140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2993 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2993  Transposase-like Mu  100 
 
 		 677 aa  1411    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0117  integrase catalytic subunit  39.55 
 
 		 614 aa  420  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145881  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0243  integrase catalytic subunit  39.55 
 
 		 614 aa  420  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00837519  hitchhiker  0.00531569 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2451  integrase catalytic subunit  39.55 
 
 		 614 aa  420  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0255149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  38.05 
 
 		 560 aa  352  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  38.83 
 
 		 561 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  36.59 
 
 		 581 aa  339  9.999999999999999e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  35.28 
 
 		 555 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  35.28 
 
 		 567 aa  333  5e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  36.55 
 
 		 558 aa  333  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  36.55 
 
 		 558 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  33.83 
 
 		 663 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5797  integrase catalytic subunit  32.22 
 
 		 245 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  28.47 
 
 		 481 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  24.94 
 
 		 497 aa  120  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  24.94 
 
 		 497 aa  120  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  24.94 
 
 		 497 aa  120  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  28.47 
 
 		 481 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  26.76 
 
 		 468 aa  117  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  30.18 
 
 		 480 aa  116  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  30.18 
 
 		 480 aa  116  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  27.27 
 
 		 552 aa  112  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  28.42 
 
 		 625 aa  108  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  25.83 
 
 		 618 aa  106  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  25.91 
 
 		 618 aa  103  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  25.91 
 
 		 618 aa  103  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  25.28 
 
 		 677 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2225  integrase catalytic subunit  28.46 
 
 		 251 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  29.17 
 
 		 556 aa  102  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  29.17 
 
 		 556 aa  102  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  29.17 
 
 		 556 aa  102  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  29.17 
 
 		 556 aa  102  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  25.28 
 
 		 652 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  25.28 
 
 		 652 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  25.28 
 
 		 652 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  24.81 
 
 		 630 aa  101  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4394  integrase catalytic subunit  27.71 
 
 		 550 aa  99  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  29.26 
 
 		 595 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  23.65 
 
 		 616 aa  94  7e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4506  integrase catalytic subunit  29.88 
 
 		 560 aa  94  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  25.12 
 
 		 614 aa  91.3  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2185  transposase  30.17 
 
 		 224 aa  88.2  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3047  transposase  25.42 
 
 		 636 aa  87.4  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00784211  normal  0.39515 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  26.71 
 
 		 810 aa  87  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  32.66 
 
 		 636 aa  85.1  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  24.78 
 
 		 547 aa  85.1  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  25.5 
 
 		 640 aa  84.3  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  28.25 
 
 		 617 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  28.25 
 
 		 617 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  24.09 
 
 		 626 aa  82.4  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  23.12 
 
 		 551 aa  82.8  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  25.54 
 
 		 548 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  27.36 
 
 		 649 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  25.17 
 
 		 632 aa  80.5  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  24.73 
 
 		 599 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  24.73 
 
 		 599 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  25.67 
 
 		 560 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  25.67 
 
 		 572 aa  79.3  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  25.67 
 
 		 562 aa  79  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  27.71 
 
 		 653 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  25.67 
 
 		 509 aa  78.6  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  29.74 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  24.61 
 
 		 542 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  26.19 
 
 		 640 aa  76.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  29.61 
 
 		 536 aa  76.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  24.83 
 
 		 611 aa  75.5  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  31.69 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1702  hypothetical protein  33.93 
 
 		 650 aa  75.1  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1680  TniA transposase  25.17 
 
 		 640 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2936  TniA transposase  25.17 
 
 		 640 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4717  Integrase catalytic region  21.18 
 
 		 749 aa  72.4  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  26.04 
 
 		 541 aa  71.2  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  26.04 
 
 		 541 aa  71.2  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  26.04 
 
 		 541 aa  71.2  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  26.04 
 
 		 541 aa  71.2  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  25.52 
 
 		 497 aa  70.5  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3150  integrase catalytic subunit  23.29 
 
 		 662 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5218  integrase catalytic subunit  23.29 
 
 		 662 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.250569 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5056  integrase catalytic region  23.29 
 
 		 575 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2602  hypothetical protein  28.57 
 
 		 733 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0193648  normal  0.873039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3575  hypothetical protein  22.57 
 
 		 757 aa  68.2  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.164983 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3504  Integrase catalytic region  22.68 
 
 		 900 aa  67.8  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4577  Integrase catalytic region  22.68 
 
 		 900 aa  67.8  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2235  integrase catalytic region  28.92 
 
 		 644 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.986822  decreased coverage  0.00107006 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3935  putative transposase  23.38 
 
 		 697 aa  66.6  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4288  integrase catalytic subunit  27.46 
 
 		 547 aa  65.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167614  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1364  integrase catalytic subunit  24.19 
 
 		 782 aa  63.5  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565486  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0175  Tn7-like transposition protein B  23.68 
 
 		 716 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4740  integrase catalytic region  23.69 
 
 		 902 aa  62  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0496  integrase  23.71 
 
 		 523 aa  59.7  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.772953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5591  integrase catalytic subunit  23.91 
 
 		 715 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5417  integrase catalytic subunit  23.91 
 
 		 715 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.751819 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06222  hypothetical protein  40.48 
 
 		 300 aa  59.3  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5724  Tn7-like transposition protein B  28.98 
 
 		 723 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2453  Integrase catalytic region  22.06 
 
 		 917 aa  58.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.481095  hitchhiker  0.00214195 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2538  hypothetical protein  24.71 
 
 		 762 aa  57.4  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3873  Integrase catalytic region  25.76 
 
 		 960 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06969  hypothetical protein  27.95 
 
 		 487 aa  56.6  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0221  Tn7-like transposition protein B  22.19 
 
 		 728 aa  55.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.26166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2326  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  26.29 
 
 		 743 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721105 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>