More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1156 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1156  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 510 aa  1032    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1237  excinuclease ABC C subunit domain protein  40.97 
 
 		 498 aa  338  1.9999999999999998e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.173931  normal  0.435946 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4113  excinuclease ABC C subunit domain protein  41.16 
 
 		 465 aa  290  3e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1011  excinuclease ABC, C subunit  35.74 
 
 		 479 aa  248  2e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0197  excinuclease ABC subunit C  36.7 
 
 		 437 aa  218  2e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  46.75 
 
 		 607 aa  203  6e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5613  excinuclease ABC, C subunit  42.21 
 
 		 663 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143768  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  47.16 
 
 		 616 aa  187  4e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  41.47 
 
 		 656 aa  186  7e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  48.04 
 
 		 627 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  44.74 
 
 		 607 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  42.6 
 
 		 666 aa  184  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07090  excinuclease ABC, C subunit  48.05 
 
 		 682 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.914637 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  43.62 
 
 		 624 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  44.74 
 
 		 607 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  46.15 
 
 		 629 aa  183  6e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  46.12 
 
 		 619 aa  183  7e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  46.43 
 
 		 644 aa  182  1e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  42.22 
 
 		 628 aa  181  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  44.64 
 
 		 631 aa  182  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  46.51 
 
 		 628 aa  181  4e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0024  excinuclease ABC subunit C  45.92 
 
 		 596 aa  180  4e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2059  excinuclease ABC subunit C  43.66 
 
 		 692 aa  180  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  44.84 
 
 		 607 aa  180  7e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1784  excinuclease ABC, C subunit  44.77 
 
 		 737 aa  179  9e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2038  excinuclease ABC subunit C  43.48 
 
 		 603 aa  179  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1854  excinuclease ABC subunit C  43.54 
 
 		 574 aa  178  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.971322  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1279  excinuclease ABC subunit C  39.74 
 
 		 707 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0496012  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2194  excinuclease ABC, C subunit  43.08 
 
 		 684 aa  178  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010209  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10610  excinuclease ABC, C subunit  45.49 
 
 		 666 aa  178  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  37.54 
 
 		 588 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  39.29 
 
 		 708 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2042  excinuclease ABC, C subunit  37.8 
 
 		 690 aa  177  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  41.56 
 
 		 622 aa  176  7e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  42.26 
 
 		 625 aa  176  7e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5031  excinuclease ABC, C subunit  43.58 
 
 		 603 aa  176  8e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  44.93 
 
 		 617 aa  176  9e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  44.93 
 
 		 617 aa  176  9e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0044  excinuclease ABC, C subunit  42.31 
 
 		 613 aa  175  9.999999999999999e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.101531  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2678  excinuclease ABC subunit C  39.73 
 
 		 707 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1283  excinuclease ABC subunit C  44.88 
 
 		 596 aa  174  2.9999999999999996e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1823  excinuclease ABC subunit C  36.28 
 
 		 674 aa  174  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000135046 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2175  excinuclease ABC, C subunit  39.17 
 
 		 693 aa  174  5e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2582  excinuclease ABC subunit C  39.39 
 
 		 707 aa  172  9e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0298778  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  40.08 
 
 		 591 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  42.73 
 
 		 627 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  40.41 
 
 		 613 aa  172  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  42.41 
 
 		 599 aa  172  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3221  excinuclease ABC, C subunit  46.94 
 
 		 602 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.0605848 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  40.77 
 
 		 610 aa  172  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  50.23 
 
 		 615 aa  170  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  38.46 
 
 		 615 aa  170  5e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  41.31 
 
 		 653 aa  170  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2478  excinuclease ABC, C subunit  44.39 
 
 		 652 aa  170  6e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.446818  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  40.16 
 
 		 624 aa  170  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  45.81 
 
 		 611 aa  168  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  40 
 
 		 658 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  37.14 
 
 		 625 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  40.89 
 
 		 608 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1544  excinuclease ABC, C subunit  40.13 
 
 		 659 aa  167  5e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  41.89 
 
 		 613 aa  167  5e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3014  excinuclease ABC, C subunit  38.98 
 
 		 675 aa  167  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1093  excinuclease ABC subunit C  52.15 
 
 		 517 aa  166  8e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  40.44 
 
 		 608 aa  166  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  40.32 
 
 		 614 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1252  excinuclease ABC, C subunit  37.74 
 
 		 647 aa  166  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1271  excinuclease ABC subunit C  40.69 
 
 		 606 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09641  excinuclease ABC subunit C  38.89 
 
 		 644 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0175  excinuclease ABC, subunit C  42.64 
 
 		 596 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  44.39 
 
 		 613 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1945  excinuclease ABC subunit C  42.13 
 
 		 643 aa  165  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.892148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11300  excinuclease ABC subunit C  38.67 
 
 		 643 aa  165  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222126  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  34.67 
 
 		 604 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  41.13 
 
 		 638 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  44.02 
 
 		 591 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2395  excinuclease ABC subunit C  39.06 
 
 		 676 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15160  Excinuclease ABC subunit C  40.86 
 
 		 650 aa  164  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2442  excinuclease ABC subunit C  39.06 
 
 		 676 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2436  excinuclease ABC subunit C  40.41 
 
 		 676 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1993  excinuclease ABC subunit C  43.65 
 
 		 599 aa  164  4.0000000000000004e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  43.91 
 
 		 604 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  44.93 
 
 		 593 aa  164  5.0000000000000005e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1145  excinuclease ABC, C subunit  43.33 
 
 		 594 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  40.96 
 
 		 641 aa  164  5.0000000000000005e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  41.74 
 
 		 594 aa  163  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  41.74 
 
 		 594 aa  163  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  41.74 
 
 		 594 aa  163  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  39.2 
 
 		 612 aa  163  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  41.74 
 
 		 594 aa  163  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  41.74 
 
 		 594 aa  163  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04670  excinuclease ABC, C subunit  43.37 
 
 		 598 aa  163  7e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2896  excinuclease ABC subunit C  41.41 
 
 		 607 aa  162  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189646  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0701  excinuclease ABC subunit C  39.48 
 
 		 598 aa  162  9e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1749  excinuclease ABC subunit C  51.95 
 
 		 527 aa  162  9e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0671774  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3023  excinuclease ABC, C subunit  41.67 
 
 		 607 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623507  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  39.6 
 
 		 601 aa  162  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2082  excinuclease ABC subunit C  36.6 
 
 		 669 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649427  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2488  excinuclease ABC subunit C  37.72 
 
 		 716 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.820608  normal  0.0424579 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2397  excinuclease ABC subunit C  41.56 
 
 		 598 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.866418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6042  excinuclease ABC, C subunit  42.74 
 
 		 649 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>