94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3038 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3038  NUDIX hydrolase  100 
 
 
140 aa  281  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.492198  normal  0.600491 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2041  8-oxo-dGTPase  62.86 
 
 
162 aa  161  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  44.12 
 
 
146 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2785  nucleoside triphosphatase YtkD  32.73 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4928  antimutator 8-oxo-(dGTP/GTP)ase  34.94 
 
 
159 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0330  antimutator 8-oxo-(dGTP/GTP)ase  34.94 
 
 
159 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5043  mutT/nudix family protein  34.94 
 
 
159 aa  50.8  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.672649  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4908  antimutator 8-oxo-(dGTP/GTP)ase  34.94 
 
 
159 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4907  antimutator 8-oxo-(dGTP/GTP)ase  34.94 
 
 
159 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4620  nucleoside triphosphatase YtkD  34.94 
 
 
159 aa  50.8  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4541  MutT/NUDIX family pyrophosphohydrolase  34.94 
 
 
159 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4522  MutT family pyrophosphohydrolase  34.94 
 
 
159 aa  50.8  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.986145  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4683  mutT/nudix family protein  34.94 
 
 
159 aa  50.8  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4942  mutT/nudix family protein  34.94 
 
 
159 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1148  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.180064  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1462  mutT/nudix family protein  34.71 
 
 
183 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1047  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 
158 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3459  nucleoside triphosphatase YtkD  33.73 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.160983  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2018  NUDIX hydrolase  28.35 
 
 
181 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0862  NUDIX family hydrolase  37.29 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000267263  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  29.17 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3148  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4226  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 
162 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2466  hypothetical protein  41.33 
 
 
136 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  51.06 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5143  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 
122 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753323  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0122  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 
150 aa  44.3  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.151364  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5139  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  38.52 
 
 
167 aa  43.9  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3228  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043036  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0152  ADP-ribose pyrophosphatase with uncharacterized conserved domain  35.82 
 
 
312 aa  43.9  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3699  NUDIX hydrolase  34.18 
 
 
152 aa  43.9  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224452  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  38.33 
 
 
536 aa  43.5  0.0009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3309  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1029  NUDIX hydrolase  49.02 
 
 
127 aa  42.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3223  hypothetical protein  51.35 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0544  NUDIX hydrolase  37.18 
 
 
166 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4233  NUDIX hydrolase  43.14 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257262  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  41.67 
 
 
181 aa  43.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1044  mutT/nudix family protein  38.81 
 
 
314 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  30.85 
 
 
360 aa  42  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  38.46 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2470  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
298 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  38.46 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 
174 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3410  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 
184 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.564798  normal  0.674483 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0315  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  32.5 
 
 
210 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3404  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 
174 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  37.93 
 
 
363 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  42.65 
 
 
144 aa  41.6  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3111  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 
163 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0922721  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0794  NUDIX family hydrolase  34.55 
 
 
171 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147035  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1747  NAD(+) diphosphatase  36.36 
 
 
282 aa  41.6  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6876  putative ATP/GTP-binding protein  45.9 
 
 
175 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  45.76 
 
 
172 aa  41.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0324  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  31.82 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  29.06 
 
 
183 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0782  MutT/nudix family protein, putative  34.55 
 
 
171 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2431  NUDIX hydrolase  32.94 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960036  normal  0.286625 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13222  NADH pyrophosphatase  35.29 
 
 
313 aa  41.2  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.861891 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  26.92 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1666  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 
305 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  40.38 
 
 
163 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1057  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 
185 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4949  NUDIX hydrolase  37.68 
 
 
152 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.626782  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  30.26 
 
 
141 aa  40.8  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1756  ADP-ribose diphosphatase NudE  28.87 
 
 
183 aa  40.8  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  30.33 
 
 
176 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1282  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 
136 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.838379  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  32.38 
 
 
170 aa  40.8  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4167  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 
183 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.39086 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0596  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 
153 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000504952  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0830  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 
291 aa  40.8  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  41.03 
 
 
171 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 
171 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1314  NUDIX family hydrolase  38.18 
 
 
153 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  51.16 
 
 
141 aa  40.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0227  NUDIX hydrolase  29.9 
 
 
185 aa  40.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.282406  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  40.38 
 
 
158 aa  40  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2131  NUDIX family hydrolase  38.18 
 
 
153 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480915 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  40.38 
 
 
158 aa  40  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  40.38 
 
 
158 aa  40  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
136 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  30.25 
 
 
140 aa  40  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1949  hydrolase, NUDIX family  38.18 
 
 
153 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3701  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 
144 aa  40  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.899383  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 
164 aa  40  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1352  NUDIX family hydrolase  38.18 
 
 
153 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.468385 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  32.18 
 
 
130 aa  40  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1336  NUDIX family hydrolase  38.18 
 
 
153 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0415939 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  32.18 
 
 
130 aa  40  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 
188 aa  40  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>