More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3296 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3296  ABC transporter-related protein  100 
 
 
254 aa  503  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2957  ABC transporter related  72.83 
 
 
253 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.428203  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3001  ABC transporter related  72.83 
 
 
253 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2972  ABC transporter related  72.44 
 
 
253 aa  361  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577576  normal  0.0110597 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11703  ATP-binding protein ABC transporter  71.89 
 
 
255 aa  335  5e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.228043 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0578  ABC transporter related  56.12 
 
 
238 aa  265  5e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3177  ABC transporter related  59.83 
 
 
245 aa  265  5.999999999999999e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3402  ABC transporter related  58.08 
 
 
245 aa  265  7e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.273251  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5570  ABC transporter related  61.74 
 
 
239 aa  258  9e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0010719  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0478  ABC transporter related  56.65 
 
 
249 aa  250  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0417  ABC transporter related protein  56.38 
 
 
251 aa  244  9.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1367  ABC transporter related  56.96 
 
 
254 aa  242  5e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.181085  normal  0.116332 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2393  ABC transporter related protein  56.07 
 
 
243 aa  241  7.999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  58.06 
 
 
283 aa  225  6e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0971989 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3632  ABC transporter related  56.19 
 
 
247 aa  221  8e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0781303 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4952  ABC transporter related  52.94 
 
 
522 aa  199  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.221513  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1757  ABC transporter related protein  39.48 
 
 
242 aa  184  9e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1670  ABC transporter related  43.98 
 
 
286 aa  181  1e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2351  ABC transporter related  37.66 
 
 
241 aa  180  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2280  ABC transporter, ATP-binding protein  37.18 
 
 
248 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  42.98 
 
 
328 aa  177  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  40.09 
 
 
308 aa  177  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2543  ABC transporter, ATP-binding protein  37.23 
 
 
241 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0189029  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2817  ABC transporter, ATP-binding protein  37.66 
 
 
241 aa  176  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000055969 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_717  ABC transporter, ATP-binding protein  41.32 
 
 
248 aa  176  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.308097  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2598  ABC transporter, ATP-binding protein  36.32 
 
 
241 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0813  ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 
248 aa  175  6e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2506  ABC transporter, ATP-binding protein  37.66 
 
 
241 aa  175  6e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0733  ABC transporter related  41.18 
 
 
248 aa  174  9e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0344871  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  39.3 
 
 
335 aa  174  9e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  40.89 
 
 
593 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2322  ABC transporter, ATP-binding protein  36.32 
 
 
248 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00275185  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.92 
 
 
322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0568  ABC transporter related  39.48 
 
 
241 aa  171  9e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  38.98 
 
 
921 aa  171  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2555  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 
241 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14155e-24 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2117  ABC transporter related  37.99 
 
 
244 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.101378  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0167  response regulator receiver domain-containing protein  38.27 
 
 
921 aa  170  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000281851 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  39.17 
 
 
308 aa  170  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2364  ABC transporter ATP-binding protein  38.32 
 
 
222 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2541  ABC transporter ATP-binding protein  38.32 
 
 
222 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.534953  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  39.63 
 
 
308 aa  169  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0759  ABC transporter related  42.68 
 
 
918 aa  169  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207246  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  40.61 
 
 
312 aa  169  5e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  38.52 
 
 
922 aa  169  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  38.56 
 
 
255 aa  168  6e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  40.18 
 
 
340 aa  167  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  36.93 
 
 
318 aa  167  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  36.63 
 
 
323 aa  167  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  40.89 
 
 
309 aa  167  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000626362  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0439  ABC transporter related  44.95 
 
 
283 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  40.53 
 
 
322 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.66 
 
 
907 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  37.93 
 
 
933 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0018  ABC transporter, ATP-binding protein  34.05 
 
 
234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  38.52 
 
 
906 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  43.13 
 
 
326 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  32.44 
 
 
541 aa  165  6.9999999999999995e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0257  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.93 
 
 
248 aa  165  6.9999999999999995e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  37.34 
 
 
346 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1778  ABC transporter related protein  42.66 
 
 
317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0112874  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  38.33 
 
 
327 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  40.57 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  38.33 
 
 
346 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  42.45 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0695  ABC transporter related protein  40.1 
 
 
328 aa  162  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0170  ABC-2 type transport system  37.55 
 
 
925 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.476544  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2483  ABC transporter related  39.09 
 
 
592 aa  163  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  38.33 
 
 
346 aa  163  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2862  ABC transporter, ATP-binding protein  39.09 
 
 
592 aa  163  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  36.4 
 
 
589 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  39.04 
 
 
317 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1587  ABC transporter related  40.37 
 
 
299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119219  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3577  ABC transporter related  37.7 
 
 
930 aa  161  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  37.89 
 
 
318 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  36.72 
 
 
932 aa  161  8.000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  37.5 
 
 
914 aa  161  8.000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  37.7 
 
 
915 aa  161  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  37.89 
 
 
318 aa  161  9e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  37.89 
 
 
318 aa  161  9e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  37.89 
 
 
318 aa  161  9e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  37.33 
 
 
313 aa  160  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3775  ABC transporter, ATP binding protein  37.04 
 
 
911 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.36 
 
 
914 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  40.98 
 
 
307 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4831  ABC transporter, ATP binding protein  37.04 
 
 
911 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0229  ABC transporter related  37.04 
 
 
911 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4311  ABC transporter related  42.18 
 
 
317 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3836  ABC transporter, ATP binding protein  37.04 
 
 
911 aa  160  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.932304  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3685  ABC transporter, ATP binding protein  37.04 
 
 
911 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  38.94 
 
 
667 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0316  ABC transporter related  37.6 
 
 
901 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3968  ABC transporter, ATP binding protein  37.04 
 
 
911 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03336  fused ribosome-associated ATPase: ATP-binding protein/ATP-binding protein/predicted membrane protein  37.04 
 
 
911 aa  159  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0228  ABC transporter related protein  37.04 
 
 
911 aa  159  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03288  hypothetical protein  37.04 
 
 
911 aa  159  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1381  ABC transporter related  38.87 
 
 
587 aa  159  4e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341514 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4664  ABC transporter related  37.07 
 
 
927 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2447  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  39.6 
 
 
305 aa  159  6e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.436893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  37.34 
 
 
916 aa  158  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>