More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1361 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0020  AAA ATPase, central region  57.23 
 
 		 697 aa  707    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1361  AAA ATPase, central region  100 
 
 		 704 aa  1406    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252526  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3656  AAA ATPase, central region  44.17 
 
 		 694 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1566  AAA ATPase central domain protein  34.69 
 
 		 625 aa  234  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.20815  hitchhiker  0.00245284 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4675  ATPase central domain-containing protein  34.2 
 
 		 720 aa  221  5e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1816  ATPase central domain-containing protein  28.57 
 
 		 590 aa  207  7e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5669  AAA ATPase central domain protein  30.96 
 
 		 699 aa  204  6e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.658199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0985  AAA ATPase central domain protein  31.08 
 
 		 683 aa  200  7.999999999999999e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130271 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0194  AAA ATPase central domain protein  28.47 
 
 		 619 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.223838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1202  ATPase central domain-containing protein  32.87 
 
 		 627 aa  184  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0870142  normal  0.869838 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3837  AAA ATPase central domain protein  31.81 
 
 		 715 aa  170  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0808  ATPase central domain-containing protein  30.55 
 
 		 715 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1422  ATPase central domain-containing protein  31.27 
 
 		 715 aa  152  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6052  AAA ATPase central domain protein  27.75 
 
 		 634 aa  145  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.248698 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.64 
 
 		 602 aa  144  5e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.14 
 
 		 793 aa  144  6e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2284  putative cell division protein  28.12 
 
 		 634 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0284876 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.83 
 
 		 743 aa  141  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.47 
 
 		 610 aa  139  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.47 
 
 		 610 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  28.13 
 
 		 630 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  30.16 
 
 		 652 aa  137  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  29.79 
 
 		 645 aa  137  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1670  peptidase M41, FtsH  28.47 
 
 		 663 aa  137  8e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.398356  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.36 
 
 		 647 aa  137  8e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.05 
 
 		 679 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.95 
 
 		 640 aa  135  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  28.88 
 
 		 682 aa  135  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5357  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  31.91 
 
 		 615 aa  135  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232294 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.9 
 
 		 616 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2043  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.67 
 
 		 687 aa  134  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000823852 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.3 
 
 		 640 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4505  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.33 
 
 		 672 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13642  cell division protein ftsH (membrane-bound protease)  29.12 
 
 		 760 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052338 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2412  membrane protease FtsH catalytic subunit  29.61 
 
 		 628 aa  133  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.278023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  29.48 
 
 		 654 aa  133  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.88 
 
 		 644 aa  132  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0456572 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.96 
 
 		 781 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418248 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0091  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.96 
 
 		 625 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00172576  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.3 
 
 		 642 aa  132  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4314  Mername-AA223 peptidase  29.41 
 
 		 753 aa  132  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.22 
 
 		 646 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.22 
 
 		 646 aa  131  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0613  cell division protein, ATP-dependent metalloprotease  25.95 
 
 		 692 aa  131  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0642  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.49 
 
 		 616 aa  130  6e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.47 
 
 		 642 aa  130  8.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.47 
 
 		 642 aa  130  8.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  27.88 
 
 		 613 aa  130  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.06 
 
 		 640 aa  130  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.71 
 
 		 669 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0518  ATP-dependent metalloprotease FtsH  26.57 
 
 		 636 aa  129  1.0000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000475149  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35099  predicted protein  27.49 
 
 		 651 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.235498  decreased coverage  0.000591243 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1098  ATP-dependent metalloprotease FtsH  26.41 
 
 		 610 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0627303  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0172  ATP-dependent metalloprotease FtsH  26.79 
 
 		 646 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.31 
 
 		 647 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.95 
 
 		 671 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.066161 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01970  ATP-dependent peptidase, putative  27.8 
 
 		 782 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1416  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.79 
 
 		 794 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0495193  normal  0.256654 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2066  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.72 
 
 		 705 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.02 
 
 		 714 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  29.29 
 
 		 637 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  27.08 
 
 		 681 aa  129  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.02 
 
 		 696 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08270  ATP-dependent metallopeptidase M41, FtsH  31.81 
 
 		 616 aa  129  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1774  FtsH-2 peptidase  30.3 
 
 		 702 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.517267  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.6 
 
 		 638 aa  129  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.03 
 
 		 653 aa  128  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.25 
 
 		 760 aa  128  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0276  ATP-dependent Zn protease  29.32 
 
 		 708 aa  128  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00629107  normal  0.162688 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2158  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.3 
 
 		 706 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4390  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.82 
 
 		 623 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.489169  normal  0.114321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3001  ATP-dependent metalloprotease FtsH  26.32 
 
 		 676 aa  128  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0623369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.14 
 
 		 645 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.19 
 
 		 612 aa  128  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02030  membrane protease FtsH catalytic subunit  29.74 
 
 		 783 aa  127  5e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000829689  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1691  cell division protein FtsH  27.1 
 
 		 644 aa  127  6e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  29.03 
 
 		 656 aa  127  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0357  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.78 
 
 		 613 aa  127  6e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0125367  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  28.33 
 
 		 645 aa  127  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16391  predicted protein  27.51 
 
 		 590 aa  127  7e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0879  FtsH peptidase  26.19 
 
 		 611 aa  127  7e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.47 
 
 		 632 aa  127  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.3 
 
 		 630 aa  127  8.000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.88 
 
 		 637 aa  127  8.000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.698046  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.75 
 
 		 616 aa  127  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.75 
 
 		 616 aa  127  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0030  ATP-dependent metalloprotease FtsH  26.38 
 
 		 696 aa  127  9e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.876867  normal  0.384468 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0559  ATP-dependent metalloprotease FtsH  26.34 
 
 		 801 aa  127  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5769  ATPase central domain-containing protein  26.94 
 
 		 637 aa  126  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  28.27 
 
 		 649 aa  126  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.31 
 
 		 657 aa  126  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.38 
 
 		 617 aa  126  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35650  membrane protease FtsH catalytic subunit  26.22 
 
 		 798 aa  126  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.399414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0232  hypothetical protein  26.79 
 
 		 691 aa  125  2e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0076  membrane protease FtsH catalytic subunit  27.75 
 
 		 644 aa  126  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.597348  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2418  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.86 
 
 		 616 aa  125  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.85 
 
 		 753 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5156  Mername-AA223 peptidase  27.53 
 
 		 784 aa  126  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0466  ATP-dependent metalloprotease FtsH  26.08 
 
 		 673 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0723  FtsH-2 peptidase  29.86 
 
 		 609 aa  125  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0513277  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>