More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2702 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 254 aa  517  1e-146  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 272 aa  172  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  37.55 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  39.11 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  39.68 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  39.46 
 
 		 257 aa  166  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  39.73 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  39.73 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  38.49 
 
 		 280 aa  162  7e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  37.3 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  34.92 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  35.2 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 260 aa  160  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  37.95 
 
 		 260 aa  158  9e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  37.95 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  33.91 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  33.91 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  33.91 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  33.91 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  33.91 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  33.91 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  33.91 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  33.91 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  37.01 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  36.48 
 
 		 277 aa  152  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  36.28 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 261 aa  151  8.999999999999999e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  33.33 
 
 		 275 aa  149  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 284 aa  149  4e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  34.82 
 
 		 247 aa  148  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  33.04 
 
 		 274 aa  148  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  33.04 
 
 		 274 aa  148  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  33.04 
 
 		 274 aa  148  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  32.61 
 
 		 276 aa  148  9e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  33.04 
 
 		 274 aa  148  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  33.04 
 
 		 274 aa  148  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  36.14 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  33.05 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  37.33 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 273 aa  146  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  35.83 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  36.8 
 
 		 279 aa  145  6e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  35.48 
 
 		 252 aa  145  7.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  37.65 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  32.61 
 
 		 277 aa  143  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  32.48 
 
 		 276 aa  143  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  32.02 
 
 		 265 aa  143  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  32.2 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  37.44 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  31.86 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 259 aa  142  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  35.48 
 
 		 252 aa  142  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 258 aa  142  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  30.6 
 
 		 280 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  30.6 
 
 		 280 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  30.6 
 
 		 280 aa  142  5e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 283 aa  141  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  33.6 
 
 		 256 aa  142  8e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  33.6 
 
 		 256 aa  142  8e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  36.36 
 
 		 262 aa  141  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  33.6 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  33.6 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  36.44 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  31.85 
 
 		 253 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  32.9 
 
 		 255 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  33.6 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  33.6 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.129581 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00461  hypothetical protein  33.6 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0543  DNA-binding transcriptional repressor AllR  33.6 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0440  DNA-binding transcriptional repressor AllR  33.6 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0717823  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  36.36 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  35.68 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  30.31 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  34.07 
 
 		 290 aa  139  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  36.55 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  34.01 
 
 		 266 aa  135  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  34.01 
 
 		 266 aa  135  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 269 aa  135  9e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 282 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  33.06 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  33.04 
 
 		 279 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 284 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 280 aa  134  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  34.24 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  37.2 
 
 		 267 aa  133  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2873  transcriptional regulator, IclR family  30.65 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0130818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>