More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_23210 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 		 226 aa  457  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  97.31 
 
 		 223 aa  441  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  73.99 
 
 		 223 aa  344  7e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1741  phosphoglycolate phosphatase  73.54 
 
 		 223 aa  340  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1371  phosphoglycolate phosphatase  73.09 
 
 		 223 aa  338  5e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3651  phosphoglycolate phosphatase  73.54 
 
 		 223 aa  337  9e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  72.2 
 
 		 223 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  71.75 
 
 		 223 aa  332  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3950  phosphoglycolate phosphatase  71.75 
 
 		 223 aa  332  3e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00428214  normal  0.0156244 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  72.65 
 
 		 223 aa  330  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4082  phosphoglycolate phosphatase  71.3 
 
 		 223 aa  327  7e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867536  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  46.23 
 
 		 221 aa  196  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  45.33 
 
 		 221 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  42.4 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2829  phosphoglycolate phosphatase  41.01 
 
 		 221 aa  185  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0461088  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0490  phosphoglycolate phosphatase  41.1 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155705  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0909  phosphoglycolate phosphatase  42.47 
 
 		 222 aa  182  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  42.52 
 
 		 226 aa  178  4.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2118  HAD family hydrolase  43.86 
 
 		 235 aa  177  8e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0956  phosphoglycolate phosphatase  40.83 
 
 		 222 aa  177  9e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4716  phosphoglycolate phosphatase  39.63 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92014 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1623  phosphoglycolate phosphatase  41.44 
 
 		 222 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2151  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  40.28 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  42.92 
 
 		 237 aa  176  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1573  phosphoglycolate phosphatase  42.58 
 
 		 229 aa  175  5e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  43.13 
 
 		 250 aa  175  5e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  42.45 
 
 		 237 aa  175  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0131  HAD family hydrolase  42.6 
 
 		 236 aa  174  9e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  42.11 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0122  haloacid dehalogenase-like hydrolase  42.6 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.817509  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0897  hydrolase protein  41.59 
 
 		 229 aa  171  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00554563  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0767  phosphoglycolate phosphatase  42.99 
 
 		 229 aa  171  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.54601  hitchhiker  0.00790762 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2787  phosphoglycolate phosphatase  39.91 
 
 		 221 aa  170  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00496025  hitchhiker  0.0014162 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2185  phosphoglycolate phosphatase  39.72 
 
 		 215 aa  170  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279465  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1226  phosphoglycolate phosphatase  42.06 
 
 		 222 aa  169  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000334097  normal  0.244171 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1575  phosphoglycolate phosphatase  41.55 
 
 		 229 aa  168  6e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.099799  unclonable  0.000000163733 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0838  phosphoglycolate phosphatase  41.59 
 
 		 228 aa  168  8e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.681144  normal  0.099255 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  38.14 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1500  phosphoglycolate phosphatase  41.83 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0783789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1823  phosphoglycolate phosphatase  41.83 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  38.14 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1399  phosphoglycolate phosphatase  39.25 
 
 		 225 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1798  phosphoglycolate phosphatase  39.53 
 
 		 221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0263592  unclonable  0.00000282508 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2461  phosphoglycolate phosphatase  38.32 
 
 		 225 aa  164  8e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.768725 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2235  phosphoglycolate phosphatase 2  40 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0682937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3277  phosphoglycolate phosphatase  38.99 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0806752  normal  0.284074 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1529  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  40.38 
 
 		 234 aa  158  6e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0735  phosphoglycolate phosphatase  38.5 
 
 		 237 aa  157  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.442963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3116  phosphoglycolate phosphatase  37.21 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0121451 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2739  phosphoglycolate phosphatase  44.39 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0917  phosphoglycolate phosphatase  39.91 
 
 		 238 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0326596 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0996  phosphoglycolate phosphatase  40.37 
 
 		 237 aa  154  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  40 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0913  phosphoglycolate phosphatase  39.45 
 
 		 238 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1037  phosphoglycolate phosphatase  39.91 
 
 		 237 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0558  phosphoglycolate phosphatase  39.91 
 
 		 237 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4150  2-phosphoglycolate phosphatase  38.99 
 
 		 238 aa  151  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0576  phosphoglycolate phosphatase  40.74 
 
 		 230 aa  149  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.475969  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1189  HAD family hydrolase  38.01 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2955  phosphoglycolate phosphatase  39.91 
 
 		 241 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3004  phosphoglycolate phosphatase  39.91 
 
 		 241 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1629  phosphoglycolate phosphatase  40.38 
 
 		 241 aa  148  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2893  phosphoglycolate phosphatase  39.91 
 
 		 241 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0438  phosphoglycolate phosphatase  39.91 
 
 		 241 aa  148  9e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2583  phosphoglycolate phosphatase  39.91 
 
 		 241 aa  148  9e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0957  phosphoglycolate phosphatase  39.91 
 
 		 241 aa  148  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.753227  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0190  phosphoglycolate phosphatase  39.91 
 
 		 241 aa  148  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1857  phosphoglycolate phosphatase  39.91 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2472  phosphoglycolate phosphatase  35.24 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2267  phosphoglycolate phosphatase  40.85 
 
 		 238 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.428353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1950  HAD family hydrolase  35.19 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0253028  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1348  phosphoglycolate phosphatase  35.98 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  40.81 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1947  HAD family hydrolase  34.72 
 
 		 239 aa  137  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1729  phosphoglycolate phosphatase  37.44 
 
 		 213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.970974  hitchhiker  0.00217318 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2304  HAD family hydrolase  34.42 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.652895  hitchhiker  0.000448515 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2065  HAD family hydrolase  33.8 
 
 		 227 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0943577  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  37.82 
 
 		 229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  36.99 
 
 		 226 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  35.86 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  36.56 
 
 		 227 aa  126  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2132  HAD family hydrolase  33.18 
 
 		 220 aa  125  5e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2305  HAD family hydrolase  31.25 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000065885 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  38.5 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  32 
 
 		 272 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  32 
 
 		 272 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2072  HAD family hydrolase  34.15 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000098787  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  38.14 
 
 		 233 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2060  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 223 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00381556  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2056  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 		 223 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0324232  unclonable  0.00000000000163854 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2406  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0211635  unclonable  0.0000117739 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1917  HAD family hydrolase  32.89 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0123365  hitchhiker  0.0000000762533 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  35.43 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  35.4 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  33.66 
 
 		 231 aa  120  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2061  HAD family hydrolase  32.89 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0183643  unclonable  0.0000224709 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  32.43 
 
 		 227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0877  phosphoglycolate phosphatase  34.12 
 
 		 227 aa  119  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.0645651 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 235 aa  118  9e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  34.47 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>