121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2404 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2404  nitroreductase  100 
 
 		 151 aa  314  3e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2838  nitroreductase  56.94 
 
 		 223 aa  170  7.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4613  nitroreductase  57.14 
 
 		 214 aa  149  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.250865 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  48.65 
 
 		 200 aa  142  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  50.72 
 
 		 213 aa  142  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2102  nitroreductase  42.86 
 
 		 200 aa  121  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2261  nitroreductase  43.48 
 
 		 201 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.746283  normal  0.134626 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  44.53 
 
 		 203 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10883  Nitroreductase  40.85 
 
 		 197 aa  111  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3075  nitroreductase  42.75 
 
 		 198 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  44.85 
 
 		 205 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  44.12 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  43.75 
 
 		 197 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  43.38 
 
 		 201 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  42.65 
 
 		 201 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  42.65 
 
 		 201 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  42.65 
 
 		 201 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  44.85 
 
 		 205 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2772  nitroreductase  41.91 
 
 		 200 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  43.36 
 
 		 207 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1571  nitroreductase  43.38 
 
 		 199 aa  105  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.160224  normal  0.163104 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1442  nitroreductase  40.56 
 
 		 195 aa  104  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  41.91 
 
 		 201 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  43.38 
 
 		 201 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  43.38 
 
 		 201 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  43.38 
 
 		 201 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  43.38 
 
 		 201 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  43.38 
 
 		 201 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  43.38 
 
 		 201 aa  103  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  42.65 
 
 		 201 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  42.65 
 
 		 201 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0491  nitroreductase  43.06 
 
 		 315 aa  100  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.807689 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2397  nitroreductase  40 
 
 		 205 aa  99.8  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3221  nitroreductase  40.71 
 
 		 198 aa  98.2  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1829  nitroreductase  43.45 
 
 		 200 aa  98.2  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00202262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36390  nitroreductase  45.65 
 
 		 199 aa  97.8  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3370  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  36.17 
 
 		 199 aa  97.1  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0510232  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2095  nitroreductase family protein  36.36 
 
 		 189 aa  96.7  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5012  nitroreductase  36.3 
 
 		 191 aa  96.3  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181044  hitchhiker  0.00444875 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3947  nitroreductase  41.35 
 
 		 199 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4273  nitroreductase  40.6 
 
 		 199 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4947  nitroreductase  37.5 
 
 		 203 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.907105  normal  0.53209 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0014  nitroreductase family protein  38.69 
 
 		 198 aa  95.9  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3919  nitroreductase family protein  37.41 
 
 		 197 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1566  nitroreductase  34.93 
 
 		 197 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494476 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4435  nitroreductase  38.1 
 
 		 203 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.676369  normal  0.38334 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2245  nitroreductase  36.69 
 
 		 197 aa  92.8  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4899  nitroreductase  38.1 
 
 		 203 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1159  nitroreductase  39.86 
 
 		 199 aa  92  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0289  nitroreductase  43.31 
 
 		 190 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2200  nitroreductase  38.46 
 
 		 199 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0875675  normal  0.438667 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1391  nitroreductase  36.72 
 
 		 197 aa  87  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5063  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  32.9 
 
 		 199 aa  85.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772676  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0111  putative nitroreductase  34.9 
 
 		 198 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4890  nitroreductase  41.38 
 
 		 199 aa  84  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4979  nitroreductase  41.38 
 
 		 199 aa  84  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5505  nitroreductase  38.69 
 
 		 194 aa  84  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533827 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5258  nitroreductase  41.38 
 
 		 199 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.656936 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1300  nitroreductase  36.23 
 
 		 197 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4118  nitroreductase  36.23 
 
 		 197 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4588  nitroreductase  34.93 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3177  putative NADH dehydrogenase/NAD(P)H nitroreductase  34.78 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.999951  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1538  nitroreductase  37.23 
 
 		 203 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4639  nitroreductase  37.06 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3146  nitroreductase  34.53 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0215  nitroreductase  38.46 
 
 		 210 aa  77.8  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0150  hypothetical protein  35.51 
 
 		 214 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197759  normal  0.577731 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1636  nitroreductase  38.76 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000151333  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1659  nitroreductase  38.41 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00583847  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1303  nitroreductase  35.29 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_002978  WD1207  nitroreductase family protein  29.71 
 
 		 195 aa  74.3  0.0000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2215  nitroreductase  45.57 
 
 		 209 aa  73.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0324809  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1732  nitroreductase  45.57 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.639581  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4328  nitroreductase  32.31 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.59961  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.96 
 
 		 330 aa  68.2  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0264  nitroreductase  36.29 
 
 		 187 aa  67.4  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  hitchhiker  0.00114487 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0458  nitroreductase  29.92 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.348313  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0345  nitroreductase  34.56 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  35.2 
 
 		 321 aa  63.5  0.0000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  34.4 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0225  nitroreductase  34.68 
 
 		 200 aa  60.8  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  0.851937 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0589  nitroreductase  30.16 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  33.06 
 
 		 183 aa  52  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15950  nitroreductase  31.71 
 
 		 188 aa  50.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  28.33 
 
 		 170 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  27.14 
 
 		 209 aa  50.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  29.91 
 
 		 173 aa  50.4  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  31.36 
 
 		 179 aa  48.9  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  28.33 
 
 		 184 aa  49.3  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2852  nitroreductase  35.14 
 
 		 178 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2510  nitroreductase  28.07 
 
 		 218 aa  48.9  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  30.89 
 
 		 180 aa  47.8  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  26.71 
 
 		 178 aa  47.8  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  30.77 
 
 		 172 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  31.3 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4747  nitroreductase family protein  29.25 
 
 		 218 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.85334  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  30.13 
 
 		 246 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  26.87 
 
 		 187 aa  45.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  25.98 
 
 		 178 aa  45.1  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0299  hypothetical protein  34.88 
 
 		 196 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326717 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>