282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_05221 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_05221  NAD binding site  100 
 
 		 375 aa  761    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07601  NAD binding site  65.6 
 
 		 375 aa  511  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  60.53 
 
 		 376 aa  481  1e-135  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0709  geranylgeranyl reductase  62.1 
 
 		 377 aa  479  1e-134  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  60 
 
 		 376 aa  470  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1650  geranylgeranyl reductase  61.76 
 
 		 381 aa  451  1e-125  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  48.79 
 
 		 377 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  50 
 
 		 377 aa  381  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0520  NAD binding site  49.19 
 
 		 377 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  47.57 
 
 		 377 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  40.38 
 
 		 376 aa  285  7e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  38.65 
 
 		 373 aa  273  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0064  geranylgeranyl reductase  36.76 
 
 		 373 aa  265  8e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.535363  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  36.96 
 
 		 368 aa  258  2e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2299  geranylgeranyl reductase  35.97 
 
 		 374 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.650791  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  34.06 
 
 		 370 aa  244  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  31.25 
 
 		 376 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  26.13 
 
 		 378 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  28.79 
 
 		 375 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  26.29 
 
 		 362 aa  107  5e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  28.41 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  27.15 
 
 		 387 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  28.77 
 
 		 393 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  27.02 
 
 		 368 aa  97.8  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  26.82 
 
 		 379 aa  96.7  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  27.99 
 
 		 393 aa  95.9  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 382 aa  94.4  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  24.35 
 
 		 385 aa  92.8  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  23.9 
 
 		 382 aa  90.1  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1330  geranylgeranyl reductase  27.03 
 
 		 376 aa  89.4  9e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1604  geranylgeranyl reductase  25.89 
 
 		 391 aa  87.4  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0162  geranylgeranyl reductase  25.53 
 
 		 392 aa  86.7  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.555099  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  25.84 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  25.39 
 
 		 384 aa  82.8  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  25.97 
 
 		 413 aa  82.8  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  23.95 
 
 		 403 aa  81.6  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  27.2 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  27.37 
 
 		 393 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  27.37 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  27.37 
 
 		 393 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  23.88 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  26.49 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  26.71 
 
 		 400 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  27.84 
 
 		 431 aa  79  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  25.76 
 
 		 367 aa  79.3  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  25.3 
 
 		 424 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  26.01 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  24.32 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 		 421 aa  77.4  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  26.38 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  25.58 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  24.52 
 
 		 434 aa  77  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3481  geranylgeranyl reductase  25.41 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  25.95 
 
 		 434 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  24.72 
 
 		 425 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  25.38 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  25.12 
 
 		 430 aa  74.3  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  23.96 
 
 		 379 aa  72.8  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  25.45 
 
 		 395 aa  72.8  0.000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  24.7 
 
 		 435 aa  72.8  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1820  hypothetical protein  26.45 
 
 		 428 aa  72.8  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  24.74 
 
 		 394 aa  72.8  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  24.74 
 
 		 394 aa  72.8  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1992  hypothetical protein  26.45 
 
 		 428 aa  72.8  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.594962  normal  0.0242177 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2391  geranylgeranyl reductase  24.06 
 
 		 375 aa  72.8  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1464  hypothetical protein  26.45 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.682941  normal  0.67626 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  31.76 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  24.04 
 
 		 411 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1482  hypothetical protein  26.45 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839158  normal  0.0909638 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  26.52 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  25.88 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  26.58 
 
 		 394 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  21.65 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1355  geranylgeranyl reductase  25.68 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0520333 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1448  hypothetical protein  26.45 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  24.46 
 
 		 423 aa  69.7  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4604  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  27.41 
 
 		 432 aa  69.7  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  28.25 
 
 		 449 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  27.02 
 
 		 341 aa  68.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  27.72 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  24.41 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  25.6 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  25.55 
 
 		 418 aa  68.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  25.3 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  25.24 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2189  geranylgeranyl reductase  25.89 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  29.18 
 
 		 407 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0431  hypothetical protein  24.2 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.446535  normal  0.169558 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  25.35 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  24.51 
 
 		 440 aa  67  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  30.47 
 
 		 418 aa  67  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  24.21 
 
 		 403 aa  67  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  26.11 
 
 		 398 aa  67  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2674  FAD dependent oxidoreductase  33.92 
 
 		 443 aa  67  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.680206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  29.32 
 
 		 405 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09250  flavin-dependent dehydrogenase  25.63 
 
 		 442 aa  66.6  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.696714 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  25.62 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  25.73 
 
 		 398 aa  66.2  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1739  geranylgeranyl reductase  25.27 
 
 		 358 aa  65.9  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539865  normal  0.0147858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>