53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1824 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1824  WD40 domain-containing protein  100 
 
 		 309 aa  624  1e-178  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.687468  normal  0.378526 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2087  hypothetical protein  31.15 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1845  WD40 domain-containing protein  37.89 
 
 		 789 aa  127  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.418755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1770  WD40 domain protein beta Propeller  30.17 
 
 		 316 aa  121  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4002  hypothetical protein  31.37 
 
 		 285 aa  115  7.999999999999999e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0438  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  31.41 
 
 		 294 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000271356  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4395  hypothetical protein  29.55 
 
 		 300 aa  112  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.198402  normal  0.0643344 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1660  hypothetical protein  29.19 
 
 		 288 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.515318  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4001  hypothetical protein  27.87 
 
 		 299 aa  102  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0439  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  29.17 
 
 		 306 aa  102  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00226891  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  32.43 
 
 		 631 aa  72.4  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  28.98 
 
 		 673 aa  69.3  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  28.82 
 
 		 656 aa  69.3  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  44.55 
 
 		 776 aa  67.4  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1823  hypothetical protein  29.17 
 
 		 761 aa  66.2  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  28.57 
 
 		 525 aa  65.9  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  28.36 
 
 		 537 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  33.53 
 
 		 630 aa  63.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  25.32 
 
 		 509 aa  63.9  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  28.04 
 
 		 704 aa  62.8  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  33.52 
 
 		 658 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  31.78 
 
 		 656 aa  60.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  33.94 
 
 		 519 aa  60.5  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  25.64 
 
 		 670 aa  57.4  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  28.57 
 
 		 673 aa  57.4  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  26.67 
 
 		 638 aa  55.8  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  28.07 
 
 		 620 aa  55.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  32.67 
 
 		 510 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  34.95 
 
 		 640 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  26.52 
 
 		 631 aa  54.7  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  31.75 
 
 		 798 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  30 
 
 		 641 aa  53.9  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  34.85 
 
 		 669 aa  53.1  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  26.04 
 
 		 648 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  30.4 
 
 		 653 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  38.98 
 
 		 694 aa  51.2  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0562  WD40 domain-containing protein  34.31 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  26.41 
 
 		 643 aa  50.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  28.19 
 
 		 626 aa  50.4  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  28.8 
 
 		 712 aa  50.1  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  32.99 
 
 		 903 aa  49.7  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  26.28 
 
 		 660 aa  49.7  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  32.22 
 
 		 665 aa  48.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2084  WD40 domain protein beta Propeller  29.79 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243995 
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  33.75 
 
 		 672 aa  47.8  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1454  outer membrane protein  31.51 
 
 		 504 aa  47.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.298256  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  32.69 
 
 		 648 aa  46.6  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  23.58 
 
 		 757 aa  46.2  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  31.78 
 
 		 813 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  30.3 
 
 		 517 aa  42.7  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  33.8 
 
 		 668 aa  42.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  22.77 
 
 		 710 aa  42.4  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2183  OmpA/MotB domain protein  35.9 
 
 		 778 aa  42.4  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480779  normal  0.0613811 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>