More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3278 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  100 
 
 		 415 aa  795    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  64.73 
 
 		 442 aa  501  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  61 
 
 		 420 aa  481  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  66.83 
 
 		 408 aa  464  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  57.01 
 
 		 432 aa  424  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  59.5 
 
 		 425 aa  423  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  55.34 
 
 		 421 aa  410  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  50.85 
 
 		 414 aa  377  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 432 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  47.87 
 
 		 402 aa  256  5e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1968  major facilitator superfamily MFS_1  39.7 
 
 		 405 aa  186  7e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000336752  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  36.68 
 
 		 411 aa  163  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  36.92 
 
 		 435 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  35.9 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  32.22 
 
 		 451 aa  147  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0236  major facilitator transporter  38.35 
 
 		 402 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00072705 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  34.99 
 
 		 416 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  35.11 
 
 		 426 aa  141  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 416 aa  139  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  32.43 
 
 		 461 aa  134  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0208  hypothetical protein  41.57 
 
 		 289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  32.97 
 
 		 434 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  31.68 
 
 		 406 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 		 429 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  30.28 
 
 		 418 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  30.28 
 
 		 418 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  30.28 
 
 		 418 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  30.28 
 
 		 417 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  30.28 
 
 		 417 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2325  major facilitator superfamily permease  30.28 
 
 		 397 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0197346  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 		 444 aa  113  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0074  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 410 aa  112  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2429  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 		 418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 427 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 456 aa  110  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  29.4 
 
 		 417 aa  107  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  22.83 
 
 		 405 aa  106  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  22.83 
 
 		 405 aa  106  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4215  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 467 aa  106  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251159  normal  0.128113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  31.17 
 
 		 408 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2101  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 		 447 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 442 aa  101  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  27.25 
 
 		 417 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 416 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 426 aa  98.2  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 		 412 aa  98.6  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 416 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 436 aa  97.1  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  26.22 
 
 		 410 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 420 aa  95.5  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 		 432 aa  95.5  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 420 aa  95.5  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2910  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 439 aa  95.5  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6746  hypothetical protein  31.86 
 
 		 427 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.283343 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 440 aa  94  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  28.7 
 
 		 420 aa  93.6  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 479 aa  93.6  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 426 aa  93.6  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5351  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 		 401 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804378  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  28.12 
 
 		 415 aa  92  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  31.5 
 
 		 406 aa  92  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3773  major facilitator superfamily MFS_1  34.22 
 
 		 420 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  27.84 
 
 		 415 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 390 aa  89.4  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 451 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 416 aa  89.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 390 aa  89.4  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 416 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 410 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 416 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  27.32 
 
 		 378 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  27.58 
 
 		 415 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  28.3 
 
 		 405 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 442 aa  88.2  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  26.25 
 
 		 430 aa  88.2  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0124  major facilitator transporter  27.87 
 
 		 403 aa  88.2  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 		 416 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  27.32 
 
 		 378 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  27.32 
 
 		 378 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3270  permease, putative  26.97 
 
 		 419 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.719917  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 416 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 		 390 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0972  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 408 aa  87.8  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.619052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1023  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 408 aa  87.8  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 412 aa  87  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3025  permease  26.85 
 
 		 419 aa  86.7  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3010  macrolide-efflux protein  26.6 
 
 		 419 aa  87  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 		 450 aa  87  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3276  putative permease  26.6 
 
 		 419 aa  87  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.550677  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3258  permease  26.85 
 
 		 419 aa  86.7  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1206  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 408 aa  87  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208797  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  27.58 
 
 		 415 aa  87  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2947  macrolide-efflux protein  26.6 
 
 		 419 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0495728  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 		 420 aa  86.7  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0591  hypothetical protein  30.74 
 
 		 416 aa  86.3  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  27.3 
 
 		 403 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  30.27 
 
 		 429 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  23.81 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>