90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3529 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3529  protein of unknown function DUF418  100 
 
 		 398 aa  766    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.296308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4741  hypothetical protein  56.81 
 
 		 392 aa  385  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.400946  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8135  hypothetical protein  44.03 
 
 		 397 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026592  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4293  protein of unknown function DUF418  49.62 
 
 		 390 aa  271  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2581  hypothetical protein  40.31 
 
 		 388 aa  237  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.0605789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0072  hypothetical protein  44.33 
 
 		 380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0035  hypothetical protein  41.77 
 
 		 402 aa  216  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1416  protein of unknown function DUF405  39.95 
 
 		 407 aa  206  5e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.548338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1415  protein of unknown function DUF405  41.76 
 
 		 399 aa  204  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.845184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0622  hypothetical protein  38.33 
 
 		 439 aa  195  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1668  protein of unknown function DUF418  38.13 
 
 		 420 aa  192  8e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0719  protein of unknown function DUF418  40.2 
 
 		 405 aa  190  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0984  protein of unknown function DUF418  41.1 
 
 		 387 aa  182  8.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0392587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1670  hypothetical protein  35.75 
 
 		 405 aa  181  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.704713  normal  0.19338 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1063  protein of unknown function DUF405  37.53 
 
 		 472 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2152  hypothetical protein  34.55 
 
 		 393 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.391046 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3111  protein of unknown function DUF418  37.18 
 
 		 443 aa  176  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1078  protein of unknown function DUF418  38.2 
 
 		 384 aa  170  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1236  hypothetical protein  35.57 
 
 		 399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24880  predicted membrane protein  36.98 
 
 		 432 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0615892  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0505  protein of unknown function DUF418  36.58 
 
 		 407 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1461  hypothetical protein  35.56 
 
 		 401 aa  163  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3780  hypothetical protein  37.11 
 
 		 401 aa  157  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15990  predicted membrane protein  36.86 
 
 		 414 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.230384 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3607  protein of unknown function DUF418  34.07 
 
 		 407 aa  150  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.526186  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4159  hypothetical protein  39.68 
 
 		 401 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.776458  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07880  predicted membrane protein  33.77 
 
 		 407 aa  110  6e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2327  hypothetical protein  31.01 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30910  predicted membrane protein  28.01 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2066  protein of unknown function DUF418  24.17 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3571  protein of unknown function DUF418  28.7 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.983337  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4423  hypothetical protein  26.75 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00407884  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0015  hypothetical protein  21.88 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.428508  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0455  hypothetical protein  25.86 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222068  hitchhiker  0.00425561 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00200  predicted membrane protein  26.7 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.220914 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0117  membrane protein  22.53 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000725343  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2840  hypothetical protein  27.94 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1561  hypothetical protein  38.33 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1671  hypothetical protein  27.27 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0683  protein of unknown function DUF405  21.62 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1396  hypothetical protein  21.99 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0252  protein of unknown function DUF405  28 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3286  hypothetical protein  25.12 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.385085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5203  conserved membrane spanning protein  24.8 
 
 		 347 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4097  hypothetical protein  20.93 
 
 		 399 aa  55.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5273  hypothetical protein  22.82 
 
 		 312 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1496  hypothetical protein  25 
 
 		 385 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0746  protein of unknown function DUF405  33.06 
 
 		 204 aa  54.7  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.685935 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4804  transmembrane protein  23.12 
 
 		 312 aa  54.7  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2355  protein of unknown function DUF405  30.36 
 
 		 364 aa  54.3  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0179  hypothetical protein  22.9 
 
 		 381 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000571802  hitchhiker  1.74871e-35 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0178  hypothetical protein  21.86 
 
 		 381 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2286  hypothetical protein  24.76 
 
 		 385 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2404  hypothetical protein  35.77 
 
 		 382 aa  53.9  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02081  conserved inner membrane protein  24.94 
 
 		 385 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.452541  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1506  protein of unknown function DUF418  24.94 
 
 		 385 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.253618  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0190  hypothetical protein  29.37 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.55784  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2447  hypothetical protein  25.31 
 
 		 385 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1499  protein of unknown function DUF405  27.2 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2799  hypothetical protein  29.1 
 
 		 414 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1942  hypothetical protein  25.82 
 
 		 391 aa  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.235403  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2290  protein of unknown function DUF405  24.88 
 
 		 391 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.578329  normal  0.0235381 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0285  protein of unknown function DUF418  22.69 
 
 		 409 aa  51.2  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2299  hypothetical protein  24.88 
 
 		 385 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383736 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0814  hypothetical protein  25 
 
 		 385 aa  51.2  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2752  hypothetical protein  34.13 
 
 		 385 aa  50.8  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.915358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2115  protein of unknown function DUF418  23.1 
 
 		 412 aa  50.8  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2882  hypothetical protein  29.1 
 
 		 414 aa  50.4  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2305  hypothetical protein  32.47 
 
 		 391 aa  50.4  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0820  hypothetical protein  28.02 
 
 		 365 aa  49.7  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3087  hypothetical protein  29.08 
 
 		 411 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0017  hypothetical protein  24.52 
 
 		 374 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2541  hypothetical protein  31.75 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0379465  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1538  protein of unknown function DUF405  30 
 
 		 406 aa  48.9  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3078  hypothetical protein  29.27 
 
 		 411 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1289  protein of unknown function DUF405  28.37 
 
 		 401 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3230  hypothetical protein  28.57 
 
 		 411 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2338  hypothetical protein  31.75 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.890901  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2431  hypothetical protein  31.75 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.503306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2383  hypothetical protein  31.75 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.76362 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2427  hypothetical protein  31.75 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.901091 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1608  hypothetical protein  28.87 
 
 		 430 aa  47.4  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1661  transport protein  28.87 
 
 		 430 aa  47  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.414626  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2978  hypothetical protein  29.41 
 
 		 414 aa  46.6  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0076  protein of unknown function DUF418  30.5 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.477208  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1203  hypothetical protein  22.74 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2885  protein of unknown function DUF405  29.45 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.802913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1888  hypothetical protein  25.07 
 
 		 389 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0045  hypothetical protein  20.44 
 
 		 389 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000457904  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4881  hypothetical protein  21.32 
 
 		 390 aa  43.1  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00420784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>