More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3480 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  100 
 
 		 471 aa  924    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  51.26 
 
 		 481 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7296  trigger factor  51.2 
 
 		 466 aa  447  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  53.36 
 
 		 481 aa  440  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1850  trigger factor  49.33 
 
 		 513 aa  427  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00394566  normal  0.0360337 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  49.42 
 
 		 483 aa  423  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  47.91 
 
 		 461 aa  422  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  48.18 
 
 		 507 aa  420  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  48.51 
 
 		 448 aa  415  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3500  trigger factor  48.97 
 
 		 465 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  48.62 
 
 		 468 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  49.31 
 
 		 463 aa  403  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  46.56 
 
 		 450 aa  402  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  47.92 
 
 		 454 aa  401  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1392  trigger factor  48.19 
 
 		 460 aa  399  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.323159  normal  0.446961 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12170  trigger factor  46.1 
 
 		 479 aa  397  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2478  trigger factor  47.94 
 
 		 463 aa  397  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.444634 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0736  trigger factor  46.21 
 
 		 449 aa  389  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.45082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3518  trigger factor  48.06 
 
 		 471 aa  388  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09080  trigger factor  47.17 
 
 		 452 aa  382  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.985719  normal  0.0224029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4041  trigger factor  46.26 
 
 		 473 aa  383  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.248232  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1576  trigger factor  43.74 
 
 		 491 aa  380  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2160  trigger factor  46.62 
 
 		 464 aa  381  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000432452 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  44.89 
 
 		 479 aa  376  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1118  trigger factor  46.92 
 
 		 449 aa  374  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2406  trigger factor  47.42 
 
 		 469 aa  369  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0022242  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  44.52 
 
 		 478 aa  362  8e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  44.52 
 
 		 478 aa  362  8e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  44.52 
 
 		 482 aa  362  1e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2599  trigger factor  45.26 
 
 		 470 aa  356  3.9999999999999996e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0954  trigger factor  45.7 
 
 		 455 aa  352  1e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.928041 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09870  trigger factor  44.39 
 
 		 454 aa  351  2e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.478528  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24390  trigger factor  45.8 
 
 		 469 aa  340  2e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12487  trigger factor  42.13 
 
 		 466 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1369  trigger factor  42.82 
 
 		 458 aa  327  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.684255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09520  trigger factor  42.44 
 
 		 519 aa  323  6e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.301416  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0689  trigger factor  43.02 
 
 		 459 aa  311  1e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000380818  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0882  trigger factor  41.94 
 
 		 449 aa  303  6.000000000000001e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  28.6 
 
 		 438 aa  225  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  34.35 
 
 		 446 aa  222  9e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  34.18 
 
 		 428 aa  223  9e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  30.5 
 
 		 435 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  31.07 
 
 		 429 aa  220  6e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  35.47 
 
 		 427 aa  218  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  35.36 
 
 		 428 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  35.2 
 
 		 425 aa  216  7e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  34.64 
 
 		 425 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  30.99 
 
 		 446 aa  210  4e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  34.36 
 
 		 425 aa  210  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  34.36 
 
 		 425 aa  210  5e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  34.36 
 
 		 425 aa  210  5e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  34.36 
 
 		 425 aa  210  5e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  34.36 
 
 		 425 aa  210  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  28.64 
 
 		 435 aa  210  5e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  34.36 
 
 		 425 aa  210  5e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  33.8 
 
 		 425 aa  209  6e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  33.8 
 
 		 425 aa  209  6e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  30.61 
 
 		 428 aa  209  8e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  29.11 
 
 		 438 aa  206  6e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  31.28 
 
 		 435 aa  205  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  30.25 
 
 		 428 aa  204  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  30.35 
 
 		 432 aa  204  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  31.31 
 
 		 488 aa  203  6e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  31.15 
 
 		 438 aa  200  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  34.81 
 
 		 478 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  30.39 
 
 		 433 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  28.67 
 
 		 448 aa  194  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  29.05 
 
 		 433 aa  194  4e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  26.06 
 
 		 426 aa  190  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  32.12 
 
 		 433 aa  189  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  32.12 
 
 		 433 aa  189  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  29.79 
 
 		 428 aa  188  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  32.16 
 
 		 434 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  30.07 
 
 		 427 aa  183  5.0000000000000004e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  30 
 
 		 436 aa  180  4e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  28.47 
 
 		 435 aa  179  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  29.98 
 
 		 436 aa  178  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  30.88 
 
 		 434 aa  177  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  29.13 
 
 		 444 aa  177  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  27.27 
 
 		 431 aa  177  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00701  trigger factor  31.66 
 
 		 479 aa  176  8e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.195146 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2222  trigger factor  28.77 
 
 		 438 aa  176  9e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.939539  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  31.56 
 
 		 427 aa  176  9e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  31.52 
 
 		 434 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  28.35 
 
 		 435 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0109  trigger factor  27.97 
 
 		 432 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17984 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  27.45 
 
 		 433 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  30.25 
 
 		 428 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  29.82 
 
 		 427 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  31.52 
 
 		 434 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  31.52 
 
 		 434 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  31.52 
 
 		 434 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  27.91 
 
 		 500 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  30.25 
 
 		 428 aa  173  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3786  trigger factor  28.8 
 
 		 435 aa  172  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  30.07 
 
 		 451 aa  172  1e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  33.96 
 
 		 436 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  28.51 
 
 		 471 aa  171  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  28.19 
 
 		 449 aa  170  5e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  29.71 
 
 		 434 aa  169  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>