More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0130 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0130  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  449  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0715  regulatory protein GntR, HTH  82.89 
 
 		 234 aa  377  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0114  GntR family transcriptional regulator  75 
 
 		 231 aa  315  5e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0123  GntR family transcriptional regulator  75 
 
 		 251 aa  314  6e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.409483  normal  0.0318508 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0104  GntR family transcriptional regulator  75 
 
 		 251 aa  314  6e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.99437  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3134  regulatory protein GntR HTH  57.01 
 
 		 238 aa  224  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.998254  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10166  GntR family transcriptional regulator  68.59 
 
 		 264 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1495  regulatory protein GntR HTH  49.32 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4360  transcriptional regulator, GntR family  42.92 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4638  transcriptional regulator, GntR family  42.31 
 
 		 258 aa  134  8e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1760  GntR family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 222 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.298302  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1807  GntR family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 222 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.521171 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1741  GntR family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 222 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00122783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4366  GntR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1978  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  32.74 
 
 		 227 aa  99  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4183  regulatory protein GntR HTH  31.78 
 
 		 222 aa  98.2  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3493  GntR family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 270 aa  95.9  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.671641 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 233 aa  92.8  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 235 aa  92.4  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  29.11 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 229 aa  89.7  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6303  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 234 aa  88.6  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 225 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  36.93 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 233 aa  85.9  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 256 aa  85.5  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1773  transcriptional regulator, GntR family  28.73 
 
 		 223 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.851704  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  48.18 
 
 		 222 aa  85.1  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 233 aa  84.7  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1834  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  31.11 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4254  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0453  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  29.17 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1632  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.592132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1891  transcriptional regulator, GntR family  28.22 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0316867  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  25.23 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1439  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  35.64 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1582  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  30.91 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  30.94 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4833  transcriptional regulator, GntR family  27.88 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.163458 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1630  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1608  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0385519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1758  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0256376  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  30.54 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1808  transcriptional regulator, GntR family  27.23 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  28.96 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3643  transcriptional regulator, GntR family  33.04 
 
 		 239 aa  78.2  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 229 aa  78.2  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1174  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 241 aa  78.2  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  26.06 
 
 		 218 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  30.48 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  27.96 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5277  transcriptional regulator, GntR family  27.88 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  30.46 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  28.91 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1377  transcriptional regulator, GntR family  30.63 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1876  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  28.8 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  29.02 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1411  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0858429  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3139  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00307264  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>