More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0680 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0680  inner-membrane translocator  100 
 
 		 343 aa  656    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0101  inner-membrane translocator  40.73 
 
 		 342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.832216  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1812  inner-membrane translocator  43.14 
 
 		 344 aa  186  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0354893  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0808  inner-membrane translocator  40.52 
 
 		 353 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.308747  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3930  monosaccharide-transporting ATPase  35.63 
 
 		 360 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.612132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3886  inner-membrane translocator  36.27 
 
 		 376 aa  169  6e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6410  inner-membrane translocator  33.64 
 
 		 346 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197566  normal  0.503091 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4515  Monosaccharide-transporting ATPase  33.64 
 
 		 346 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00130543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3689  inner-membrane translocator  37.25 
 
 		 376 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2712  inner-membrane translocator  33.53 
 
 		 362 aa  156  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.216754 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5041  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  32.93 
 
 		 352 aa  154  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3344  inner-membrane translocator  33.91 
 
 		 363 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0764  ribose ABC transporter, permease  33.8 
 
 		 349 aa  146  6e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.228645  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2344  inner-membrane translocator  31.94 
 
 		 352 aa  135  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0936841  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  32.93 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  32.93 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  32.93 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  32.93 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  34.42 
 
 		 337 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1594  monosaccharide-transporting ATPase  36.84 
 
 		 354 aa  133  5e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.723616  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  34.09 
 
 		 335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  33.22 
 
 		 337 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  28.57 
 
 		 330 aa  125  7e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  28.57 
 
 		 330 aa  125  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 330 aa  125  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0610  inner-membrane translocator  36.11 
 
 		 358 aa  125  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4348  inner-membrane translocator  36.4 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  32.26 
 
 		 333 aa  123  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  31.46 
 
 		 335 aa  119  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1196  ribose ABC transporter, permease protein  32.26 
 
 		 334 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1640  carbohydrate ABC transporter permease  32.26 
 
 		 334 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.367254  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0302  carbohydrate ABC transporter permease  32.26 
 
 		 334 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0470774  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0858  carbohydrate ABC transporter permease  32.26 
 
 		 334 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  30.82 
 
 		 312 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  30.3 
 
 		 326 aa  117  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2071  ribose ABC transporter, permease protein  32.45 
 
 		 341 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0117227  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1909  carbohydrate ABC transporter permease  32.45 
 
 		 339 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.071894  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1922  carbohydrate ABC transporter permease  32.45 
 
 		 339 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  31.37 
 
 		 342 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  31.37 
 
 		 342 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  31.37 
 
 		 342 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3645  inner-membrane translocator  33.12 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0907  methylthioribose transport system permease protein  27.81 
 
 		 329 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  26.95 
 
 		 314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  31.05 
 
 		 333 aa  113  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2158  inner-membrane translocator  30.09 
 
 		 325 aa  112  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0784619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  30.79 
 
 		 311 aa  112  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  30.79 
 
 		 311 aa  112  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0880  Monosaccharide-transporting ATPase  30.99 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0333312  normal  0.303688 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  30.79 
 
 		 311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  30.97 
 
 		 337 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4325  inner-membrane translocator  32.26 
 
 		 355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  30.46 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  30.46 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  30.46 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  30.79 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0945  Monosaccharide-transporting ATPase  30.41 
 
 		 335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0035821  normal  0.067207 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4016  inner-membrane translocator  35.54 
 
 		 352 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4121  inner-membrane translocator  30.72 
 
 		 328 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  29.39 
 
 		 383 aa  109  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1914  inner-membrane translocator  30.97 
 
 		 328 aa  109  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  30.34 
 
 		 327 aa  109  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  30.13 
 
 		 311 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  30.13 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  30.13 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0638  monosaccharide-transporting ATPase  26.23 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0715262  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  30.89 
 
 		 346 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1921  inner-membrane translocator  32.52 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.354392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2433  ribose ABC transporter, permease protein  32.08 
 
 		 349 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.19854  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1607  inner-membrane translocator  30.5 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.963259  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3219  monosaccharide-transporting ATPase  29.65 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0249  inner-membrane translocator  35.89 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3092  inner-membrane translocator  35.22 
 
 		 325 aa  107  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.281303  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  30.57 
 
 		 346 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  30.1 
 
 		 317 aa  107  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  31.79 
 
 		 327 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6089  inner-membrane translocator  32.42 
 
 		 334 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.761591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7025  monosaccharide-transporting ATPase  29.11 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3047  inner-membrane translocator  27.13 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.853041  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  28.49 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3078  ribose ABC transporter permease  29.34 
 
 		 331 aa  105  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2424  ribose ABC transporter, permease protein  29.34 
 
 		 331 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2521  monosaccharide-transporting ATPase  29.34 
 
 		 331 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  30.65 
 
 		 340 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2108  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 354 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.121569 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  29.14 
 
 		 311 aa  102  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  26.84 
 
 		 310 aa  102  9e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3353  inner-membrane translocator  31.88 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0539  inner-membrane translocator  29.21 
 
 		 322 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4655  inner-membrane translocator  29.33 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00409858 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2903  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4747  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.78 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101541  normal  0.377997 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  26.45 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  28.83 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  30.12 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0663  monosaccharide-transporting ATPase  27.08 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4475  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  29.03 
 
 		 332 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2460  inner-membrane translocator  30.72 
 
 		 333 aa  100  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4924  Monosaccharide-transporting ATPase  31.43 
 
 		 342 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  27.3 
 
 		 345 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>