More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_26758 on replicon NC_009366
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009366  OSTLU_26758  predicted protein  100 
 
 
630 aa  1305    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0405652 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17720  precursor of ligase long chain acyl-coa ligase  40.66 
 
 
678 aa  459  9.999999999999999e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08280  AMP-binding enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04270)  36.36 
 
 
708 aa  410  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89450  long-chain-fatty-acid CoA ligase  33.28 
 
 
720 aa  327  4.0000000000000003e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.67886  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00660  long-chain-fatty-acid-CoA ligase, putative  34.38 
 
 
727 aa  326  6e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.665335  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06014  fatty acid activator Faa4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09910)  30.91 
 
 
698 aa  323  4e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.547026 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58181  long-chain fatty acid CoA ligase  32.58 
 
 
753 aa  322  1.9999999999999998e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35069  long-chain fatty acid CoA ligase  32.4 
 
 
718 aa  315  1.9999999999999998e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.193785  normal  0.930837 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24496  predicted protein  32.42 
 
 
667 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65071  long-chain fatty acid--CoA ligase and synthetase 4  31.64 
 
 
699 aa  302  9e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.418644  normal  0.491736 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  32.07 
 
 
594 aa  298  1e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00710  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase, putative  33.46 
 
 
706 aa  295  2e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  31.72 
 
 
610 aa  289  1e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.21 
 
 
610 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49655  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 2 (Long-chain acyl-CoA synthetase 2) (Fatty acid activator 2)  30.64 
 
 
751 aa  287  2.9999999999999996e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  31.24 
 
 
610 aa  286  9e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  30.98 
 
 
610 aa  283  5.000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  31.78 
 
 
603 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  31.22 
 
 
633 aa  283  9e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20143  long chain acyl-coa synthetase  29.39 
 
 
721 aa  283  1e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  34.04 
 
 
597 aa  281  3e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  30.49 
 
 
607 aa  279  1e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.88 
 
 
610 aa  278  3e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 
605 aa  277  4e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  31.65 
 
 
604 aa  277  5e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  31 
 
 
609 aa  276  8e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  31.17 
 
 
637 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.564435 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  30.71 
 
 
592 aa  274  3e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  31.55 
 
 
592 aa  274  4.0000000000000004e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  30.67 
 
 
630 aa  273  8.000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  32.09 
 
 
596 aa  272  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2236  AMP-dependent synthetase and ligase  30.97 
 
 
660 aa  270  7e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.83669 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  31.22 
 
 
602 aa  269  8.999999999999999e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  30.93 
 
 
592 aa  266  7e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55002  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.91 
 
 
752 aa  266  7e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538226  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0072  AMP-dependent synthetase and ligase  30.81 
 
 
597 aa  266  1e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  31.75 
 
 
620 aa  264  3e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0075  AMP-binding family protein  30.98 
 
 
568 aa  262  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  28.84 
 
 
663 aa  263  1e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  29.47 
 
 
590 aa  263  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3973  AMP-dependent synthetase and ligase  30.65 
 
 
597 aa  262  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  30.97 
 
 
598 aa  262  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0078  AMP-dependent synthetase and ligase  30.69 
 
 
597 aa  261  3e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  30.69 
 
 
597 aa  260  4e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0335816 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0076  AMP-dependent synthetase and ligase  30.69 
 
 
597 aa  260  7e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  30.03 
 
 
622 aa  259  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  31.33 
 
 
598 aa  259  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  29.83 
 
 
587 aa  258  2e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30 
 
 
602 aa  258  3e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4274  AMP-dependent synthetase and ligase  30.3 
 
 
601 aa  257  4e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  29.11 
 
 
649 aa  257  4e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  30.66 
 
 
612 aa  257  4e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.54 
 
 
601 aa  257  5e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  30.4 
 
 
590 aa  257  5e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3571  AMP-binding family protein  32.07 
 
 
597 aa  256  8e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0077  AMP-dependent synthetase and ligase  30.3 
 
 
601 aa  256  9e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0075  AMP-dependent synthetase and ligase  30.02 
 
 
601 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  30.59 
 
 
601 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  29.76 
 
 
603 aa  254  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  29.75 
 
 
603 aa  254  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  30.37 
 
 
652 aa  253  7e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  31.31 
 
 
606 aa  252  1e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  30.17 
 
 
612 aa  251  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  30.8 
 
 
598 aa  250  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2310  thioester reductase domain-containing protein  30.34 
 
 
1174 aa  250  6e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.992099 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0191  AMP-dependent synthetase and ligase  30.31 
 
 
605 aa  249  9e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353972  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3241  AMP-dependent synthetase and ligase  29.4 
 
 
599 aa  249  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00258779  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1523  AMP-dependent synthetase and ligase  29.91 
 
 
599 aa  249  1e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0747  AMP-dependent synthetase and ligase  29.02 
 
 
602 aa  248  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  30.42 
 
 
598 aa  248  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3402  AMP binding protein  29.38 
 
 
601 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3532  AMP-dependent synthetase and ligase  29.38 
 
 
601 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  31.01 
 
 
599 aa  248  3e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2750  putative AMP-binding enzyme  29.62 
 
 
611 aa  247  4e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  29.93 
 
 
602 aa  247  4.9999999999999997e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2933  AMP binding protein  29.21 
 
 
588 aa  247  6e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.617922  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  32.13 
 
 
599 aa  246  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  28.45 
 
 
601 aa  246  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1953  AMP-dependent synthetase and ligase  30.16 
 
 
613 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.163962 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  30.99 
 
 
602 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  31.99 
 
 
597 aa  245  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  31.26 
 
 
591 aa  244  3e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  31.79 
 
 
622 aa  244  3.9999999999999997e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4186  AMP-dependent synthetase and ligase  30.46 
 
 
598 aa  244  5e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  31.68 
 
 
596 aa  243  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  30.81 
 
 
633 aa  241  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  28.87 
 
 
592 aa  241  4e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  27.65 
 
 
601 aa  240  5e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  30.45 
 
 
610 aa  240  5.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2186  AMP-dependent synthetase and ligase  29.52 
 
 
669 aa  240  6.999999999999999e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2271  thioester reductase  29.53 
 
 
1174 aa  239  8e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2318  thioester reductase domain-containing protein  29.53 
 
 
1174 aa  239  8e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.662408 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0439  AMP-dependent synthetase and ligase  25.85 
 
 
638 aa  239  9e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12610  fatty-acid-CoA ligase fadD9  30.05 
 
 
1168 aa  239  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.945549  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  31.24 
 
 
602 aa  239  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  31.24 
 
 
601 aa  239  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1090  AMP-dependent synthetase and ligase  32.61 
 
 
555 aa  238  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  29.83 
 
 
616 aa  238  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  30.93 
 
 
603 aa  238  3e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526185  normal  0.152333 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  30.22 
 
 
599 aa  238  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>