89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1153 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1153  signal transduction protein  100 
 
 		 288 aa  579  1e-164  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2165  hypothetical protein  49.31 
 
 		 291 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.758559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1886  hypothetical protein  46.18 
 
 		 291 aa  277  1e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0054  putative signal transduction protein with CBS domains  40.42 
 
 		 292 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1922  signal transduction protein  41.67 
 
 		 293 aa  218  1e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2102  signal transduction protein  40.77 
 
 		 292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2936  signal transduction protein  40.34 
 
 		 292 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000290592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0754  signal transduction protein  39.06 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.284841  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0640  hypothetical protein  38.33 
 
 		 292 aa  203  2e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1625  signal transduction protein  40.81 
 
 		 303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1049  signal transduction protein  40.07 
 
 		 303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1067  signal transduction protein  38.89 
 
 		 303 aa  196  3e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0897  signal transduction protein  40.74 
 
 		 303 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2771  transcriptional regulator, TrmB  48.84 
 
 		 177 aa  182  8.000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.129306  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2734  Protein of unknown function DUF293  49.7 
 
 		 177 aa  176  3e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.645133 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0936  Protein of unknown function DUF293  52.73 
 
 		 177 aa  176  5e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0850424  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2269  Protein of unknown function DUF293  47.9 
 
 		 177 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0304  Protein of unknown function DUF293  48.5 
 
 		 177 aa  166  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.480647  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4532  transcriptional regulator, TrmB  46.07 
 
 		 177 aa  163  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  33.33 
 
 		 300 aa  147  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.548765 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  29.51 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3672  Protein of unknown function DUF293  38.79 
 
 		 173 aa  129  8.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.829255  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  27.27 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0942  signal transduction protein  29.72 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1169  Protein of unknown function DUF293  33.33 
 
 		 176 aa  105  7e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.896672  normal  0.435827 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2105  Protein of unknown function DUF293  33.33 
 
 		 178 aa  97.4  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0300972  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2063  protein of unknown function UPF0074  32.52 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1735  signal transduction protein  25.09 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.281156  decreased coverage  0.000421461 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1555  signal transduction protein  27.92 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1742  signal transduction protein  27.07 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.12379 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0565  signal transduction protein  25.98 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.632057  hitchhiker  0.00109381 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  36.52 
 
 		 141 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0817  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 603 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.175091 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0822  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  32.48 
 
 		 603 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0770  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.48 
 
 		 603 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461269  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  35.19 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1543  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.91 
 
 		 600 aa  55.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00292919  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0818  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  32.48 
 
 		 603 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.410169  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1022  cyclic nucleotide-binding protein  34.29 
 
 		 613 aa  53.1  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  34.96 
 
 		 618 aa  51.2  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  31.3 
 
 		 145 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  29.51 
 
 		 629 aa  50.8  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  35.29 
 
 		 141 aa  48.9  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.82 
 
 		 613 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  30.25 
 
 		 411 aa  47.8  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003141  Signal transduction protein  30.51 
 
 		 629 aa  47.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  31.78 
 
 		 618 aa  47  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2858  putative signal transduction protein with CBS domains  30.19 
 
 		 125 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  29.27 
 
 		 637 aa  47.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1479  signal-transduction protein  30 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.543565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3131  cyclic nucleotide-binding domain (cNMP-BD) protein  29.73 
 
 		 633 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  23.53 
 
 		 626 aa  47.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  26.7 
 
 		 331 aa  46.6  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  27.34 
 
 		 615 aa  47  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  32.28 
 
 		 146 aa  46.6  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  33.63 
 
 		 140 aa  46.6  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  28.57 
 
 		 142 aa  46.6  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  30.97 
 
 		 139 aa  46.2  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  26.05 
 
 		 625 aa  45.8  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  31.86 
 
 		 155 aa  45.8  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  29.09 
 
 		 144 aa  45.8  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  28.12 
 
 		 615 aa  45.8  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  27.62 
 
 		 136 aa  45.8  0.0009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  30.7 
 
 		 145 aa  45.4  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  26.83 
 
 		 626 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2504  cyclic nucleotide-binding protein  29.84 
 
 		 628 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0637  signal-transduction protein  30.97 
 
 		 140 aa  44.3  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  35.4 
 
 		 144 aa  44.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.316039 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  34.38 
 
 		 131 aa  44.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  30.25 
 
 		 370 aa  44.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.78 
 
 		 877 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  21.6 
 
 		 279 aa  43.9  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  28.3 
 
 		 145 aa  43.9  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0628  signal-transduction protein  30.28 
 
 		 141 aa  43.9  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  26.83 
 
 		 641 aa  43.9  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  26.03 
 
 		 907 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  33.62 
 
 		 625 aa  43.5  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  29.51 
 
 		 164 aa  43.5  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  25.83 
 
 		 626 aa  43.5  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  26.96 
 
 		 281 aa  43.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0672  signal-transduction protein  32.14 
 
 		 131 aa  43.1  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  27.05 
 
 		 160 aa  42.7  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  27.68 
 
 		 623 aa  43.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0633  signal-transduction protein  32.43 
 
 		 141 aa  42.4  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  27.91 
 
 		 615 aa  42.7  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3143  CBS domain-containing protein  31.97 
 
 		 601 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4568  putative signal transduction protein with CBS domains  30.25 
 
 		 155 aa  42.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0446023  normal  0.17585 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4435  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.25 
 
 		 155 aa  42.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  28.24 
 
 		 138 aa  42.4  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>