197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1107 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1107  permease  100 
 
 		 350 aa  675    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0862  permease  52.12 
 
 		 356 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.254841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0816  membrane protein-like protein  50.56 
 
 		 357 aa  325  8.000000000000001e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0664  permease  46.98 
 
 		 386 aa  306  4.0000000000000004e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.7223  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0944  transporter  46.94 
 
 		 347 aa  294  2e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_877  permease  46.57 
 
 		 343 aa  293  4e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1748  permease  48.13 
 
 		 362 aa  290  3e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000179413  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1802  permease  47.55 
 
 		 362 aa  287  2e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2072  permease  46.05 
 
 		 392 aa  285  9e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1323  permease  46.05 
 
 		 389 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0016  permease  49.72 
 
 		 359 aa  281  2e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0828  permease  45.53 
 
 		 361 aa  277  2e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000427926  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0556  permease  45.48 
 
 		 390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1006  permease, putative  47.28 
 
 		 343 aa  273  3e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0459509  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0753  permease  46.46 
 
 		 389 aa  268  8.999999999999999e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0377989 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2877  permease  46.43 
 
 		 390 aa  262  6e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1478  permease  44.05 
 
 		 389 aa  252  7e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.177676  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1485  permease  43.96 
 
 		 393 aa  250  3e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.363242  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0893  permease  46.02 
 
 		 343 aa  247  2e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0456  permease  41.46 
 
 		 367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.349904  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20090  permease  44.51 
 
 		 393 aa  242  7.999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1899  permease  46.13 
 
 		 350 aa  233  5e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0700  permease  40.56 
 
 		 359 aa  231  1e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0184  hypothetical protein  36.79 
 
 		 437 aa  208  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1904  permease  52.35 
 
 		 433 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.560761  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3597  permease  50.6 
 
 		 461 aa  166  8e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.306889 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1855  permease  47.7 
 
 		 489 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146115  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0701  permease  57.69 
 
 		 479 aa  141  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1323  permease  42.49 
 
 		 452 aa  141  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  28.4 
 
 		 363 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  24.76 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  24.06 
 
 		 368 aa  80.5  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  25.16 
 
 		 363 aa  79.3  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  26.36 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  25.39 
 
 		 357 aa  73.6  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  22.95 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  22.11 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  22.53 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  24.16 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0580  hypothetical protein  31.43 
 
 		 475 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  25.44 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  21.03 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  26.56 
 
 		 352 aa  67  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1966  hypothetical protein  25.61 
 
 		 378 aa  66.2  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01499  hypothetical protein  23.61 
 
 		 345 aa  66.2  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  23.71 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02580  hypothetical protein  23.61 
 
 		 345 aa  66.2  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  22.7 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08200  permease  23.33 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119775  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  22.62 
 
 		 336 aa  65.9  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  23.61 
 
 		 353 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  23.26 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0158  permease  26.48 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  22.36 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  23.78 
 
 		 402 aa  62.8  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  22.99 
 
 		 294 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1299  permease  21.03 
 
 		 338 aa  62  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.201061  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05267  hypothetical protein  21.86 
 
 		 378 aa  62  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  23.87 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  22.49 
 
 		 337 aa  62  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  22.83 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1027  transporter  23.81 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3942  permease  25.17 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1089  permease  23.81 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  22.05 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  23.31 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  24.28 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0014  permease  30.99 
 
 		 451 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  25.27 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0486  permease  22.7 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  22.97 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  22.05 
 
 		 344 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  22.37 
 
 		 356 aa  58.9  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  24.83 
 
 		 330 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  22.97 
 
 		 356 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  23.57 
 
 		 332 aa  59.3  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  22.56 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1645  permease  24.51 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701842  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3419  permease  24.83 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  21.21 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3596  hypothetical protein  22.41 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  22.22 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3647  permease  23.61 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.5727 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2338  permease  22.78 
 
 		 358 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.677868  normal  0.0877008 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3823  permease  22.78 
 
 		 358 aa  57  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  22.87 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  21.51 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  22.97 
 
 		 365 aa  56.2  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2333  permease  23.12 
 
 		 332 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.685877  normal  0.0887616 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  22.87 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3818  permease  23.12 
 
 		 332 aa  55.8  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  22.58 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  22.92 
 
 		 351 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  22.29 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1430  permease  24.31 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.611447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  22.87 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  22.58 
 
 		 331 aa  54.3  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3621  putative permease  24.41 
 
 		 346 aa  54.3  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  29.27 
 
 		 349 aa  54.3  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0665  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF318 domain protein)  20 
 
 		 324 aa  53.9  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>