156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4933 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4933  NLP/P60 protein  100 
 
 		 986 aa  1955    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4327  LGFP repeat protein  43.82 
 
 		 967 aa  218  5e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343026  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2380  LGFP repeat protein  48.32 
 
 		 867 aa  209  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.729285  normal  0.0240945 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0579  hypothetical protein  42.55 
 
 		 308 aa  203  9.999999999999999e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.404895 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2743  NLP/P60 protein  52.25 
 
 		 879 aa  186  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.164483  hitchhiker  0.00858571 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0161  hypothetical protein  42.98 
 
 		 323 aa  179  2e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.124913  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 478 aa  78.2  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  38.28 
 
 		 479 aa  77.4  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  37.04 
 
 		 472 aa  77.4  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2077  NLP/P60 protein  39.85 
 
 		 498 aa  77  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  38.05 
 
 		 535 aa  72.8  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2403  NLP/P60 protein  40.31 
 
 		 505 aa  72  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  38.4 
 
 		 475 aa  71.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  38.4 
 
 		 475 aa  71.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  38.4 
 
 		 475 aa  71.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  37.1 
 
 		 469 aa  71.2  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0902  NLP/P60 protein  41.73 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  37.9 
 
 		 469 aa  70.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5720  NLP/P60 protein  41.73 
 
 		 257 aa  70.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3652  NLP/P60 protein  41.73 
 
 		 257 aa  70.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5288  NLP/P60 protein  41.73 
 
 		 257 aa  70.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.181073 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  37.9 
 
 		 469 aa  70.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07830  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  33.33 
 
 		 372 aa  70.9  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  35.11 
 
 		 467 aa  70.1  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  35.11 
 
 		 467 aa  70.1  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  36.29 
 
 		 469 aa  70.1  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  33.81 
 
 		 317 aa  69.3  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.57 
 
 		 556 aa  69.3  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4472  NLP/P60 protein  38.92 
 
 		 225 aa  68.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  35.48 
 
 		 467 aa  68.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  35 
 
 		 469 aa  69.3  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4557  NLP/P60 protein  40.16 
 
 		 248 aa  68.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  33.87 
 
 		 472 aa  68.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1447  NLP/P60  39.37 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.397182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1465  NLP/P60 protein  39.37 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  34.78 
 
 		 259 aa  67.4  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3688  NLP/P60 protein  38.06 
 
 		 248 aa  67.4  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2429  NLP/P60 protein  42.42 
 
 		 278 aa  67.4  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.328079 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  35.94 
 
 		 432 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  36.54 
 
 		 524 aa  67  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2843  NLP/P60 protein  40.16 
 
 		 256 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.676167 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  38.32 
 
 		 256 aa  67  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5687  NLP/P60 protein  39.37 
 
 		 256 aa  66.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.444646 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5324  NLP/P60 protein  39.37 
 
 		 256 aa  66.2  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  39.13 
 
 		 257 aa  66.2  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2140  NLP/P60 protein  37.9 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000576124  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30760  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.45 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2872  NLP/P60 protein  40.87 
 
 		 164 aa  63.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  36.23 
 
 		 388 aa  62.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  35.04 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  36.89 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0122  NLP/P60 protein  45.71 
 
 		 264 aa  60.8  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  35.38 
 
 		 487 aa  60.8  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 348 aa  60.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1987  NLP/P60 protein  49.09 
 
 		 271 aa  60.5  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  32.06 
 
 		 370 aa  61.2  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1239  NLP/P60  27.54 
 
 		 362 aa  60.1  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00968494  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  34.03 
 
 		 438 aa  60.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1256  NLP/P60 protein  27.54 
 
 		 362 aa  60.1  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.589306 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  33.77 
 
 		 208 aa  60.1  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11507  invasion protein  37.21 
 
 		 253 aa  60.1  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.116745 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  38.53 
 
 		 391 aa  60.1  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  32.09 
 
 		 378 aa  59.7  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1132  NLP/P60 protein  37.27 
 
 		 556 aa  59.3  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000155845  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  40.59 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  31.13 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  32.5 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  35.25 
 
 		 180 aa  58.2  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  33.58 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  33.63 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  31.39 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  31.39 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  31.39 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6442  NLP/P60 protein  34.19 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4593  NLP/P60 protein  34.78 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00530725  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  32.09 
 
 		 378 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3662  NLP/P60 protein  40.59 
 
 		 228 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3442  Peptidase M23  38.89 
 
 		 546 aa  57.4  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  37.63 
 
 		 417 aa  57.4  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  35.14 
 
 		 332 aa  57.4  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  31.67 
 
 		 232 aa  56.6  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  33.07 
 
 		 446 aa  56.2  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2748  NLP/P60 protein  35.88 
 
 		 230 aa  56.2  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.46287  normal  0.819631 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2489  NLP/P60 protein  35.88 
 
 		 221 aa  56.2  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0999493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  38.04 
 
 		 350 aa  55.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  31.29 
 
 		 281 aa  56.2  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0978  NLP/P60 protein  29.2 
 
 		 384 aa  56.2  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  37.84 
 
 		 204 aa  55.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2452  NLP/P60  35.88 
 
 		 241 aa  55.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2497  NLP/P60 protein  35.88 
 
 		 241 aa  55.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1266  NLP/P60 protein  27.27 
 
 		 362 aa  55.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  33.93 
 
 		 345 aa  55.5  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  33.93 
 
 		 333 aa  55.5  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1599  NLP/P60 protein  25.88 
 
 		 368 aa  55.1  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0891153 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  31.71 
 
 		 388 aa  55.1  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  34.29 
 
 		 349 aa  54.7  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11598  inv protein  34.81 
 
 		 249 aa  54.7  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.747429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  34 
 
 		 331 aa  54.3  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  33.61 
 
 		 306 aa  53.9  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  30.63 
 
 		 265 aa  53.9  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>