247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2146 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2146  phage integrase family protein  100 
 
 		 663 aa  1353    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5578  phage integrase  44.3 
 
 		 721 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5981  phage integrase family protein  44.3 
 
 		 721 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.259227 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1705  phage integrase family protein  44.3 
 
 		 737 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06600  site-specific recombinase, integrase family  50.44 
 
 		 491 aa  439  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101148  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20690  site-specific recombinase, integrase family  50.36 
 
 		 426 aa  407  1.0000000000000001e-112  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4149  integrase family protein  36.38 
 
 		 498 aa  270  8e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.353708 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4539  transposase B  32.4 
 
 		 637 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1750  phage integrase family protein  32.76 
 
 		 630 aa  225  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00214495  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1223  Tn554, transposase B  32.76 
 
 		 630 aa  225  2e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.559956  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1346  Tn554, transposase B  32.76 
 
 		 630 aa  225  2e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2507  transposase B  32.76 
 
 		 630 aa  225  2e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0042  phage integrase family protein  32.76 
 
 		 630 aa  225  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0042  phage integrase family protein  32.76 
 
 		 630 aa  225  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1716  phage integrase family protein  32.76 
 
 		 630 aa  225  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0068  integrase family protein  30.06 
 
 		 461 aa  118  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5435  hypothetical protein  42.11 
 
 		 352 aa  115  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1465  Tn554-related, transposase B  26.51 
 
 		 675 aa  110  6e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000329851  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2584  integrase family protein  29.8 
 
 		 608 aa  97.4  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4727  integrase family protein  29.8 
 
 		 608 aa  97.8  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2671  integrase family protein  29.8 
 
 		 608 aa  97.4  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3615  integrase family protein  29.01 
 
 		 638 aa  97.4  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00140934  normal  0.0339314 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0987  Tn554-related, transposase B  27.07 
 
 		 708 aa  94.4  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.376449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3148  Tn554-related, transposase B  28.94 
 
 		 701 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0001  Tn554-related, transposase B  28.94 
 
 		 684 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.289716  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4644  phage integrase family protein  25.3 
 
 		 637 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1427  phage integrase family protein  35.23 
 
 		 739 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5399  phage integrase family protein  30.92 
 
 		 741 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.558609 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0456  phage integrase family protein  28.44 
 
 		 647 aa  89  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0513  phage integrase family protein  30.92 
 
 		 741 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3588  phage integrase family protein  28.44 
 
 		 647 aa  89  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00892563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5419  phage integrase family protein  30.92 
 
 		 741 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244002 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5498  phage integrase family protein  28.44 
 
 		 647 aa  89  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0479  phage integrase family protein  27.84 
 
 		 724 aa  84.7  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3897  phage integrase family protein  27.84 
 
 		 724 aa  84.7  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3903  phage integrase family protein  27.84 
 
 		 724 aa  84.7  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5934  phage integrase family protein  27.84 
 
 		 724 aa  84.7  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2521  integrase family protein  27.48 
 
 		 617 aa  84.3  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000524212  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1238  integrase family protein  27.48 
 
 		 617 aa  84.3  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.375916 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1114  phage integrase family protein  27.02 
 
 		 637 aa  84  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3699  integrase family protein  26.64 
 
 		 719 aa  82.8  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0398005  normal  0.195076 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1216  integrase family protein  26.64 
 
 		 719 aa  82.8  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.324318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3468  integrase family protein  26.64 
 
 		 719 aa  82.8  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00341973  normal  0.0358232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3586  integrase family protein  26.64 
 
 		 719 aa  82.8  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.186678  hitchhiker  0.00677249 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3043  integrase family protein  26.64 
 
 		 719 aa  82.8  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00307933  hitchhiker  0.00706888 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3604  integrase family protein  26.64 
 
 		 719 aa  82.8  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0140825  normal  0.0766423 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3741  integrase family protein  26.64 
 
 		 719 aa  82.8  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  0.164108 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  26.41 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  22.97 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1297  phage integrase family protein  23.98 
 
 		 295 aa  63.5  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4793  phage integrase family protein  24.09 
 
 		 797 aa  62.4  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2264  phage integrase family protein  24.09 
 
 		 797 aa  62.4  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2973  phage integrase family protein  24.09 
 
 		 797 aa  62.4  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  26.89 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0574  integrase family protein  23.58 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1579  integrase family protein  23.3 
 
 		 744 aa  61.6  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.415833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  25.28 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  27.34 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  23.26 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  25.1 
 
 		 295 aa  60.1  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  26.46 
 
 		 295 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  25.1 
 
 		 295 aa  60.1  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  24.63 
 
 		 311 aa  60.1  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0069  integrase family protein  21.73 
 
 		 517 aa  59.7  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0245  integrase family protein  27.39 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  24.25 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  22.64 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0992  phage integrase family protein  24.56 
 
 		 806 aa  57.4  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  23.9 
 
 		 311 aa  57  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2484  phage integrase  26.02 
 
 		 304 aa  57  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72317  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  25.24 
 
 		 362 aa  57  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1762  integrase family protein  26.56 
 
 		 306 aa  56.2  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00191766  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  22.71 
 
 		 302 aa  56.2  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0626  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.64 
 
 		 315 aa  54.3  0.000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  23.53 
 
 		 295 aa  54.3  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1647  integrase domain protein SAM domain protein  25.5 
 
 		 317 aa  54.3  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4521  phage integrase family protein  26.92 
 
 		 803 aa  53.9  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0704652  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3610  integrase family protein  23.17 
 
 		 827 aa  53.9  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00523009  normal  0.0387105 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  27.24 
 
 		 308 aa  53.5  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  23.2 
 
 		 328 aa  53.5  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  25.93 
 
 		 318 aa  53.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  25.5 
 
 		 295 aa  52  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1924  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.41 
 
 		 325 aa  52.4  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  28.24 
 
 		 303 aa  52  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000635712  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5336  integrase family protein  25.93 
 
 		 378 aa  52.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2241  integrase family protein  24.43 
 
 		 345 aa  52.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.640527  hitchhiker  0.000757999 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  25.75 
 
 		 295 aa  52.4  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.81 
 
 		 298 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0949  phage integrase family protein  20.82 
 
 		 275 aa  51.6  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.427827  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.48 
 
 		 317 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  23.31 
 
 		 308 aa  51.6  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11843  putative transposase  24.45 
 
 		 416 aa  51.6  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.383494  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3331  tyrosine recombinase XerD  23.49 
 
 		 300 aa  51.2  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  25.47 
 
 		 303 aa  51.6  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  26.75 
 
 		 311 aa  51.2  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1698  integrase family protein  26.1 
 
 		 314 aa  50.8  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  22.73 
 
 		 307 aa  50.8  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1994  integrase family protein  28 
 
 		 315 aa  50.4  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000947418  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0795  tyrosine recombinase XerD  24.7 
 
 		 300 aa  50.8  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3228  tyrosine recombinase XerD  24.7 
 
 		 300 aa  50.4  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.302685  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>