More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0251 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0251  helicase  100 
 
 		 541 aa  1104    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  31.89 
 
 		 584 aa  214  2.9999999999999995e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  32.11 
 
 		 555 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  31.91 
 
 		 554 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  30.8 
 
 		 560 aa  210  7e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  32.04 
 
 		 572 aa  206  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  32.42 
 
 		 467 aa  204  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  30.7 
 
 		 560 aa  203  8e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  31.85 
 
 		 584 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  30.26 
 
 		 560 aa  201  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  30.04 
 
 		 560 aa  200  5e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  30.04 
 
 		 560 aa  200  7e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  30.04 
 
 		 560 aa  199  9e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  30.04 
 
 		 560 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  30.04 
 
 		 560 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  30.04 
 
 		 560 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  30.04 
 
 		 560 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  30.04 
 
 		 560 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  31.04 
 
 		 669 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0259  helicase domain-containing protein  30.88 
 
 		 578 aa  184  4.0000000000000006e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  27.99 
 
 		 932 aa  172  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  29.19 
 
 		 921 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  27.64 
 
 		 951 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52390  helicase, Snf2 family  26.93 
 
 		 929 aa  162  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3658  SNF2 family helicase  28.5 
 
 		 960 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.041395  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  27.27 
 
 		 947 aa  160  7e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  26.31 
 
 		 963 aa  158  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  29.87 
 
 		 916 aa  153  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  29.87 
 
 		 915 aa  153  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  27.77 
 
 		 1160 aa  152  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  29.87 
 
 		 915 aa  150  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  25.62 
 
 		 967 aa  147  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  27.84 
 
 		 964 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  29 
 
 		 941 aa  146  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  29 
 
 		 941 aa  146  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  27.24 
 
 		 877 aa  145  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  25.83 
 
 		 966 aa  145  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  27.44 
 
 		 942 aa  145  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  27.54 
 
 		 1170 aa  143  9e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  27.39 
 
 		 1169 aa  139  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  25.92 
 
 		 949 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3304  non-specific serine/threonine protein kinase  31.41 
 
 		 1002 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0728777  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3539  SNF2-related protein  28.19 
 
 		 872 aa  135  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  27.58 
 
 		 933 aa  134  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  27.02 
 
 		 1169 aa  133  9e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  27.5 
 
 		 1170 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  25.28 
 
 		 988 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  27.88 
 
 		 1057 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  25.5 
 
 		 1170 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  26.82 
 
 		 801 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  26.37 
 
 		 964 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  26.86 
 
 		 969 aa  130  6e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  27.54 
 
 		 805 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  26.71 
 
 		 1116 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  25 
 
 		 1167 aa  126  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  25.88 
 
 		 1172 aa  126  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  24.25 
 
 		 665 aa  126  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  26.48 
 
 		 1167 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  25.84 
 
 		 1068 aa  123  9e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  25.86 
 
 		 1068 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  25.93 
 
 		 1167 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  26.75 
 
 		 966 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  26.54 
 
 		 1031 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  26.67 
 
 		 1168 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  27.06 
 
 		 1072 aa  120  4.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  25.3 
 
 		 1185 aa  120  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.88 
 
 		 1069 aa  120  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  28.48 
 
 		 621 aa  117  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  24.19 
 
 		 1071 aa  117  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  26.46 
 
 		 918 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  27.45 
 
 		 1006 aa  116  8.999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  26.46 
 
 		 918 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  26.88 
 
 		 1045 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5808  helicase family protein  26.28 
 
 		 952 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4828  helicase family protein  26.28 
 
 		 952 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39168  predicted protein  27.37 
 
 		 522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1355  helicase domain-containing protein  26.26 
 
 		 954 aa  115  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  24.74 
 
 		 1160 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  26.29 
 
 		 1175 aa  115  3e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  26.09 
 
 		 919 aa  115  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  27.66 
 
 		 1181 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1618  Snf2 family protein  26.03 
 
 		 1032 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4894  helicase family protein  25.99 
 
 		 952 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  25.45 
 
 		 937 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3885  helicase domain-containing protein  26.28 
 
 		 952 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.929535  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  26.23 
 
 		 918 aa  114  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  26.23 
 
 		 918 aa  114  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  26.23 
 
 		 918 aa  114  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  25.69 
 
 		 969 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  27.1 
 
 		 1078 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  26.01 
 
 		 918 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  26.75 
 
 		 918 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  27.37 
 
 		 901 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  26.01 
 
 		 918 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  24.2 
 
 		 971 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  29.87 
 
 		 1354 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.78 
 
 		 1091 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  29.1 
 
 		 898 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  27.71 
 
 		 980 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  26 
 
 		 1049 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>