56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2323 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2323  Nucleotide binding protein PINc  100 
 
 		 136 aa  275  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98566e-16 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3133  PilT protein domain protein  56.92 
 
 		 137 aa  154  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  53.79 
 
 		 141 aa  133  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  53.79 
 
 		 141 aa  133  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  51.54 
 
 		 136 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4381  PilT domain-containing protein  47.69 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1712  Nucleotide binding protein PINc  48.46 
 
 		 140 aa  113  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103374  hitchhiker  0.0042604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1065  PilT protein domain protein  39.69 
 
 		 136 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.912654  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2705  PilT protein domain protein  41.98 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000855121  normal  0.254585 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  38.81 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3766  hypothetical protein  35.11 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.44681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1157  hypothetical protein  32.14 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0851306  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1769  hypothetical protein  34.88 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0491  hypothetical protein  35.77 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  36.69 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  32.58 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0425  nucleic acid binding protein  46.43 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2655  hypothetical protein  33.82 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0679  hypothetical protein  36.96 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000243663  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1746  protein of unknown function DUF132  35.77 
 
 		 147 aa  60.1  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1868  PilT protein domain protein  33.61 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1139  nucleotide binding protein, PINc  31.11 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  30.3 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3100  Nucleotide binding protein PINc  35.56 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  30.08 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  34.33 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0103  hypothetical protein  33.93 
 
 		 163 aa  51.2  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0252729 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  34.09 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2742  hypothetical protein  29.25 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3269  conserved hypothetical protein TIGR00305  33.06 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0759  PilT protein domain protein  30.08 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0937288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2867  nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  33.06 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0730  PilT protein domain protein  30.08 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  31.67 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1415  hypothetical protein  31.82 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1053  hypothetical protein  32.23 
 
 		 165 aa  45.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0032005  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3888  protein of unknown function DUF132  32.84 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  29.23 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1646  nucleic acid binding protein  32.17 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0942  PilT protein domain protein  33.61 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.510473  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2631  PilT domain-containing protein  31.34 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.996452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2333  hypothetical protein  27.69 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1057  hypothetical protein  26.13 
 
 		 136 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0110  hypothetical protein  27.68 
 
 		 136 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5180  nucleic acid-binding protein contains PIN domain- like protein  27.05 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2141  nucleotide binding protein PINc  30.33 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.873448  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2883  hypothetical protein  28.95 
 
 		 144 aa  41.2  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.770903 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2262  hypothetical protein  30.33 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0780  hypothetical protein  29.17 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0136  hypothetical protein  30.33 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.595225 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0319  PilT domain-containing protein  28.83 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000227934  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4670  hypothetical protein  29.73 
 
 		 142 aa  40.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1620  hypothetical protein  31.16 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1382  hypothetical protein  32.63 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1558  hypothetical protein  26.13 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448112  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3147  hypothetical protein  34.85 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.372503  normal  0.192106 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>