141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3392 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3392  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 127 aa  261  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000230513  hitchhiker  0.00000668456 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12608  preprotein translocase subunit YajC  40.91 
 
 		 115 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0597309  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1941  preprotein translocase, YajC subunit  53.52 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0541773  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3817  preprotein translocase subunit YajC  43.9 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0436653  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2582  preprotein translocase subunit YajC  45.57 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162406  normal  0.640606 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2275  preprotein translocase subunit YajC  43.04 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2322  preprotein translocase subunit YajC  43.04 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.90527  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2314  preprotein translocase subunit YajC  43.04 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19372  normal  0.374026 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1694  preprotein translocase, YajC subunit  42.61 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15090  preprotein translocase, YajC subunit  48.19 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2303  preprotein translocase, YajC subunit  42.22 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6110  preprotein translocase subunit YajC, putative  40 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.249779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  46.51 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  41.67 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3175  preprotein translocase, YajC subunit  40.86 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2062  preprotein translocase subunit YajC  46.88 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.373337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2092  protein translocase subunit yajC  43.04 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1995  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0113559 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1367  preprotein translocase, YajC subunit  35.62 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.263653 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3052  preprotein translocase, YajC subunit  46.75 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193234  normal  0.994127 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17540  preprotein translocase, YajC subunit  38 
 
 		 127 aa  62  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  35.29 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  33.75 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0700  preprotein translocase subunit YajC  40.7 
 
 		 86 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000310911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1372  protein translocase subunit yajC  35.05 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3133  preprotein translocase subunit YajC  39.51 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1797  preprotein translocase, YajC subunit  37.5 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284758  normal  0.10344 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3825  preprotein translocase YajC subunit  31.25 
 
 		 123 aa  57  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0618005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4535  preprotein translocase subunit YajC  38.37 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000852882  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4311  preprotein translocase subunit YajC  38.37 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000102118  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4149  preprotein translocase subunit YajC  38.37 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000425836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4646  preprotein translocase subunit YajC  38.37 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00688005  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4496  preprotein translocase subunit YajC  38.37 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000482906 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4160  preprotein translocase subunit YajC  35.8 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152675  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1342  preprotein translocase, YajC subunit  41.18 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0529442  normal  0.794399 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1669  preprotein translocase, YajC subunit  42.16 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698269  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4501  preprotein translocase subunit YajC  35.8 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906179  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  39.13 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4550  preprotein translocase subunit YajC  35.8 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000437166  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2030  preprotein translocase, YajC subunit  29.29 
 
 		 181 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000255015 
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  39.13 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4263  preprotein translocase subunit YajC  38.37 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2355  preprotein translocase, YajC subunit  32.22 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0840  preprotein translocase, YajC subunit  35.87 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151299  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3173  preprotein translocase, YajC subunit  34.74 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2733  preprotein translocase, YajC subunit  35.79 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  35.87 
 
 		 146 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  36.78 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12870  preprotein translocase, YajC subunit  36.9 
 
 		 152 aa  51.6  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.195332  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  35.87 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  34.78 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2108  preprotein translocase, YajC subunit  30.43 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  36.78 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4229  preprotein translocase, YajC subunit  39.36 
 
 		 110 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4599  preprotein translocase, YajC subunit  39.36 
 
 		 110 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0858963  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0416  preprotein translocase subunit YajC  36.78 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2300  protein translocase subunit yajC  30.95 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0562615  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13970  preprotein translocase, YajC subunit  34.94 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  35.87 
 
 		 113 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0715  preprotein translocase, YajC subunit  29.63 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1495  preprotein translocase, YajC subunit  37.21 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.528936 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  35.79 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  35.79 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  35 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0530  protein translocase subunit yajC  31.91 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  29.63 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  32.26 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4748  preprotein translocase, YajC subunit  36.05 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0608539 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  36.23 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  36.23 
 
 		 105 aa  45.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  34.09 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  30.26 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  35.44 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  32.94 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  26.92 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  36.26 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  34.88 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5143  preprotein translocase, YajC subunit  32.74 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.261853  hitchhiker  0.00047755 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2112  preprotein translocase, YajC subunit  40.26 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00156357  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1917  preprotein translocase subunit YajC  30.49 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000185631  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2074  protein translocase subunit yajC  30.95 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721534  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  32.1 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  30.56 
 
 		 106 aa  44.3  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  28.21 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  31.4 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4088  preprotein translocase, YajC subunit  32.97 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2388  protein translocase subunit yajC  29.67 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  27.96 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  24.44 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  31.43 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0391  preprotein translocase, YajC subunit  32.05 
 
 		 121 aa  43.5  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000430502  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1695  preprotein translocase, YajC subunit  30.77 
 
 		 86 aa  43.5  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1728  preprotein translocase, YajC subunit  30.77 
 
 		 86 aa  43.5  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136772  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  34.15 
 
 		 95 aa  43.5  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  35.96 
 
 		 107 aa  43.5  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1715  preprotein translocase, YajC subunit  32.94 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  35.96 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  35.96 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12913  preprotein translocase, YajC subunit  33.73 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.168019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>