More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3963 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3963  threonine efflux system  100 
 
 		 207 aa  409  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245678  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4153  threonine efflux system  99.03 
 
 		 207 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000179823  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  81.64 
 
 		 207 aa  345  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  81.16 
 
 		 206 aa  338  4e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  79.81 
 
 		 208 aa  337  5.9999999999999996e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  74.4 
 
 		 206 aa  318  1.9999999999999998e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  74.4 
 
 		 206 aa  318  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  73.91 
 
 		 206 aa  317  7e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  72.46 
 
 		 206 aa  314  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  72.46 
 
 		 206 aa  314  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  72.46 
 
 		 206 aa  314  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  71.98 
 
 		 206 aa  313  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  73.43 
 
 		 206 aa  313  9.999999999999999e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  72.95 
 
 		 206 aa  313  9.999999999999999e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  72.95 
 
 		 206 aa  313  9.999999999999999e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  73.43 
 
 		 206 aa  312  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  73.43 
 
 		 206 aa  312  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  71.98 
 
 		 206 aa  312  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  73.43 
 
 		 206 aa  312  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  72.95 
 
 		 206 aa  311  3.9999999999999997e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  72.68 
 
 		 204 aa  309  1e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  73.17 
 
 		 204 aa  310  1e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  73.17 
 
 		 204 aa  309  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0834  lysine exporter protein  35.45 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0107637  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  33.99 
 
 		 214 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  33.99 
 
 		 214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6400  lysine exporter protein LysE/YggA  32.08 
 
 		 215 aa  122  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3097  lysine exporter protein LysE/YggA  33.02 
 
 		 215 aa  121  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  36.46 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  34.38 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6693  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.9 
 
 		 190 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3366  lysine exporter protein LysE/YggA  30.36 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2482  lysine exporter protein LysE/YggA  31.19 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0100  lysine exporter protein LysE/YggA  31.71 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0587  lysine exporter protein LysE/YggA  29.46 
 
 		 236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2963  lysine exporter protein LysE/YggA  31.6 
 
 		 215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1800  threonine efflux protein, putative  30.69 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3536  lysine exporter protein LysE/YggA  31.74 
 
 		 234 aa  112  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0765  threonine efflux protein, putative  29.82 
 
 		 234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3688  lysine exporter protein LysE/YggA  31.7 
 
 		 235 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1071  putative RhtB protein  33.17 
 
 		 212 aa  111  6e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0699  lysine exporter protein LysE/YggA  31.56 
 
 		 235 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0668  lysine exporter protein LysE/YggA  31.56 
 
 		 235 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0689  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.39 
 
 		 235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2363  lysine exporter protein LysE/YggA  30.99 
 
 		 249 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  30.73 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2129  putative threonine efflux protein  32.73 
 
 		 217 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3293  threonine efflux protein, putative  32.73 
 
 		 217 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2959  putative threonine efflux protein  32.73 
 
 		 217 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0428  LysE type translocator  32.73 
 
 		 217 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0377494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3387  putative threonine efflux protein  32.73 
 
 		 217 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0246  LysE family translocator protein  32.73 
 
 		 217 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1757  lysine exporter protein LysE/YggA  32.52 
 
 		 214 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.290271  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2347  lysine exporter protein LysE/YggA  35.29 
 
 		 207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0009  lysine exporter protein LysE/YggA  31.93 
 
 		 245 aa  108  7.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2796  lysine exporter protein LysE/YggA  28.23 
 
 		 214 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4978  lysine exporter protein LysE/YggA  35.29 
 
 		 207 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2779  amino acid efflux pump, RhtB family protein  35.03 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000004006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3556  lysine exporter protein LysE/YggA  34.21 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.384892 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5396  lysine exporter protein LysE/YggA  34.74 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  30.54 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1555  putative LysE family amino-acid efflux protein  31.58 
 
 		 201 aa  105  3e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5142  lysine exporter protein LysE/YggA  34.34 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003257  threonine efflux protein  33.33 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6764  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.05 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406386  normal  0.273065 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  32.64 
 
 		 219 aa  105  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  33.82 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2431  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.96 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  34.48 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  32.81 
 
 		 219 aa  105  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3653  hypothetical protein  31.79 
 
 		 213 aa  104  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  30.88 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5054  lysine exporter protein LysE/YggA  32.63 
 
 		 212 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199833  normal  0.295211 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  33.99 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00283  neutral amino-acid efflux system  31.53 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3278  homoserine/threonine efflux pump  31.53 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00287  hypothetical protein  31.53 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2461  lysine exporter protein LysE/YggA  32.29 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0352  putative homoserine/threonine efflux protein  31.53 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0399  putative homoserine/threonine efflux protein  31.55 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.97 
 
 		 204 aa  102  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3296  homoserine/threonine efflux pump  31.53 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0394  putative homoserine/threonine efflux protein  31.53 
 
 		 222 aa  101  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3452  LysE family translocator protein  34.38 
 
 		 204 aa  101  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1476  lysine exporter protein LysE/YggA  34.55 
 
 		 212 aa  101  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5352  lysine exporter protein LysE/YggA  33.84 
 
 		 204 aa  101  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0359  putative homoserine/threonine efflux protein  31.07 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  32.18 
 
 		 205 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 		 205 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 		 205 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1641  lysine exporter protein LysE/YggA  28.5 
 
 		 212 aa  99.8  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.950543  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43570  hypothetical protein  30.77 
 
 		 213 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.443465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3113  lysine exporter protein LysE/YggA  34.24 
 
 		 209 aa  99  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.050755  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3581  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 222 aa  99  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4711  lysine exporter protein LysE/YggA  34.74 
 
 		 212 aa  98.6  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1218  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3652  lysine exporter protein LysE/YggA  34.74 
 
 		 212 aa  98.6  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0399  putative transport protein  31.34 
 
 		 210 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0396  putative transport protein  31.34 
 
 		 210 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979225  hitchhiker  0.00000000000454708 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0417  putative transport protein  31.34 
 
 		 210 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0405  putative transport protein  31.34 
 
 		 210 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000145475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>