275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3024 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3024  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 210 aa  419  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5632  electron transport protein SCO1/SenC  36.89 
 
 		 296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.765574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2499  electron transport protein SCO1/SenC  39.15 
 
 		 246 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.570283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7198  electron transport protein SCO1/SenC  42.08 
 
 		 247 aa  117  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.325684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3067  electron transport protein SCO1/SenC  37.07 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00232769  hitchhiker  0.00529609 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1277  electron transport protein SCO1/SenC  38.16 
 
 		 220 aa  108  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0915  electron transport protein SCO1/SenC  35.81 
 
 		 256 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.836521  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1776  electron transport protein SCO1/SenC  34.86 
 
 		 209 aa  101  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254998  normal  0.31988 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  41.25 
 
 		 192 aa  97.8  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  31.77 
 
 		 198 aa  96.7  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3080  hypothetical protein  32.79 
 
 		 310 aa  97.1  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  40.74 
 
 		 207 aa  91.3  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  31.55 
 
 		 197 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  36.72 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  44.66 
 
 		 203 aa  89.4  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  44.66 
 
 		 187 aa  89  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  37.41 
 
 		 204 aa  88.2  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  34.9 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  35.19 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  30.5 
 
 		 197 aa  86.7  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3480  electron transport protein SCO1/SenC  44.9 
 
 		 212 aa  85.9  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.92089  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  37.01 
 
 		 205 aa  85.5  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  34.42 
 
 		 202 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2379  electron transport protein SCO1/SenC  36.57 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  36.64 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2683  electron transport protein SCO1/SenC  31.65 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3316  electron transport protein SCO1/SenC  36.57 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1986  electron transport protein SCO1/SenC  36.57 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2851  SCO1/SenC family protein  35.29 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000861503  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  31.85 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  36.51 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  36.24 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  31.58 
 
 		 215 aa  81.3  0.000000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  39.35 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  37.91 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  39.35 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  35.26 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  39.35 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  39.35 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  32.5 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  41.3 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  31.17 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  34.88 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  32.5 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  32.5 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  32.5 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  32.5 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  32.31 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  32.5 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  33.56 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  32.7 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3333  electron transport protein SCO1/SenC  38.18 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  37.01 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  34.93 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  36.77 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  41.58 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  35.95 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  29.7 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  36.13 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  31.98 
 
 		 218 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  32.47 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  37.96 
 
 		 181 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  41.28 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  31.16 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  31.58 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  37.96 
 
 		 181 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  35.77 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0189  electron transport protein SCO1/SenC  35.86 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  37.14 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  34 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  37.38 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  36.13 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  36.13 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  33.75 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  43.4 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2208  electron transport protein SCO1/SenC  32.84 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  37.23 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  32.77 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0405  electron transport protein SCO1/SenC  39.6 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4007  electron transport protein SCO1/SenC  32.21 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612084  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0071  electron transport protein SCO1/SenC  36.55 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.420398  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  30.97 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  37.96 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  34.75 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  37.14 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  34.31 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  36.31 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  32.94 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  34.31 
 
 		 275 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  36.45 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  34.31 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  31.65 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0228  SCO1/SenC family protein  33.33 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  31.45 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  32.14 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  37.7 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2285  twin-arginine translocation pathway signal  31.34 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14309  hitchhiker  0.000889852 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  30.49 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>