More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4238 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1602  beta keto-acyl synthase  41.68 
 
 		 2531 aa  700    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1419  erythronolide synthase  41.79 
 
 		 2703 aa  700    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2590  Beta-ketoacyl synthase  42.06 
 
 		 1764 aa  720    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3917  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  40.89 
 
 		 1772 aa  706    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4747  Beta-ketoacyl synthase  39.22 
 
 		 1272 aa  809    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4448  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  40.66 
 
 		 2300 aa  723    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2012  erythronolide synthase  42.92 
 
 		 2298 aa  944    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0926  beta-ketoacyl synthase  36.17 
 
 		 2628 aa  770    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2931  beta-ketoacyl synthase  42.69 
 
 		 2560 aa  652    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103099  normal  0.0735457 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0688  polyketide synthase modules and related proteins-like  44.08 
 
 		 2260 aa  1060    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000350416 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2627  beta-ketoacyl synthase  38.48 
 
 		 2664 aa  831    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1453  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  42.84 
 
 		 2694 aa  702    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2666  beta-ketoacyl synthase  41.9 
 
 		 2657 aa  692    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2733  beta-ketoacyl synthase  41.53 
 
 		 2640 aa  699    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1221  beta-ketoacyl synthase  37.97 
 
 		 2620 aa  820    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2840  beta-ketoacyl synthase  41.7 
 
 		 2624 aa  691    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3101  beta-ketoacyl synthase  42.66 
 
 		 2266 aa  887    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2113  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  47.56 
 
 		 2443 aa  778    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4238  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  100 
 
 		 1845 aa  3617    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1115  erythronolide synthase  41.78 
 
 		 2542 aa  682    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2907  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  40.12 
 
 		 2683 aa  671    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3900  erythronolide synthase  32.62 
 
 		 2674 aa  818    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1684  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  38.25 
 
 		 2661 aa  828    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2267  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  43.03 
 
 		 2249 aa  940    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1326  erythronolide synthase  42.11 
 
 		 2642 aa  699    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1425  beta-ketoacyl synthase  42.31 
 
 		 2693 aa  706    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2929  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  38.09 
 
 		 2704 aa  831    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2665  beta-ketoacyl synthase  42.01 
 
 		 2619 aa  697    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1676  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  42.11 
 
 		 2189 aa  897    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0462  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  44.89 
 
 		 2414 aa  743    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3202  erythronolide synthase  38 
 
 		 2764 aa  820    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2105  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  47.44 
 
 		 2477 aa  792    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1423  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  37.64 
 
 		 2750 aa  829    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3104  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  40.86 
 
 		 2771 aa  636  1e-180  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1963  putative modular PKS system  42 
 
 		 2553 aa  617  1e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00967187 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29560  Type I fatty acid synthase ArsA  36.41 
 
 		 2503 aa  616  9.999999999999999e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  42.04 
 
 		 2314 aa  594  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3954  erythronolide synthase  42.37 
 
 		 2338 aa  595  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0557912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2493  Erythronolide synthase  43.18 
 
 		 2386 aa  575  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1450  Erythronolide synthase  35.25 
 
 		 2327 aa  546  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5615  Beta-ketoacyl synthase  41.86 
 
 		 2816 aa  540  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.129905 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1101  mycocerosate synthase  33.02 
 
 		 3008 aa  499  1e-139  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0135  beta-ketoacyl synthase  32.04 
 
 		 2754 aa  459  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  35.26 
 
 		 1631 aa  447  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0465  beta-ketoacyl synthase  34.15 
 
 		 2772 aa  429  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2494  Beta-ketoacyl synthase  35.16 
 
 		 1453 aa  396  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.96342  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1449  Beta-ketoacyl synthase  34.24 
 
 		 1413 aa  389  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4083  Erythronolide synthase  36.16 
 
 		 1934 aa  387  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.257926  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6351  Erythronolide synthase  33.11 
 
 		 1985 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426704 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  31.16 
 
 		 2462 aa  367  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1238  polyketide synthase  34.4 
 
 		 2888 aa  366  2e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.26 
 
 		 1837 aa  364  7.0000000000000005e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6999  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  35.03 
 
 		 1929 aa  362  4e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355372  hitchhiker  0.00315402 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  32.14 
 
 		 3693 aa  361  9e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  32.14 
 
 		 3693 aa  361  9e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  32.14 
 
 		 3702 aa  360  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2697  beta-ketoacyl synthase  33.78 
 
 		 1923 aa  360  9.999999999999999e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393145  normal  0.42177 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2905  beta-ketoacyl synthase  45.47 
 
 		 3243 aa  358  3.9999999999999996e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5614  Beta-ketoacyl synthase  32.34 
 
 		 1733 aa  358  5.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.30627  normal  0.0396665 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2879  Beta-ketoacyl synthase  44.56 
 
 		 3115 aa  357  2e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  31.53 
 
 		 1372 aa  355  5.9999999999999994e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0927  beta-ketoacyl synthase  32.53 
 
 		 1740 aa  353  1e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.212025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  31.08 
 
 		 1656 aa  353  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  32.69 
 
 		 1574 aa  350  1e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3900  Beta-ketoacyl synthase, Acyl transferase subunit  32.52 
 
 		 1959 aa  346  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5606  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  33.51 
 
 		 7279 aa  347  2e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0551  erythronolide synthase  34.1 
 
 		 1935 aa  347  2e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647535 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1668  Beta-ketoacyl synthase  33.67 
 
 		 2614 aa  346  2.9999999999999997e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  27.97 
 
 		 3099 aa  345  4e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0693  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.8 
 
 		 1984 aa  343  1e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  32.79 
 
 		 3254 aa  343  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  32.13 
 
 		 3676 aa  343  2e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0866  Beta-ketoacyl synthase  31.01 
 
 		 1908 aa  342  2.9999999999999998e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  33.98 
 
 		 4575 aa  341  9e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  29.81 
 
 		 1349 aa  339  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  34.27 
 
 		 4080 aa  339  2.9999999999999997e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  30.9 
 
 		 1349 aa  338  5e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3745  KR domain protein  34.76 
 
 		 1520 aa  338  7.999999999999999e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 		 1816 aa  337  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.01 
 
 		 7110 aa  337  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  31.81 
 
 		 2066 aa  335  3e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  29.98 
 
 		 1587 aa  335  7.000000000000001e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  27.9 
 
 		 1087 aa  332  4e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  31.18 
 
 		 1337 aa  330  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  32.92 
 
 		 7210 aa  329  3e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12949  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsE  30.63 
 
 		 1488 aa  328  6e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.892857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  31.99 
 
 		 3679 aa  328  8.000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  33.69 
 
 		 2374 aa  327  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  31.33 
 
 		 1101 aa  325  5e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3761  amino acid adenylation domain protein  33.22 
 
 		 2682 aa  325  6e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674004  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  32.57 
 
 		 3463 aa  325  6e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  33.03 
 
 		 4151 aa  323  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  32.24 
 
 		 1955 aa  323  3e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  27.73 
 
 		 2551 aa  322  3.9999999999999996e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  33.11 
 
 		 2113 aa  322  6e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  28.83 
 
 		 1646 aa  320  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  32.32 
 
 		 1548 aa  320  1e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  32.77 
 
 		 2376 aa  320  2e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  32.59 
 
 		 1602 aa  320  2e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  29.63 
 
 		 1144 aa  319  3e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>