 		 459 aa  144  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000021402  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3332  coenzyme F390 synthetase-like  27.64 
 
 		 416 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.422547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2311  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.38 
 
 		 464 aa  124  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0449  putative capK protein  23.92 
 
 		 446 aa  117  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2310  coenzyme F390 synthetase-like protein  24.89 
 
 		 475 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2316  coenzyme F390 synthetase-like protein  24.94 
 
 		 450 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2035  coenzyme F390 synthetase-like protein  22.84 
 
 		 454 aa  93.6  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0441  capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.4 
 
 		 468 aa  92  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356155  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2526  Coenzyme F390 synthetase-like protein  22.22 
 
 		 437 aa  85.1  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142234 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2156  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.02 
 
 		 459 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3269  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  23.89 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3567  CapK related-protein  22.71 
 
 		 502 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1511  CoA ligase  20.5 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3406  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.56 
 
 		 478 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684455  normal  0.102946 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0387  Coenzyme F390 synthetase-like protein  23.76 
 
 		 466 aa  73.6  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.602394  normal  0.432377 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1971  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  24.7 
 
 		 453 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2411  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  22.85 
 
 		 451 aa  72  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2205  Coenzyme F390 synthetase-like protein  20.99 
 
 		 439 aa  71.2  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2454  coenzyme F390 synthetase  23.26 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13008  possible CapK protein  21.73 
 
 		 463 aa  70.9  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0922559  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1535  CapK protein, putative  23.23 
 
 		 461 aa  69.7  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1955  capK related-protein  23.06 
 
 		 453 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00696  hypothetical protein  21.77 
 
 		 417 aa  66.2  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  23.96 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0676  putative CapK protein  24.89 
 
 		 459 aa  64.3  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0499803  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2519  AMP-dependent synthetase and ligase  21.73 
 
 		 448 aa  63.9  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.0166994 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3795  CapK protein, putative  22.14 
 
 		 475 aa  63.9  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.217638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0836  CapK related-protein  21.84 
 
 		 469 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  25.22 
 
 		 432 aa  63.2  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0689  CapK related-protein  23 
 
 		 426 aa  62.8  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0582136  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4415  coenzyme F390 synthetase-like protein  24.31 
 
 		 480 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.992937  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5015  putative polysaccharide biosynthesis protein  23.87 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  29.44 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4201  coenzyme F390 synthetase-like  23.63 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  22.38 
 
 		 439 aa  59.7  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0135  CoA ligase  22.7 
 
 		 450 aa  59.7  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1925  hypothetical protein  23.96 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.132933  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  24.34 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  21.43 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0614  CapK related-protein  22.88 
 
 		 445 aa  57  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.973847  normal  0.145617 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0371  indoleacetate-lysine ligase  26.76 
 
 		 395 aa  57  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  23.98 
 
 		 433 aa  57  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  23.89 
 
 		 448 aa  56.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  21.51 
 
 		 433 aa  56.2  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  22.12 
 
 		 430 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  24.77 
 
 		 428 aa  55.8  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  21.79 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  23.53 
 
 		 432 aa  54.7  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  22.4 
 
 		 430 aa  54.7  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  20.54 
 
 		 433 aa  54.3  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  22.01 
 
 		 432 aa  54.3  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  22.49 
 
 		 432 aa  54.3  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  22.6 
 
 		 434 aa  53.9  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  22.9 
 
 		 428 aa  53.5  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  20.99 
 
 		 433 aa  53.1  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2557  phenylacetate-CoA ligase  29.22 
 
 		 390 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  21.25 
 
 		 429 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  21.14 
 
 		 433 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  21.78 
 
 		 436 aa  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1919  hypothetical protein  24.22 
 
 		 493 aa  51.2  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1908  hypothetical protein  24.22 
 
 		 493 aa  51.2  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3140  hypothetical protein  29.1 
 
 		 447 aa  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  26.16 
 
 		 429 aa  50.1  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  21.45 
 
 		 435 aa  50.1  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  22.51 
 
 		 431 aa  50.1  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  25.43 
 
 		 435 aa  49.7  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1793  putative CapK protein  21.54 
 
 		 441 aa  49.7  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1040  coenzyme F390 synthetase-like protein  20.55 
 
 		 436 aa  49.7  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2480  phenylacetate-CoA ligase  22.78 
 
 		 439 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0807  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.6 
 
 		 452 aa  49.7  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.316461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  21.69 
 
 		 433 aa  49.3  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3882  CapK related-protein  20.22 
 
 		 480 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  23.87 
 
 		 439 aa  49.7  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  22.89 
 
 		 432 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3279  phenylacetate-CoA ligase  22.78 
 
 		 439 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1703  coenzyme F390 synthetase  21.99 
 
 		 472 aa  48.5  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  21.79 
 
 		 433 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0910  coenzyme F390 synthetase-like protein  23.92 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  22.81 
 
 		 432 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  24.48 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  24.19 
 
 		 434 aa  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  20.92 
 
 		 433 aa  47.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  24.48 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  22.84 
 
 		 432 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2617  phenylacetate-CoA ligase  21.89 
 
 		 439 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179563  normal  0.174416 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2010  coenzyme F390 synthetase-like protein  28.89 
 
 		 455 aa  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.484811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  22.86 
 
 		 437 aa  47.8  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  22.88 
 
 		 433 aa  47.8  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  21.93 
 
 		 435 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  21.31 
 
 		 432 aa  47.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1698  amino acid adenylation domain-containing protein  24.74 
 
 		 1278 aa  47.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.123455 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1800  putative polysaccharide biosynthesis protein  20.37 
 
 		 448 aa  47.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3434  coenzyme F390 synthetase-like protein  23.72 
 
 		 467 aa  47.4  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4126  phenylacetate-CoA ligase  23.11 
 
 		 440 aa  47.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.351473  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  23.1 
 
 		 414 aa  47  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0956  Phenylacetate--CoA ligase  25 
 
 		 434 aa  47  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0291  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  19.71 
 
 		 453 aa  46.6  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.326701  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  22.59 
 
 		 438 aa  46.6  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0809  phenylacetate-CoA ligase  22.06 
 
 		 439 aa  46.6  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.693616  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>