185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2044 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2044  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 300 aa  585  1e-166  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1920  FAD dependent oxidoreductase  38.24 
 
 		 305 aa  134  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.145777 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  32.95 
 
 		 374 aa  113  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  33.14 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  33.33 
 
 		 375 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  31.02 
 
 		 368 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  27.41 
 
 		 666 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  30.31 
 
 		 382 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0408  glycine oxidase ThiO  32.46 
 
 		 335 aa  90.5  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0882665  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  27.1 
 
 		 666 aa  89.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  31.18 
 
 		 379 aa  89.7  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  32.94 
 
 		 375 aa  86.7  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  31.44 
 
 		 652 aa  85.9  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  30.36 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  29.81 
 
 		 684 aa  84.7  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  26.44 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  29.17 
 
 		 371 aa  84  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  31.09 
 
 		 440 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  25.42 
 
 		 369 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  30.79 
 
 		 401 aa  82.4  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  26.2 
 
 		 365 aa  82.4  0.000000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  29.12 
 
 		 342 aa  82.4  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  24.58 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  25.75 
 
 		 367 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28291  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  29.79 
 
 		 371 aa  80.9  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  30.93 
 
 		 402 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  26.27 
 
 		 369 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  26.81 
 
 		 386 aa  79.3  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  25.99 
 
 		 369 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  29.66 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  24.86 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  24.86 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  24.58 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  24.86 
 
 		 369 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  27.41 
 
 		 361 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  24.86 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  24.86 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  31.69 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  31.23 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00501  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  23.26 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  24.01 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  22.75 
 
 		 367 aa  73.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  25.99 
 
 		 367 aa  73.2  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 376 aa  72.4  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0048  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  23.65 
 
 		 369 aa  72.8  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  27.22 
 
 		 363 aa  72.4  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  27.84 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5037  FAD dependent oxidoreductase  27.12 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  40 
 
 		 376 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00481  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  23.88 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.254103  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  31.4 
 
 		 338 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  23.16 
 
 		 372 aa  69.7  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  29.13 
 
 		 652 aa  70.1  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  31.34 
 
 		 385 aa  69.7  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2498  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  29.79 
 
 		 355 aa  68.9  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.373577  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  36.81 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  28.37 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  30.37 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  32.01 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1461  FAD dependent oxidoreductase  25.53 
 
 		 379 aa  67  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942129  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  27.65 
 
 		 363 aa  66.6  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 		 363 aa  66.6  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  27.73 
 
 		 372 aa  66.2  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0094  glycine oxidase ThiO  31.82 
 
 		 368 aa  65.9  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  27.99 
 
 		 388 aa  65.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  28.53 
 
 		 375 aa  65.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1225  oxidoreductase, DadA family protein/D-amino acid oxidase  24.15 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01740  glycine oxidase ThiO  28.17 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  30.91 
 
 		 367 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  27.79 
 
 		 368 aa  62.4  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  28.9 
 
 		 378 aa  62.4  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1783  FAD dependent oxidoreductase  26.27 
 
 		 381 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.359042  normal  0.766074 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  31.36 
 
 		 349 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0199  FAD dependent oxidoreductase  26.06 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1201  iminodiacetate oxidase, putative  24.43 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  29.6 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  35.9 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  28.57 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  23.53 
 
 		 375 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0545  glycine oxidase ThiO  29.94 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0557  glycine oxidase ThiO  29.94 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.959703  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0535  glycine oxidase ThiO  29.94 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  28.88 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  30.17 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  24.71 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  31.9 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  26.17 
 
 		 375 aa  57  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  29.88 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  43.62 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  27.65 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  27.51 
 
 		 404 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  38.73 
 
 		 376 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 365 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0537  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 		 369 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0520  FAD dependent oxidoreductase  25.86 
 
 		 369 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1962  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 		 382 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0197  glycine oxidase ThiO  28.44 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  27.14 
 
 		 373 aa  55.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3277  FAD dependent oxidoreductase  26.51 
 
 		 367 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  24.42 
 
 		 419 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>