148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_44311 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_44311  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  792    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3771  hypothetical protein  94.55 
 
 		 385 aa  748    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3212  hypothetical protein  50.13 
 
 		 374 aa  355  6.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0204352 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0098  hemolysin F  50.14 
 
 		 369 aa  346  4e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0392616  hitchhiker  0.000000811123 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2419  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  47.43 
 
 		 369 aa  339  5e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2515  hypothetical protein  46.88 
 
 		 369 aa  336  2.9999999999999997e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3085  hypothetical protein  46.88 
 
 		 369 aa  336  3.9999999999999995e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3227  Male sterility domain protein  44.44 
 
 		 369 aa  332  9e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0566277  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1347  Male sterility domain  44.62 
 
 		 367 aa  312  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.416798  normal  0.0755507 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1411  Male sterility domain protein  44.35 
 
 		 367 aa  309  4e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0948255  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1165  Male sterility domain  44.2 
 
 		 367 aa  299  7e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1462  putative signal peptide protein  43.97 
 
 		 367 aa  295  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.653103 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1737  hypothetical protein  38.9 
 
 		 395 aa  212  7e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0887086  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2261  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  37.98 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.715981  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1021  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  37.98 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.107249  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0936  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  37.98 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1142  hypothetical protein  37.53 
 
 		 395 aa  190  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0098  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  37.53 
 
 		 395 aa  190  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.992501  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1515  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  37.53 
 
 		 395 aa  190  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.149273  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4137  Male sterility-like  34.56 
 
 		 404 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.22 
 
 		 403 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4229  hypothetical protein  34.3 
 
 		 404 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3288  hypothetical protein  34.3 
 
 		 404 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.120126 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4376  hypothetical protein  34.49 
 
 		 412 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4125  hypothetical protein  34.04 
 
 		 404 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3651  hypothetical protein  33.95 
 
 		 403 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.827803 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23800  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  25.42 
 
 		 937 aa  74.3  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  28.14 
 
 		 1498 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4933  Male sterility domain protein  28.73 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349129  normal  0.407936 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3148  Male sterility domain protein  29.82 
 
 		 354 aa  65.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18005  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13425  short chain dehydrogenase  27.27 
 
 		 650 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4147  hypothetical protein  28.91 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.497178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2551  hypothetical protein  27.94 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0234245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0262  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.91 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2676  hypothetical protein  26.57 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0511814 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3013  hypothetical protein  27.13 
 
 		 366 aa  58.9  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0103839  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1104  Male sterility domain protein  26.4 
 
 		 701 aa  57.8  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.972313  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0793  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  23.96 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0364  Male sterility domain protein  26.76 
 
 		 493 aa  57.8  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.99 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5128  Male sterility domain protein  25.98 
 
 		 358 aa  57  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  27.65 
 
 		 661 aa  57  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.32 
 
 		 326 aa  57  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  25.46 
 
 		 1449 aa  57  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5015  Male sterility domain-containing protein  29.8 
 
 		 667 aa  56.6  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435156  normal  0.471467 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.58 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  25.69 
 
 		 338 aa  56.2  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4094  Male sterility domain protein  26.62 
 
 		 359 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.796216  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.73 
 
 		 328 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3608  Male sterility domain protein  24.84 
 
 		 637 aa  54.7  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.619777  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68020  L-aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase, large subunit  24.11 
 
 		 1394 aa  54.3  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224506  normal  0.0608631 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.16 
 
 		 328 aa  53.5  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0273473  normal  0.296393 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.8 
 
 		 318 aa  53.5  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.514194  hitchhiker  0.0000234209 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7306  peptide synthetase  25.09 
 
 		 1506 aa  53.5  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.370247  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4728  hypothetical protein  26.5 
 
 		 354 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10102  peptide synthetase nrp  25.88 
 
 		 2512 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4168  Male sterility domain  32.03 
 
 		 764 aa  53.1  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  25.88 
 
 		 1454 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.09 
 
 		 355 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4416  amino acid adenylation domain-containing protein  25.9 
 
 		 1485 aa  52.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1084  non-ribosomal peptide synthetase modules and related proteins-like protein  31.97 
 
 		 2638 aa  51.6  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.98 
 
 		 330 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.608202  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  24.29 
 
 		 1270 aa  50.8  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  24.58 
 
 		 333 aa  50.8  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 		 329 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.28 
 
 		 333 aa  50.4  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.094979  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1805  amino acid adenylation domain-containing protein  23.34 
 
 		 1413 aa  50.4  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.323791  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4650  male sterility domain protein  26.23 
 
 		 353 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458104  normal  0.580556 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05610  aminoadipate reductase large subunit (Eurofung)  28.03 
 
 		 1421 aa  50.1  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0476531 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1750  Male sterility domain protein  26.91 
 
 		 642 aa  50.1  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3494  short chain dehydrogenase  26.57 
 
 		 664 aa  50.1  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.447449 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.37 
 
 		 320 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0253949  normal  0.427643 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4023  short chain dehydrogenase  26.21 
 
 		 671 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.367232  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 361 aa  49.3  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3031  O-antigen biosynthetic gene WbjF  25.69 
 
 		 320 aa  48.5  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3526  short chain dehydrogenase  26.46 
 
 		 665 aa  48.5  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309759  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.09 
 
 		 336 aa  48.9  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111318  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23450  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  22.79 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292756  hitchhiker  0.00536132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2186  non-ribosomal peptide synthase MxaA  27.55 
 
 		 1436 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.39 
 
 		 354 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0848085  normal  0.577467 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4890  amino acid adenylation domain-containing protein  26.02 
 
 		 1500 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.365672 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2104  thioester reductase domain-containing protein  24.34 
 
 		 523 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.31 
 
 		 328 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26 
 
 		 331 aa  47.8  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.37 
 
 		 328 aa  47.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  24.5 
 
 		 1067 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4896  short chain dehydrogenase  25.95 
 
 		 671 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0501144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  24.91 
 
 		 2113 aa  47.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  29.38 
 
 		 340 aa  47.8  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2522  Male sterility domain protein  28.65 
 
 		 410 aa  47.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3229  Male sterility-like  36.11 
 
 		 351 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  27.45 
 
 		 329 aa  47  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2578  thioester reductase domain-containing protein  27.74 
 
 		 1162 aa  47  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615079 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08105  NRPS-like enzyme, putative (JCVI)  20.4 
 
 		 1077 aa  46.6  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.250944 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.2 
 
 		 355 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129655 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.08 
 
 		 330 aa  46.6  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2555  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.6 
 
 		 336 aa  46.6  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1803  UDP-sugar epimerase  28.43 
 
 		 323 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.198516  normal  0.133544 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10861  hypothetical protein  24.32 
 
 		 2199 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>