More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3254 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3254  signal peptidase I  100 
 
 		 267 aa  547  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1517  signal peptidase I  42.11 
 
 		 298 aa  162  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489263  normal  0.0166712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1518  signal peptidase I  43.42 
 
 		 469 aa  162  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.0182553 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0984  signal peptidase I  39.2 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.376271 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23700  signal peptidase I  42.96 
 
 		 279 aa  159  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412828  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10040  signal peptidase I  36.26 
 
 		 266 aa  153  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17522  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1832  Signal peptidase I-like protein  40.07 
 
 		 289 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0667  signal peptidase I  38.25 
 
 		 338 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.607468  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1475  signal peptidase I  43.16 
 
 		 290 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.393591  normal  0.0414721 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0990  signal peptidase I  38.35 
 
 		 284 aa  151  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000142727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0229  signal peptidase I  39.45 
 
 		 291 aa  149  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2477  signal peptidase I  39.46 
 
 		 304 aa  148  8e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0881706  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0985  signal peptidase I  38.39 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60179  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1172  signal peptidase I  39.06 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2535  signal peptidase I  41.83 
 
 		 247 aa  146  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3418  signal peptidase I  36.9 
 
 		 360 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  39.24 
 
 		 290 aa  143  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4002  signal peptidase I  39.39 
 
 		 313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1311  signal peptidase I  36.05 
 
 		 213 aa  139  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0179  signal peptidase I  39.27 
 
 		 342 aa  138  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11110  signal peptidase I  35.93 
 
 		 268 aa  138  8.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056722  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2890  signal peptidase I  40.47 
 
 		 251 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527092  normal  0.396669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2186  signal peptidase I  36.94 
 
 		 304 aa  135  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1200  signal peptidase I  36.48 
 
 		 213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1310  signal peptidase I  37.61 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3589  signal peptidase I  39.72 
 
 		 352 aa  132  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1556  signal peptidase I  36.02 
 
 		 311 aa  132  6e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.329256  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2217  signal peptidase I  38.87 
 
 		 290 aa  131  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000553626 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1153  signal peptidase I  39.17 
 
 		 434 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.573938  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9015  Signal peptidase I-like protein  38.82 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2187  signal peptidase I  37.55 
 
 		 261 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1404  signal peptidase I  38.15 
 
 		 254 aa  128  8.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4540  signal peptidase I  39.3 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0613872  normal  0.498524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1833  signal peptidase I  36.65 
 
 		 220 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12917  signal peptidase I lepB (leader peptidase I)  39.08 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.710177 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5921  signal peptidase I  34.01 
 
 		 288 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0282682  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4169  signal peptidase I  37.21 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2188  signal peptidase I  36.36 
 
 		 230 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0349531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3131  signal peptidase I  33.06 
 
 		 272 aa  115  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000239425  normal  0.113898 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09800  signal peptidase I  37.86 
 
 		 341 aa  113  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2218  signal peptidase I  34.39 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5920  signal peptidase I  32.8 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0083042  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2193  signal peptidase I  36.6 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.107001  normal  0.241649 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  34.33 
 
 		 200 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  34.33 
 
 		 200 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0509  signal peptidase I  33.61 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.82955  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2091  signal peptidase I  34.04 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1023  signal peptidase I  33.33 
 
 		 285 aa  106  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.114866  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  30.67 
 
 		 190 aa  106  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1631  signal peptidase I  34.98 
 
 		 288 aa  105  7e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0349  signal peptidase I  33.61 
 
 		 262 aa  105  9e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1951  signal peptidase I  34.96 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1971  signal peptidase I  34.96 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2017  signal peptidase I  34.96 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  33.93 
 
 		 192 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  33.33 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09210  signal peptidase I  33.19 
 
 		 199 aa  103  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0732618  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  34.42 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  34.91 
 
 		 193 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  32.49 
 
 		 186 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1403  signal peptidase I  35.05 
 
 		 219 aa  98.6  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.880656  normal  0.0120837 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  38.86 
 
 		 173 aa  97.4  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2478  signal peptidase I  34.8 
 
 		 225 aa  97.1  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0470838  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  33.49 
 
 		 184 aa  96.3  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  31.16 
 
 		 190 aa  95.9  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  32.7 
 
 		 209 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  31.98 
 
 		 185 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  30 
 
 		 214 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05490  signal peptidase I  33.33 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  34.12 
 
 		 174 aa  92.8  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07511  Signal peptidase I  32.77 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  31.98 
 
 		 181 aa  92  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  30.73 
 
 		 220 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  31.13 
 
 		 197 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  29.63 
 
 		 187 aa  89  8e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  31.19 
 
 		 198 aa  87.8  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0478  thylakoidal processing peptidase  34.41 
 
 		 203 aa  86.3  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  32.16 
 
 		 173 aa  85.5  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  33.17 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1659  peptidase S26A, signal peptidase I  28.77 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0918  signal peptidase I  27.71 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  25.72 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0692  signal peptidase I  31.66 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0204577  hitchhiker  0.0000207144 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  36.26 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  31.4 
 
 		 185 aa  81.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  33 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  27.82 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  30 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  29.6 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0699  peptidase S26A, signal peptidase I  28.31 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0691424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  31.6 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  30.2 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  30.33 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  33.01 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  30.2 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05711  Signal peptidase I  28.24 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.818825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  32 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  30.2 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  28.9 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05151  Signal peptidase I  34.08 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.715932  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>