More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2333 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  100 
 
 
432 aa  858    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  42.53 
 
 
478 aa  343  4e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  43.04 
 
 
475 aa  332  8e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  43.04 
 
 
475 aa  332  8e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  43.04 
 
 
475 aa  332  8e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  43.28 
 
 
472 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  44.52 
 
 
469 aa  325  1e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  42.83 
 
 
467 aa  319  6e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  42.14 
 
 
467 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  42.14 
 
 
467 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  42.73 
 
 
469 aa  311  1e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  42.73 
 
 
469 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  42.73 
 
 
469 aa  310  4e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  42.5 
 
 
469 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  46 
 
 
472 aa  302  9e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  57.38 
 
 
479 aa  228  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4472  NLP/P60 protein  51.22 
 
 
225 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168401  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1447  NLP/P60  54.89 
 
 
256 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.397182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1465  NLP/P60 protein  54.89 
 
 
256 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5288  NLP/P60 protein  55.98 
 
 
257 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.181073 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5687  NLP/P60 protein  54.11 
 
 
256 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.444646 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5720  NLP/P60 protein  55.98 
 
 
257 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3652  NLP/P60 protein  55.98 
 
 
257 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387493  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5324  NLP/P60 protein  54.11 
 
 
256 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2489  NLP/P60 protein  46.08 
 
 
221 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0999493  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2452  NLP/P60  47.09 
 
 
241 aa  193  6e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2497  NLP/P60 protein  47.09 
 
 
241 aa  193  6e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4529  NLP/P60 protein  48.94 
 
 
239 aa  193  6e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.612016  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2843  NLP/P60 protein  55.43 
 
 
256 aa  193  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.676167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4557  NLP/P60 protein  54.74 
 
 
248 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3688  NLP/P60 protein  53.14 
 
 
248 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0902  NLP/P60 protein  53.68 
 
 
256 aa  190  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11507  invasion protein  61.43 
 
 
253 aa  187  5e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.116745 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2748  NLP/P60 protein  47 
 
 
230 aa  183  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.46287  normal  0.819631 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2403  NLP/P60 protein  60.14 
 
 
505 aa  179  5.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3662  NLP/P60 protein  49.74 
 
 
228 aa  178  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2872  NLP/P60 protein  54.44 
 
 
164 aa  176  9e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2140  NLP/P60 protein  58.65 
 
 
427 aa  175  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000576124  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11598  inv protein  57.69 
 
 
249 aa  159  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.747429  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2077  NLP/P60 protein  48.92 
 
 
498 aa  149  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3253  NLP/P60 protein  42.29 
 
 
214 aa  128  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.821613  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2702  NLP/P60 protein  41.49 
 
 
204 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2970  NLP/P60 protein  40.68 
 
 
208 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.382665  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  43.88 
 
 
388 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2672  NLP/P60  40.96 
 
 
204 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0993565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2717  NLP/P60 protein  40.96 
 
 
204 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0128692  normal  0.0892786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  45.52 
 
 
337 aa  109  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  45.08 
 
 
388 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  39.44 
 
 
531 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  41.59 
 
 
394 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  42.74 
 
 
388 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  42.59 
 
 
340 aa  97.8  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  37.25 
 
 
438 aa  97.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  37.8 
 
 
321 aa  97.1  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  40.41 
 
 
342 aa  94.4  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  39.69 
 
 
625 aa  94  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  41.18 
 
 
337 aa  94  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2085  NLP/P60 protein  42.61 
 
 
447 aa  93.6  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  39.29 
 
 
458 aa  93.2  7e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  45.05 
 
 
308 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  38.52 
 
 
487 aa  92.4  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  41.23 
 
 
417 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  44.17 
 
 
350 aa  90.5  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3442  Peptidase M23  41.48 
 
 
546 aa  89.4  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  46.77 
 
 
411 aa  88.2  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  33.97 
 
 
1048 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  42.11 
 
 
495 aa  87.8  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  36.22 
 
 
395 aa  87.4  4e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  37.7 
 
 
452 aa  87.8  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  39.62 
 
 
180 aa  87  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  36.88 
 
 
332 aa  87.4  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  39.81 
 
 
337 aa  84  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  34.68 
 
 
283 aa  83.2  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  38.58 
 
 
378 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  31.71 
 
 
271 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  31.71 
 
 
271 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  31.71 
 
 
271 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  31.71 
 
 
271 aa  82.4  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  34.68 
 
 
283 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  36.36 
 
 
476 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  31.71 
 
 
271 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  31.71 
 
 
271 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  31.71 
 
 
271 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  43.69 
 
 
265 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  38.21 
 
 
400 aa  82.4  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  31.71 
 
 
271 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  40.37 
 
 
345 aa  82.4  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  34.68 
 
 
283 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156191  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  38.14 
 
 
378 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  31.71 
 
 
275 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  34.64 
 
 
348 aa  82.4  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  40 
 
 
331 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  38.6 
 
 
459 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  40.52 
 
 
393 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  37.31 
 
 
197 aa  81.6  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  35.16 
 
 
475 aa  82  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  37.31 
 
 
204 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  34.48 
 
 
374 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  38.98 
 
 
366 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  39.62 
 
 
390 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>