71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1707 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 
172 aa  348  2e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  90.12 
 
 
181 aa  305  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  78.49 
 
 
172 aa  292  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  78.49 
 
 
172 aa  292  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  77.91 
 
 
172 aa  290  8e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  68.6 
 
 
172 aa  247  5e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  54.39 
 
 
185 aa  204  6e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  48.54 
 
 
170 aa  171  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  47.56 
 
 
203 aa  157  6e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1045  membrane-flanked domain protein  46.75 
 
 
182 aa  146  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  42.5 
 
 
181 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0795  membrane-flanked domain-containing protein  46.3 
 
 
175 aa  119  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311521  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  36.08 
 
 
174 aa  104  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  36.25 
 
 
189 aa  100  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  35 
 
 
189 aa  96.3  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  31.68 
 
 
479 aa  94.7  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  33.73 
 
 
166 aa  94.4  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  33.95 
 
 
169 aa  92.8  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  36.6 
 
 
180 aa  92.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0703  hypothetical protein  38.79 
 
 
167 aa  90.1  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0154  membrane-flanked domain protein  31.28 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  42.42 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4362  membrane-flanked domain protein  34.48 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3493  membrane-flanked domain-containing protein  43.37 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  27.33 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  27.33 
 
 
283 aa  71.6  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  30.19 
 
 
227 aa  71.6  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  26.9 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0579  membrane-flanked domain-containing protein  31.21 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1284  membrane-flanked domain-containing protein  25.61 
 
 
208 aa  60.5  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.935757  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  27.11 
 
 
229 aa  58.9  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  23.95 
 
 
179 aa  58.2  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  32.53 
 
 
219 aa  58.2  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  25.15 
 
 
179 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3728  membrane-flanked domain protein  29.63 
 
 
176 aa  55.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.557347  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  27.61 
 
 
186 aa  55.1  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  28.24 
 
 
176 aa  54.7  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  33.85 
 
 
174 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  25.23 
 
 
247 aa  53.9  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4260  membrane-flanked domain protein  29.17 
 
 
243 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1656  membrane-flanked domain-containing protein  36.62 
 
 
229 aa  52  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125781  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  29.55 
 
 
232 aa  50.8  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1403  hypothetical protein  25.32 
 
 
165 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1602  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  26.09 
 
 
170 aa  49.7  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2576  membrane-flanked domain-containing protein  26.67 
 
 
146 aa  49.7  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.261166  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0020  hypothetical protein  36.67 
 
 
170 aa  50.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.715756  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3541  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.543439 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0078  hypothetical protein  26.12 
 
 
158 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_002950  PG1471  hypothetical protein  23.53 
 
 
155 aa  48.1  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  27.27 
 
 
186 aa  48.1  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  27.14 
 
 
245 aa  47.8  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1361  membrane-flanked domain  25.16 
 
 
172 aa  47  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.30148  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4835  membrane-flanked domain protein  31.11 
 
 
169 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2654  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2524  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2068  hypothetical protein  23.91 
 
 
175 aa  46.6  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0847  hypothetical protein  29.23 
 
 
371 aa  46.6  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0096  hypothetical membrane associated protein  23.91 
 
 
180 aa  46.6  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.129963  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1511  hypothetical protein  26.29 
 
 
170 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000724877 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1328  membrane-flanked domain protein  22.32 
 
 
198 aa  45.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000392278 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2360  membrane-flanked domain protein  24.84 
 
 
282 aa  45.4  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2966  membrane-flanked domain-containing protein  31.03 
 
 
176 aa  44.7  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  31.03 
 
 
561 aa  44.3  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8563  hypothetical protein  22.82 
 
 
252 aa  44.3  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.010554 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3601  membrane-flanked domain protein  29.47 
 
 
173 aa  43.9  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2832  membrane-flanked domain protein  41.67 
 
 
658 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.578918  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3389  membrane-flanked domain protein  26 
 
 
172 aa  42.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0554186  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3182  membrane-flanked domain-containing protein  26.12 
 
 
178 aa  41.2  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1149  membrane-flanked domain protein  31.48 
 
 
126 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  31.34 
 
 
554 aa  40.8  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2927  membrane-flanked domain protein  25 
 
 
190 aa  40.8  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>