More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0905 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0905  ABC transporter related  100 
 
 
243 aa  486  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.072369  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  57.66 
 
 
233 aa  248  7e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  58.26 
 
 
248 aa  247  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  52.04 
 
 
232 aa  247  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  58.26 
 
 
248 aa  247  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  52.02 
 
 
236 aa  247  2e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  55.41 
 
 
232 aa  241  6e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  56.76 
 
 
248 aa  241  7e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2850  hypothetical protein  53.81 
 
 
229 aa  240  2e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  54.71 
 
 
239 aa  239  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2990  hypothetical protein  54.05 
 
 
229 aa  239  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  52.49 
 
 
225 aa  238  5e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06281  ABC transporter ATP-binding protein  51.11 
 
 
246 aa  238  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0807317 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  55.11 
 
 
252 aa  237  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  53.78 
 
 
259 aa  237  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  54.09 
 
 
228 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  54.21 
 
 
228 aa  234  9e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 
224 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 
224 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 
224 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  54.5 
 
 
233 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  52.49 
 
 
244 aa  233  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  54.67 
 
 
241 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 
224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  53.57 
 
 
244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  49.77 
 
 
224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  51.32 
 
 
230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  54.11 
 
 
241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  49.32 
 
 
224 aa  232  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  49.32 
 
 
224 aa  232  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  48.68 
 
 
236 aa  233  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 
224 aa  232  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  50.22 
 
 
237 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  53.81 
 
 
233 aa  231  6e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  50.67 
 
 
240 aa  231  6e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  51.57 
 
 
653 aa  231  8.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  53.28 
 
 
229 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  51.58 
 
 
239 aa  230  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1767  ATPase  51.58 
 
 
248 aa  231  1e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132988  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  48.42 
 
 
224 aa  230  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  52.49 
 
 
225 aa  231  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  53.64 
 
 
228 aa  230  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  52.23 
 
 
230 aa  229  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  51.13 
 
 
226 aa  229  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  48.42 
 
 
224 aa  229  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  49.78 
 
 
228 aa  230  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  50.67 
 
 
226 aa  229  2e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4308  ABC transporter related  56.31 
 
 
241 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4155  ABC transporter, ATPase subunit  56.31 
 
 
241 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4286  ABC transporter-related protein  56.31 
 
 
241 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0433  ATPase  52.8 
 
 
228 aa  229  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.526748  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  54.78 
 
 
238 aa  228  5e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  50.9 
 
 
246 aa  228  5e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  48.42 
 
 
224 aa  228  6e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04581  ABC transporter ATP-binding protein  52.8 
 
 
228 aa  228  6e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  55.11 
 
 
241 aa  228  7e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  52.25 
 
 
227 aa  228  7e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  53.02 
 
 
226 aa  228  8e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04881  ABC transporter ATP-binding protein  51.36 
 
 
235 aa  228  8e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134366  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1766  ATPase  50.9 
 
 
228 aa  228  9e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104306  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  52.09 
 
 
226 aa  227  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  51.77 
 
 
242 aa  227  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  50.45 
 
 
238 aa  227  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04891  ABC transporter ATP-binding protein  52.8 
 
 
228 aa  227  1e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4296  ABC transporter related  57.47 
 
 
242 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0438871  normal  0.557698 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  52.63 
 
 
668 aa  227  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  52.63 
 
 
668 aa  227  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  52.09 
 
 
226 aa  226  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  52.09 
 
 
226 aa  226  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  52.09 
 
 
226 aa  226  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  52.09 
 
 
226 aa  226  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 
226 aa  227  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  52.73 
 
 
228 aa  226  2e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  52.09 
 
 
226 aa  226  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  52.23 
 
 
226 aa  226  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  52.09 
 
 
226 aa  226  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  50 
 
 
260 aa  226  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 
226 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  51.8 
 
 
235 aa  226  3e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  51.56 
 
 
228 aa  226  3e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0222  ABC transporter related  56.31 
 
 
247 aa  226  4e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256244  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  50.89 
 
 
236 aa  225  6e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0269  ABC-type transport system, ATP-binding component  51.14 
 
 
227 aa  224  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  52.04 
 
 
247 aa  224  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  51.8 
 
 
233 aa  224  1e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1414  ATPase  52.81 
 
 
241 aa  224  1e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1867  ABC transporter related  52.75 
 
 
655 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  53.78 
 
 
230 aa  223  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  51.58 
 
 
234 aa  223  3e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  53.6 
 
 
256 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  50.89 
 
 
228 aa  222  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  51.58 
 
 
234 aa  223  3e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  54.42 
 
 
233 aa  222  4e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  49.77 
 
 
242 aa  222  4e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  53.6 
 
 
255 aa  222  4e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  52.38 
 
 
241 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0097  macrolide-specific ABC-type efflux carrier MacB  49.78 
 
 
668 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  52.31 
 
 
654 aa  221  6e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  53.78 
 
 
291 aa  221  7e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  51.16 
 
 
235 aa  221  7e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>