81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3931 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3931  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  441  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0225  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  45.9 
 
 		 209 aa  148  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1526  hypothetical protein  40.12 
 
 		 201 aa  131  9e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2415  hypothetical protein  39.02 
 
 		 499 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00358029  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3000  hypothetical protein  42.24 
 
 		 218 aa  125  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000963462 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1592  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  39.52 
 
 		 205 aa  121  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1241  hypothetical protein  34.25 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1466  hypothetical protein  38.31 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4143  hypothetical protein  39.35 
 
 		 194 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4184  hypothetical protein  37.95 
 
 		 173 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35994  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5952  hypothetical protein  36.84 
 
 		 175 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6890  hypothetical protein  33.33 
 
 		 172 aa  102  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4431  hypothetical protein  35.76 
 
 		 195 aa  99.8  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5821  hypothetical protein  37.91 
 
 		 194 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.272849  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3383  hypothetical protein  33.73 
 
 		 205 aa  95.9  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.636587  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0799  hypothetical protein  37.13 
 
 		 190 aa  95.9  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0847  hypothetical protein  37.13 
 
 		 190 aa  95.9  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0851  hypothetical protein  37.13 
 
 		 190 aa  95.5  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0219  hypothetical protein  35.76 
 
 		 175 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0021  hypothetical protein  35.54 
 
 		 175 aa  94  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0163  hypothetical protein  35.15 
 
 		 175 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143101  normal  0.013868 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3985  hypothetical protein  31.92 
 
 		 477 aa  91.7  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392216  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6226  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  89  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.185967  normal  0.0332919 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0844  hypothetical protein  37.91 
 
 		 190 aa  85.1  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3473  cytochrome c family protein  42.39 
 
 		 207 aa  84.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349058  normal  0.204914 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0292  hypothetical protein  33.79 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0554303  hitchhiker  0.00107443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5668  cytochrome c class I  29.61 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2710  hypothetical protein  33.77 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1638  hypothetical protein  31.65 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0654191  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0832  hypothetical protein  34 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857853 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1041  hypothetical protein  33 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24091  normal  0.0488069 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1422  hypothetical protein  29.13 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000667886  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2209  hypothetical protein  32.8 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0120932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0525  cytochrome c class I  29.3 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01295  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2773  hypothetical protein  31.82 
 
 		 151 aa  57.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000119865  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2443  cytochrome c class I  29.89 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0759  cytochrome c, class I  34.94 
 
 		 100 aa  51.6  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.940622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1874  cytochrome c class I  27.84 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3999  hypothetical protein  30 
 
 		 138 aa  49.3  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2222  cytochrome c, class I  31.73 
 
 		 395 aa  49.3  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000427443  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  36.46 
 
 		 151 aa  48.9  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  36.25 
 
 		 637 aa  48.9  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  36.78 
 
 		 657 aa  47  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  32.56 
 
 		 394 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3891  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 113 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0499798 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3841  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 113 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3675  cytochrome c, class I  31.03 
 
 		 393 aa  45.4  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0456  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.33 
 
 		 312 aa  45.4  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.844005  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5620  cytochrome c, mono-and diheme variant-like protein  29 
 
 		 398 aa  45.1  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  31.76 
 
 		 101 aa  45.1  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  28.26 
 
 		 546 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10680  cytochrome c, mono- and diheme variants family  28.92 
 
 		 275 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0523281  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  27.27 
 
 		 702 aa  43.5  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3866  cytochrome c class I  30.85 
 
 		 388 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2009  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.44 
 
 		 322 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0902386  hitchhiker  0.0000000272898 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1966  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.44 
 
 		 322 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00926304  hitchhiker  0.00889683 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2110  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.44 
 
 		 322 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0408813  normal  0.504179 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3341  cytochrome c class I  27.06 
 
 		 295 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4148  cytochrome c, class I  31 
 
 		 393 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782083  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  27.27 
 
 		 702 aa  43.5  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1760  hypothetical protein  31.4 
 
 		 394 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200685 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  36.27 
 
 		 645 aa  43.1  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4115  hypothetical protein  30.23 
 
 		 394 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675645  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4251  hypothetical protein  30.23 
 
 		 394 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.11 
 
 		 308 aa  42.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.240618 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2217  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  35.63 
 
 		 322 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106993  normal  0.268308 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2167  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  35.63 
 
 		 322 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0435  hypothetical protein  27.27 
 
 		 314 aa  42.4  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2217  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  35.63 
 
 		 322 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000127298  normal  0.441817 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4490  hypothetical protein  35.63 
 
 		 322 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1956  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.33 
 
 		 322 aa  42.4  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2204  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  35.63 
 
 		 322 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000397613  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4456  cytochrome c class I  30.3 
 
 		 388 aa  42.4  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103229  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2955  cytochrome c, class I  28.05 
 
 		 278 aa  42  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4590  cytochrome c class I  30.3 
 
 		 388 aa  42.4  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2776  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.52 
 
 		 310 aa  42  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000169467 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2959  cytochrome c class I  33.64 
 
 		 571 aa  42  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4339  cytochrome c, class I  29.55 
 
 		 393 aa  42  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3249  cytochrome c class I  25.81 
 
 		 255 aa  42  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00726195  hitchhiker  0.0000284914 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0634  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.58 
 
 		 304 aa  41.6  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>