180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0476 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  100 
 
 		 321 aa  634    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1421  mevalonate kinase  38.53 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.238571  hitchhiker  0.00767711 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  43.67 
 
 		 328 aa  188  8e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  40.98 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  39.76 
 
 		 327 aa  185  7e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  39.88 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2541  mevalonate kinase  42.44 
 
 		 328 aa  177  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2376  mevalonate kinase  39.32 
 
 		 289 aa  175  7e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2213  mevalonate kinase  41.48 
 
 		 289 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  38.64 
 
 		 338 aa  169  5e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  37.58 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0966  mevalonate kinase  38.39 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.104962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2045  mevalonate kinase  38.17 
 
 		 330 aa  149  7e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2890  mevalonate kinase  36.96 
 
 		 289 aa  143  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00676748  normal  0.719721 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1812  mevalonate kinase  38.7 
 
 		 289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1358  mevalonate kinase  33.57 
 
 		 314 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  36.42 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2002  mevalonate kinase  33.53 
 
 		 356 aa  123  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.360358  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0315  mevalonate kinase  30.12 
 
 		 313 aa  122  6e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0580  mevalonate kinase  31.41 
 
 		 317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.761954  normal  0.0461716 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0258  mevalonate kinase  30.53 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0467  mevalonate kinase  31.1 
 
 		 314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.250256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1338  mevalonate kinase  31.12 
 
 		 317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1835  mevalonate kinase  31.4 
 
 		 310 aa  109  6e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.782527 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1602  mevalonate kinase  33.9 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0123084  normal  0.126865 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  32.81 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1599  mevalonate kinase  33.12 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.309754  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1653  mevalonate kinase  31.97 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1736  mevalonate kinase  34.35 
 
 		 316 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1323  mevalonate kinase  31.25 
 
 		 309 aa  102  6e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.516434  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0646  mevalonate kinase  30.47 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.199793  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0775  mevalonate kinase  30.39 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0721  mevalonate kinase  29.37 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00059401  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0620  phosphomevalonate kinase  29.37 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.373049  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40742  mevalonate kinase  29.43 
 
 		 432 aa  99.8  6e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0150941 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01740  cystathionine beta-lyase, putative  29 
 
 		 900 aa  99.4  7e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2461  mevalonate kinase  32.09 
 
 		 314 aa  89.7  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1124  mevalonate kinase  27.87 
 
 		 276 aa  89.7  6e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03869  mevalonate kinase (AFU_orthologue; AFUA_4G07780)  29.64 
 
 		 735 aa  87.8  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.105428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  26.23 
 
 		 361 aa  87.8  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1033  mevalonate kinase  28.66 
 
 		 322 aa  83.2  0.000000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3409  mevalonate kinase  34.94 
 
 		 347 aa  82.8  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53929  mevalonate kinase  28.68 
 
 		 490 aa  78.2  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323174  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1100  mevalonate kinase  29.75 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.979552  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1326  mevalonate kinase, putative  27.41 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0418302  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  28.9 
 
 		 348 aa  75.1  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0913  phosphomevalonate kinase  26.63 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000929735  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1733  GHMP kinase  24.11 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0454  mevalonate kinase  27.27 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1385  mevalonate kinase  27.7 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  23.2 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0722  putative phopshomevalonate kinase  26.05 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190894  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0598  mevalonate kinase  26.62 
 
 		 286 aa  67  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  27.27 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  24.59 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  30.98 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0776  galactokinase  27.6 
 
 		 355 aa  66.2  0.0000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0240  phosphomevalonate kinase  24.34 
 
 		 358 aa  65.9  0.0000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0621  mevalonate kinase  25.72 
 
 		 340 aa  65.9  0.0000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132017  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1114  GHMP kinase  25.46 
 
 		 382 aa  65.5  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1732  GHMP kinase  26.43 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  26.04 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  26.51 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  23.63 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1575  phosphomevalonate kinase  28.39 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00534382 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0613  mevalonate kinase  27.54 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0628  mevalonate kinase  27.54 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  27.64 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  22.92 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  22.92 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0915  mevalonate kinase  25.8 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00806632  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  25.43 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  27.61 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  27.22 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  23.42 
 
 		 382 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  24.02 
 
 		 386 aa  59.3  0.00000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  23.91 
 
 		 395 aa  59.3  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  23.42 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  23.42 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  23.42 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  23.42 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  24.57 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  24.23 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0615  phosphomevalonate kinase  23.65 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0630  phosphomevalonate kinase  23.65 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  23.65 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  26.87 
 
 		 369 aa  57  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1794  homoserine kinase  35.23 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  25.77 
 
 		 394 aa  57  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  23.14 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0708  mevalonate kinase  22.64 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  23.01 
 
 		 382 aa  55.8  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  22.32 
 
 		 382 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1102  phosphomevalonate kinase  28.1 
 
 		 249 aa  55.1  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.029164  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4922  GHMP kinase  29.88 
 
 		 359 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  22.32 
 
 		 382 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  22.32 
 
 		 382 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  23.74 
 
 		 386 aa  54.7  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  22.87 
 
 		 382 aa  55.1  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  22.32 
 
 		 382 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>