More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2848 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2848  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 118 aa  233  9e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000188384  normal  0.0300767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1535  ArsR family transcriptional regulator  74.19 
 
 		 142 aa  178  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0449302 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0241  ArsR family transcriptional regulator  76.07 
 
 		 119 aa  157  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000436096 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1865  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 105 aa  89.4  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4480  transcriptional regulator, ArsR family  52.04 
 
 		 152 aa  88.2  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0251  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  41.24 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2551  regulatory protein ArsR  42.71 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365475  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  40.95 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3867  regulatory protein ArsR  40.54 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248206  normal  0.706318 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3353  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 98 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0900  putative regulatory protein  42 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2602  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2464  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889424  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 104 aa  67  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  43.3 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6292  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0561  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  40.66 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0248  regulatory protein ArsR  39.18 
 
 		 109 aa  62  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  37.61 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2692  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 250 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0598068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2736  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 250 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.341929  normal  0.257848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2722  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 250 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.430326 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1120  transcriptional regulator, ArsR family  36.45 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.360075 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  29.13 
 
 		 105 aa  60.1  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 437 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12026  transcriptional regulator  40.21 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  26.67 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11840  transcriptional regulator, ArsR family  41.57 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3937  regulatory protein, ArsR  38.75 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  29.13 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  35.64 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8897  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.86 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  39.78 
 
 		 111 aa  57  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_003296  RS04778  putative transcription regulator protein  33.64 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05659  putative transcription regulator protein  33.64 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4133  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  32.58 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5370  ArsR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  30.48 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25700  transcriptional regulator, ArsR family  37.08 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0828  transcriptional regulator, ArsR family  40.66 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196547  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0625  ArsR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.906206 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2454  ArsR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  23.08 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1841  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0064194  normal  0.0655813 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  38.75 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  32.43 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  27.18 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  27.88 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1684  transcriptional regulator, ArsR family  39.71 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0485  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  36.17 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0777  transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 		 267 aa  53.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 107 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20650  transcriptional regulator, ArsR family  38.2 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1802  ArsR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.35409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 107 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 107 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3902  regulatory protein, ArsR  43.24 
 
 		 109 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  37.25 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  35.19 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3981  helix-turn-helix, type 11  31.96 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6785  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336525 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  28.16 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  33 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  33 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  32.29 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 		 115 aa  51.6  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>