More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0938 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 260 aa  525  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  86.05 
 
 		 262 aa  451  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  76.26 
 
 		 263 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  61.24 
 
 		 261 aa  316  3e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  58.37 
 
 		 263 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  64.73 
 
 		 276 aa  311  6.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  62.02 
 
 		 263 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  57.2 
 
 		 263 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  57.2 
 
 		 263 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  56.81 
 
 		 263 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  56.2 
 
 		 263 aa  301  7.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  62.6 
 
 		 261 aa  301  9e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  58.27 
 
 		 263 aa  297  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  56.37 
 
 		 262 aa  281  7.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  56.76 
 
 		 262 aa  281  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  56.37 
 
 		 262 aa  276  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  56.37 
 
 		 262 aa  276  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  54.26 
 
 		 262 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  55.82 
 
 		 280 aa  264  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  52.73 
 
 		 264 aa  263  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  51 
 
 		 263 aa  258  9e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3363  enoyl-CoA hydratase  63.04 
 
 		 261 aa  257  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  51 
 
 		 263 aa  255  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  51 
 
 		 263 aa  255  5e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  51 
 
 		 263 aa  255  5e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  51 
 
 		 263 aa  255  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  51 
 
 		 263 aa  255  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  51 
 
 		 263 aa  255  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  51 
 
 		 263 aa  255  5e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  52.51 
 
 		 263 aa  254  8e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  50.4 
 
 		 264 aa  249  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  48.25 
 
 		 261 aa  249  3e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0681  enoyl-CoA hydratase  55.81 
 
 		 263 aa  244  9e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  46.83 
 
 		 262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0468  enoyl-CoA hydratase  55.16 
 
 		 263 aa  238  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3628  enoyl-CoA hydratase  53.2 
 
 		 263 aa  238  8e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00340574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0446  enoyl-CoA hydratase  53.01 
 
 		 263 aa  235  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0471  enoyl-CoA hydratase  53.04 
 
 		 263 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0802767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2564  enoyl-CoA hydratase  51.6 
 
 		 263 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0541  enoyl-CoA hydratase  51.6 
 
 		 263 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306395  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2691  enoyl-CoA hydratase  53.82 
 
 		 263 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0513  enoyl-CoA hydratase  51.6 
 
 		 263 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3488  enoyl-CoA hydratase  55.16 
 
 		 263 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000267739 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1551  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  56.92 
 
 		 263 aa  230  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3015  enoyl-CoA hydratase  55.64 
 
 		 274 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  47.2 
 
 		 263 aa  228  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2853  enoyl-CoA hydratase  52.21 
 
 		 263 aa  226  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00948295  normal  0.659081 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.4 
 
 		 257 aa  226  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.72 
 
 		 270 aa  224  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2873  enoyl-CoA hydratase  52.51 
 
 		 262 aa  223  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00237837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2750  enoyl-CoA hydratase  51.74 
 
 		 262 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00030401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3115  enoyl-CoA hydratase  51.35 
 
 		 262 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000284376  normal  0.0714988 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  47.86 
 
 		 261 aa  215  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.62 
 
 		 263 aa  214  9e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0214768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.53 
 
 		 267 aa  214  9e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  47.6 
 
 		 260 aa  208  6e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  44.27 
 
 		 266 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  43.82 
 
 		 264 aa  204  9e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  45.45 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1238  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.19 
 
 		 267 aa  202  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  43.48 
 
 		 266 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  47.03 
 
 		 266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0568  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.19 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2405  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.57 
 
 		 272 aa  196  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.09 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1715  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.02 
 
 		 264 aa  192  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2154  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  46.69 
 
 		 258 aa  192  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0984  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  49.81 
 
 		 266 aa  192  5e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.540223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1171  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.372212  normal  0.332854 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4073  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.91 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  45.32 
 
 		 267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2188  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.38 
 
 		 255 aa  188  8e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.000498969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  43.87 
 
 		 266 aa  188  9e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.94 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.17 
 
 		 264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3726  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.96 
 
 		 258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452007  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.94 
 
 		 270 aa  180  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.67 
 
 		 273 aa  179  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3979  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.62 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.776051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1130  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  41.25 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.37 
 
 		 271 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.7 
 
 		 259 aa  175  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  39.62 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1292  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.2 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.886446  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1753  enoyl-CoA hydratase  43.87 
 
 		 258 aa  171  9e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.228549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8421  enoyl-CoA hydratase  42.86 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  38.08 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 		 260 aa  169  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 		 264 aa  169  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.93 
 
 		 265 aa  169  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2697  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.13 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000960685  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.58 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3809  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.91 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.97613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.31 
 
 		 267 aa  166  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.91 
 
 		 268 aa  166  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.92 
 
 		 274 aa  165  5.9999999999999996e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.58 
 
 		 271 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.93 
 
 		 264 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.93 
 
 		 264 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>