97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3322 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3322  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 459 aa  888    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0090517  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0302  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  30.21 
 
 		 389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.93515  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1751  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  24.8 
 
 		 399 aa  110  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2701  3-dehydroquinate synthase  27.7 
 
 		 451 aa  104  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2896  3-dehydroquinate synthase  33.33 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46656  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1503  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  31.63 
 
 		 454 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4002  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  38.35 
 
 		 423 aa  99  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2721  3-dehydroquinate synthase  28.52 
 
 		 403 aa  97.8  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0871  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P))  30.46 
 
 		 419 aa  96.7  7e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0971202  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0802  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  24.5 
 
 		 405 aa  96.7  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00306069  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0219  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  31.61 
 
 		 354 aa  96.7  8e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0627  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  26.67 
 
 		 403 aa  95.1  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0652  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  24.18 
 
 		 403 aa  94  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2486  3-dehydroquinate synthase  30.93 
 
 		 353 aa  91.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00205436  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0112  glycerol dehydrogenase-like protein  31.82 
 
 		 356 aa  92  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1032  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  31.06 
 
 		 357 aa  91.3  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1084  AraM protein  28.77 
 
 		 419 aa  90.5  6e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0291  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  31.77 
 
 		 356 aa  90.1  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0604  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  30.93 
 
 		 352 aa  88.6  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0281363  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2255  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  30.24 
 
 		 351 aa  85.5  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.259775 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1729  3-dehydroquinate synthase  27.27 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4488  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  32.83 
 
 		 355 aa  85.1  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_002978  WD0787  araM protein  30.14 
 
 		 418 aa  84.3  0.000000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.497052  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5002  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  31.96 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3015  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  30.25 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.397676  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0536  3-dehydroquinate synthase  26.83 
 
 		 351 aa  81.3  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000000695262  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0723  3-dehydroquinate synthase  32.32 
 
 		 352 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.731489  normal  0.0127257 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0655  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  29.25 
 
 		 350 aa  81.3  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46328  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3139  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  27.55 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.419716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1355  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  31.16 
 
 		 352 aa  80.1  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1971  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  28.86 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2535  3-dehydroquinate synthase  29.7 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1308  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  27.15 
 
 		 360 aa  76.6  0.0000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0948  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  25.41 
 
 		 359 aa  76.3  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0518  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  27.19 
 
 		 341 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0418101  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1136  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  25 
 
 		 359 aa  75.5  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3191  3-dehydroquinate synthase  30.61 
 
 		 353 aa  75.5  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1578  3-dehydroquinate synthase  30.56 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4107  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  29.46 
 
 		 357 aa  74.7  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1960  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  27.64 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.990143 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1225  3-dehydroquinate synthase  28.37 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5680  3-dehydroquinate synthase  28.39 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1913  3-dehydroquinate synthase  31.55 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00367507  decreased coverage  0.000286832 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3866  3-dehydroquinate synthase  33.54 
 
 		 355 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.948172 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0940  AraM domain-containing protein  25 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.041205  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0711  3-dehydroquinate synthase  26.69 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1231  3-dehydroquinate synthase  31.19 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0263473  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1816  3-dehydroquinate synthase  25.74 
 
 		 351 aa  67.8  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2533  putative glycerol 1-phosphate dehydrogenase  29.03 
 
 		 349 aa  67  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1689  3-dehydroquinate synthase  25 
 
 		 342 aa  65.9  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0528349  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1827  3-dehydroquinate synthase  27.03 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0648145  normal  0.20433 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0566  3-dehydroquinate synthase  24.4 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2045  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  27.52 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1469  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  23.21 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194336  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0902  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.65 
 
 		 373 aa  55.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2706  iron-containing alcohol dehydrogenase  35 
 
 		 366 aa  55.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0333  glycerol dehydrogenase  27.66 
 
 		 362 aa  55.1  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1239  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  27.42 
 
 		 334 aa  53.9  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1653  glycerol dehydrogenase  34.58 
 
 		 398 aa  53.5  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218949  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4273  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.4 
 
 		 368 aa  53.1  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0730  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  29.44 
 
 		 334 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  39.33 
 
 		 364 aa  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  39.33 
 
 		 364 aa  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2109  glycerol dehydrogenase  25.79 
 
 		 366 aa  51.2  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0658599  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001639  glycerol dehydrogenase  25.82 
 
 		 360 aa  50.4  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4112  3-dehydroquinate synthase  32.67 
 
 		 321 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3838  glycerol dehydrogenase  33.66 
 
 		 369 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.200623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3730  glycerol dehydrogenase  34.65 
 
 		 369 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3899  glycerol dehydrogenase  33.66 
 
 		 369 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.406608  normal  0.540531 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3796  glycerol dehydrogenase  33.66 
 
 		 369 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0209909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1690  glycerol dehydrogenase  34.09 
 
 		 367 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3356  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 		 378 aa  47.4  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.875561  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0734  glycerol dehydrogenase  26.42 
 
 		 365 aa  46.6  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09901  putative glycerol dehydrogenase  26.32 
 
 		 417 aa  46.6  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4570  glycerol dehydrogenase  29.19 
 
 		 365 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1388  putative glycerol dehydrogenase  26.15 
 
 		 366 aa  46.6  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.106406  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4031  glycerol dehydrogenase  32.58 
 
 		 367 aa  46.2  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1386  3-dehydroquinate synthase  29.3 
 
 		 321 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.593428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2285  glycerol dehydrogenase  31.91 
 
 		 359 aa  45.8  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.370062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4432  glycerol dehydrogenase  30.56 
 
 		 367 aa  45.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4393  glycerol dehydrogenase  30.56 
 
 		 367 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652154 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5406  glycerol dehydrogenase  29.91 
 
 		 367 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4180  glycerol dehydrogenase  30.56 
 
 		 367 aa  45.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03831  glycerol dehydrogenase  30.56 
 
 		 367 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4040  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.56 
 
 		 367 aa  45.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1067  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.52 
 
 		 364 aa  44.7  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000211882  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4485  glycerol dehydrogenase  30.56 
 
 		 367 aa  45.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4070  glycerol dehydrogenase  30.56 
 
 		 367 aa  45.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03780  hypothetical protein  30.56 
 
 		 367 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4440  glycerol dehydrogenase  30.34 
 
 		 367 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.91593 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3814  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.58 
 
 		 380 aa  44.3  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.594531  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0016  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.58 
 
 		 396 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.537378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4443  glycerol dehydrogenase  30.34 
 
 		 367 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0136708 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4325  glycerol dehydrogenase  30.34 
 
 		 367 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4356  glycerol dehydrogenase  30.34 
 
 		 367 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4859  glycerol dehydrogenase  30.85 
 
 		 360 aa  43.9  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2801  glycerol dehydrogenase  25.46 
 
 		 395 aa  43.9  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>