231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3736 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3736  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  441  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  48.33 
 
 
338 aa  59.3  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  45.9 
 
 
323 aa  58.5  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  47.46 
 
 
129 aa  56.2  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0788  fimbrial protein pilin  41.67 
 
 
163 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3549  type 4 prepilin-like protein  43.84 
 
 
177 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2564  hypothetical protein  43.84 
 
 
177 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569226 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0406  hypothetical protein  44.07 
 
 
352 aa  55.1  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5269  general secretory pathway protein  36.25 
 
 
192 aa  55.1  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2840  protein of unknown function DUF1559  36.36 
 
 
348 aa  55.1  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0033  protein of unknown function DUF1559  43.33 
 
 
323 aa  55.1  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4074  protein of unknown function DUF1559  43.33 
 
 
321 aa  54.3  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2091  general secretion pathway protein G  41.54 
 
 
152 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0177627  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  37.14 
 
 
133 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  34.29 
 
 
155 aa  52.8  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  42.03 
 
 
146 aa  52.4  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02970  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  45 
 
 
144 aa  52  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455058  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.67 
 
 
167 aa  52  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3110  protein of unknown function DUF1559  39.39 
 
 
353 aa  51.6  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  40.62 
 
 
149 aa  51.6  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  39.34 
 
 
349 aa  51.2  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  38.24 
 
 
133 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  41.18 
 
 
326 aa  50.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  37.7 
 
 
140 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  26.87 
 
 
144 aa  50.8  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  43.66 
 
 
165 aa  50.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3197  protein of unknown function DUF1559  35.29 
 
 
326 aa  50.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  41.67 
 
 
138 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1116  general secretion pathway protein G  36.36 
 
 
143 aa  49.7  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  40 
 
 
325 aa  50.1  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00346  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  41.94 
 
 
144 aa  50.1  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.887338  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  40.28 
 
 
158 aa  50.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  35.29 
 
 
152 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1361  protein of unknown function DUF1559  40.68 
 
 
324 aa  50.1  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  40.68 
 
 
330 aa  49.7  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  31.34 
 
 
151 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  31.34 
 
 
151 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  34.33 
 
 
154 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  40.85 
 
 
147 aa  49.3  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  35.38 
 
 
154 aa  49.7  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  31.34 
 
 
151 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  24.07 
 
 
150 aa  49.7  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  31.34 
 
 
151 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  31.34 
 
 
151 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2613  putative general secretion pathway protein G precursor (PilD-dependent protein pddA)  37.29 
 
 
163 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1278  general secretion pathway protein G  32.84 
 
 
147 aa  48.9  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0764  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 
139 aa  48.9  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.546085  normal  0.0744092 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
150 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
150 aa  48.5  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3525  hypothetical protein  42.37 
 
 
162 aa  48.9  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00449865  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  31.15 
 
 
145 aa  48.5  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
150 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
150 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  38.03 
 
 
150 aa  48.9  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
150 aa  48.5  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  31.15 
 
 
145 aa  48.5  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  35.38 
 
 
156 aa  48.9  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  31.15 
 
 
145 aa  48.5  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  31.34 
 
 
151 aa  48.5  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
150 aa  48.5  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
150 aa  48.5  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  40.68 
 
 
313 aa  48.5  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  24.24 
 
 
138 aa  48.1  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  38.89 
 
 
144 aa  48.1  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2781  general secretion pathway protein G  35.59 
 
 
150 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0224  general secretion pathway protein G  35.59 
 
 
150 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  40 
 
 
172 aa  48.1  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0011  general secretion pathway protein G  35.59 
 
 
150 aa  48.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3577  ATPase  31.67 
 
 
146 aa  48.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.44565 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  33.9 
 
 
154 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0739  general secretion pathway protein G  33.87 
 
 
164 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430586  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0605  general secretion pathway protein G  31.82 
 
 
147 aa  47.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000021872 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1480  protein of unknown function DUF1559  38.46 
 
 
362 aa  47.8  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0592  general secretion pathway protein G  31.82 
 
 
147 aa  47.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.11 
 
 
157 aa  47.8  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4158  general secretion pathway protein G  38.81 
 
 
151 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000753103 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1301  general secretion pathway protein G  40 
 
 
146 aa  48.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.010915 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3514  general secretion pathway protein G  35.59 
 
 
150 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1886  general secretion pathway protein G  35.59 
 
 
150 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.354233  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0012  general secretion pathway protein G  35.59 
 
 
150 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0012  general secretion pathway protein G  35.59 
 
 
150 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127302  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2666  general secretion pathway protein G  35.59 
 
 
150 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.07 
 
 
167 aa  47.8  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1024  hypothetical protein  28.81 
 
 
162 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  34.85 
 
 
149 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1280  general secretion pathway protein G  34.38 
 
 
158 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  38.1 
 
 
148 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  31.82 
 
 
163 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  36.07 
 
 
159 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  32.2 
 
 
158 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  34.33 
 
 
135 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  38.33 
 
 
153 aa  47  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  44.12 
 
 
158 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  38.33 
 
 
70 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  37.5 
 
 
135 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4248  general secretion pathway protein G  28.57 
 
 
148 aa  47.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0347967 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0102  general secretion pathway protein G  36.11 
 
 
149 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.0126574 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0809  hypothetical protein  36.62 
 
 
259 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 
159 aa  47.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 
159 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>