137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2838 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2838  nitroreductase  100 
 
 
223 aa  464  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2404  nitroreductase  56.94 
 
 
151 aa  170  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  43.92 
 
 
200 aa  167  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2261  nitroreductase  43.16 
 
 
201 aa  152  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.746283  normal  0.134626 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  44.74 
 
 
213 aa  150  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4613  nitroreductase  42.63 
 
 
214 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.250865 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10883  Nitroreductase  39.29 
 
 
197 aa  143  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0491  nitroreductase  42.19 
 
 
315 aa  133  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.807689 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  36.04 
 
 
205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  36.98 
 
 
197 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  36.36 
 
 
201 aa  125  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  35.15 
 
 
205 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1829  nitroreductase  36.51 
 
 
200 aa  123  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00202262  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  35.83 
 
 
201 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  35.83 
 
 
201 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  35.83 
 
 
201 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  35.83 
 
 
201 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  35.83 
 
 
201 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  35.29 
 
 
201 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  35.29 
 
 
201 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36390  nitroreductase  37.77 
 
 
199 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1442  nitroreductase  36.76 
 
 
195 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  34.03 
 
 
201 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2102  nitroreductase  37.7 
 
 
200 aa  118  6e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  33.51 
 
 
203 aa  117  9e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  34.55 
 
 
201 aa  118  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  34.03 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  34.03 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  34.03 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  34.01 
 
 
207 aa  116  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3221  nitroreductase  36.51 
 
 
198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  34.03 
 
 
201 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4639  nitroreductase  36.9 
 
 
189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4890  nitroreductase  37.7 
 
 
199 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4979  nitroreductase  37.7 
 
 
199 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2397  nitroreductase  36.51 
 
 
205 aa  111  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5505  nitroreductase  36.32 
 
 
194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0533827 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5258  nitroreductase  37.7 
 
 
199 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.656936 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1303  nitroreductase  36.32 
 
 
199 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_002978  WD1207  nitroreductase family protein  31.67 
 
 
195 aa  107  1e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3075  nitroreductase  36.72 
 
 
198 aa  106  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0215  nitroreductase  36.11 
 
 
210 aa  106  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1571  nitroreductase  35.98 
 
 
199 aa  105  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.160224  normal  0.163104 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2772  nitroreductase  34.91 
 
 
200 aa  102  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5063  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  32.82 
 
 
199 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772676  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5012  nitroreductase  30.48 
 
 
191 aa  99.4  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181044  hitchhiker  0.00444875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1159  nitroreductase  34.48 
 
 
199 aa  99  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0289  nitroreductase  33.7 
 
 
190 aa  98.2  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1566  nitroreductase  32.63 
 
 
197 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00494476 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.4 
 
 
330 aa  97.1  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3146  nitroreductase  31.66 
 
 
200 aa  97.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3919  nitroreductase family protein  32.63 
 
 
197 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0014  nitroreductase family protein  32.82 
 
 
198 aa  95.9  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0111  putative nitroreductase  35.26 
 
 
198 aa  95.5  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4273  nitroreductase  33.16 
 
 
199 aa  95.1  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1300  nitroreductase  33.68 
 
 
197 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3370  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  32.8 
 
 
199 aa  93.2  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0510232  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4118  nitroreductase  33.68 
 
 
197 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2200  nitroreductase  33.33 
 
 
199 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0875675  normal  0.438667 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4588  nitroreductase  33.68 
 
 
197 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3947  nitroreductase  32.8 
 
 
199 aa  91.7  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2095  nitroreductase family protein  29.1 
 
 
189 aa  90.9  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4947  nitroreductase  30.53 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.907105  normal  0.53209 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2245  nitroreductase  30.89 
 
 
197 aa  90.1  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0264  nitroreductase  34.12 
 
 
187 aa  89.4  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  hitchhiker  0.00114487 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1391  nitroreductase  30.53 
 
 
197 aa  89  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1538  nitroreductase  32.11 
 
 
203 aa  88.6  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0225  nitroreductase  31.64 
 
 
200 aa  88.2  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  0.851937 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4899  nitroreductase  29.1 
 
 
203 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4435  nitroreductase  28.57 
 
 
203 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.676369  normal  0.38334 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0345  nitroreductase  32.14 
 
 
212 aa  84.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1636  nitroreductase  34.44 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000151333  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3177  putative NADH dehydrogenase/NAD(P)H nitroreductase  31.58 
 
 
204 aa  82.8  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.999951  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1659  nitroreductase  31.94 
 
 
233 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00583847  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0150  hypothetical protein  31.14 
 
 
214 aa  79  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197759  normal  0.577731 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2215  nitroreductase  34.03 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0324809  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  32.92 
 
 
321 aa  77  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  32.3 
 
 
321 aa  75.9  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1732  nitroreductase  32.98 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.639581  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0458  nitroreductase  30.22 
 
 
195 aa  74.3  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.348313  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4328  nitroreductase  28.65 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.59961  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  29.69 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  29.27 
 
 
179 aa  62.4  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0589  nitroreductase  30.26 
 
 
192 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  25.41 
 
 
184 aa  60.1  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15950  nitroreductase  25.15 
 
 
188 aa  58.5  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000360  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  28.42 
 
 
237 aa  53.1  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2794  nitroreductase  32.89 
 
 
218 aa  52.4  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2510  nitroreductase  23.53 
 
 
218 aa  52  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  30.99 
 
 
246 aa  51.6  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3894  nitroreductase  31.17 
 
 
218 aa  51.2  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2524  nitroreductase-like  25 
 
 
211 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000539057  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  25.61 
 
 
209 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  26.11 
 
 
213 aa  50.4  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06175  NAD(P)H-dependent flavin reductase  29.17 
 
 
218 aa  49.3  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  30.17 
 
 
213 aa  49.3  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  24.14 
 
 
200 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  27.11 
 
 
170 aa  48.5  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2454  nitroreductase  30.11 
 
 
218 aa  48.5  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313556  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1196  nitroreductase  37.5 
 
 
235 aa  48.1  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.473122 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>