More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0731 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_33493  predicted protein  51.85 
 
 
684 aa  649    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1383  threonyl-tRNA synthetase  83.72 
 
 
608 aa  1076    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520119 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0226  threonyl-tRNA synthetase  53.3 
 
 
614 aa  654    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2787  threonyl-tRNA synthetase  79.51 
 
 
615 aa  1018    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100504  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0935  threonyl-tRNA synthetase  56.95 
 
 
611 aa  695    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0867221  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1034  threonyl-tRNA synthetase  56.28 
 
 
611 aa  686    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2606  threonyl-tRNA synthetase  78.74 
 
 
604 aa  1007    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0580419 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0760  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 
607 aa  1249    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.281808  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1457  threonyl-tRNA synthetase  79.6 
 
 
608 aa  995    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0387  threonyl-tRNA synthetase  78.96 
 
 
610 aa  997    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.677095  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2850  threonyl-tRNA synthetase  55.13 
 
 
604 aa  691    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185982  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2841  threonyl-tRNA synthetase  79.34 
 
 
606 aa  997    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0731  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 
607 aa  1249    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_46103  predicted protein  53.79 
 
 
564 aa  609  1e-173  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.036188 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  49.68 
 
 
662 aa  598  1e-169  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 
596 aa  592  1e-168  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2483  threonyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 
637 aa  588  1e-167  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0764303  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0123  threonyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 
677 aa  588  1e-166  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0729429  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0156  threonyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 
657 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2219  threonyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 
647 aa  578  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1507  threonyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 
649 aa  580  1e-164  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.266157  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0167  threonyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 
657 aa  579  1e-164  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0176  threonyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 
657 aa  578  1e-164  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 
645 aa  578  1e-164  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1715  threonyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 
657 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1906  threonyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
641 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 
646 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0349  threonyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 
595 aa  565  1e-160  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129605  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2511  threonyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 
594 aa  565  1e-160  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0678043  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2501  threonyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 
675 aa  566  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0172  threonyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 
659 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0110  threonyl-tRNA synthetase  46.97 
 
 
595 aa  560  1e-158  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1732  threonyl-tRNA synthetase  46.05 
 
 
630 aa  556  1e-157  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00815  threonyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 
648 aa  555  1e-157  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.270847  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 
648 aa  552  1e-156  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 
643 aa  553  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00002753  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 
645 aa  549  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4472  threonyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 
645 aa  550  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.419718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 
645 aa  550  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 
645 aa  550  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4407  threonyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 
645 aa  548  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00383919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4691  threonyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 
645 aa  550  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.88699e-59 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 
645 aa  550  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4685  threonyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 
645 aa  549  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00204863  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 
644 aa  550  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000386283  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1221  threonyl-tRNA synthetase  48.45 
 
 
647 aa  551  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.001104  hitchhiker  0.00620187 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 
652 aa  550  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 
635 aa  549  1e-155  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4204  threonyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
736 aa  547  1e-154  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0566  threonyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 
583 aa  545  1e-154  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 
643 aa  547  1e-154  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0552  threonyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 
645 aa  548  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000171694  unclonable  1.90469e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4701  threonyl-tRNA synthetase  46.05 
 
 
645 aa  548  1e-154  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  46.24 
 
 
643 aa  548  1e-154  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0559  threonyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 
644 aa  544  1e-153  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454252 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05580  Threonyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 
646 aa  544  1e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000588041  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 
636 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 
643 aa  540  9.999999999999999e-153  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 
638 aa  541  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 
659 aa  541  9.999999999999999e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 
639 aa  540  9.999999999999999e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 
645 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 
636 aa  538  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_002950  PG0992  threonyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 
653 aa  538  1e-151  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 
649 aa  538  1e-151  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 
646 aa  536  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 
645 aa  536  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 
636 aa  535  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  47.91 
 
 
644 aa  537  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 
644 aa  532  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0992  threonyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 
647 aa  533  1e-150  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 
644 aa  533  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 
638 aa  533  1e-150  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 
635 aa  534  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2043  threonyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 
669 aa  535  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000086336 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 
644 aa  532  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 
635 aa  533  1e-150  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 
644 aa  529  1e-149  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0024  threonyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 
648 aa  531  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2317  threonyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
669 aa  531  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.104069  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 
637 aa  525  1e-148  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 
634 aa  523  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0711  threonyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 
647 aa  521  1e-147  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 
637 aa  523  1e-147  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0841  threonine--tRNA ligase  45.16 
 
 
676 aa  522  1e-147  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6132  threonyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 
659 aa  522  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158599  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3269  threonyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 
657 aa  524  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2281  threonyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 
684 aa  522  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2230  threonyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 
666 aa  522  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883238  hitchhiker  0.00000834751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2242  threonyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 
684 aa  522  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0490  threonyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 
647 aa  522  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00808985  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2078  threonyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 
657 aa  523  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2289  threonyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 
684 aa  522  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.45784  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 
638 aa  521  1e-146  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 
641 aa  521  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0448  threonyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 
677 aa  521  1e-146  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.145335  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 
637 aa  520  1e-146  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0613  threonyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 
648 aa  520  1e-146  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2095  threonyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 
684 aa  521  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00031634  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1373  threonyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 
645 aa  517  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000340223  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>