More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1285 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 226 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  94.69 
 
 		 228 aa  421  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  94.25 
 
 		 228 aa  420  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 232 aa  125  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 256 aa  123  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 262 aa  119  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  40.51 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  37.07 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 238 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 238 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 238 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 238 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 234 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  32.81 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  35.65 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 229 aa  112  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  36.41 
 
 		 232 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  35.65 
 
 		 240 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  36.1 
 
 		 258 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 255 aa  112  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  35.94 
 
 		 239 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 235 aa  112  7.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  36.59 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1121  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 234 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 225 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 223 aa  108  7.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  39.06 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 218 aa  106  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  36.08 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  36.74 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 214 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 232 aa  105  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 233 aa  105  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 241 aa  104  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  30.62 
 
 		 227 aa  104  9e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  32.29 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0794  transcriptional regulator, GntR family  34.6 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 233 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0649  GntR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.875188  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 224 aa  102  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 233 aa  102  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  32.82 
 
 		 220 aa  102  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0841  transcriptional regulator, GntR family  34.12 
 
 		 231 aa  102  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 231 aa  102  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  101  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 230 aa  101  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1569  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 217 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2823  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.346929  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 214 aa  99.8  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 225 aa  99.8  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 229 aa  99.4  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 251 aa  99  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 230 aa  98.6  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  32.68 
 
 		 226 aa  98.6  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0926  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 229 aa  98.6  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  30.73 
 
 		 214 aa  98.2  8e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003387  propionate catabolism operon transcriptional regulator of GntR family  32.23 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02398  hypothetical protein  31.28 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 232 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  34.55 
 
 		 233 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 235 aa  96.7  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 265 aa  97.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0200  transcriptional regulator, GntR family  34.16 
 
 		 246 aa  97.1  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4322  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 252 aa  96.3  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 228 aa  96.3  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 226 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 246 aa  95.9  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 235 aa  96.3  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 227 aa  96.3  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 253 aa  95.5  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 227 aa  95.5  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1418  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 222 aa  95.5  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  36.62 
 
 		 233 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  38.42 
 
 		 215 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 211 aa  95.1  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 235 aa  95.1  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  30.15 
 
 		 226 aa  95.1  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 214 aa  94.7  9e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  36 
 
 		 223 aa  94.7  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>