61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1658 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1658  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 870 aa  1674    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0923542  normal  0.462592 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2325  TPR repeat-containing protein  65.23 
 
 		 920 aa  959    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.86445 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0954  TPR repeat-containing protein  34.33 
 
 		 993 aa  189  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.656775  normal  0.653362 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  27.92 
 
 		 1097 aa  153  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  27.64 
 
 		 1094 aa  139  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  27.85 
 
 		 1095 aa  137  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  27.33 
 
 		 1083 aa  120  9e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.86 
 
 		 914 aa  68.6  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4838  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.22 
 
 		 900 aa  67.8  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874018  hitchhiker  0.003849 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  25.34 
 
 		 1108 aa  66.6  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3460  transcriptional activator domain-containing protein  27.42 
 
 		 1061 aa  62  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  27.79 
 
 		 901 aa  61.2  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1602  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.16 
 
 		 897 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.208535 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3477  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.74 
 
 		 877 aa  59.7  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1583  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.91 
 
 		 955 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.559531  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0140  ATP-dependent transcriptional regulator  24.47 
 
 		 977 aa  59.3  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3844  regulatory protein, LuxR  27.94 
 
 		 944 aa  58.5  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  24.51 
 
 		 916 aa  57.8  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  22.81 
 
 		 896 aa  57  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  23.94 
 
 		 1111 aa  56.2  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  40.21 
 
 		 1163 aa  56.6  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3129  transcriptional regulator MalT  31.16 
 
 		 914 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535917  decreased coverage  0.00386402 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  23.97 
 
 		 887 aa  55.5  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.07 
 
 		 921 aa  55.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2354  transcriptional activator domain-containing protein  24.37 
 
 		 1070 aa  54.7  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.607566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.8 
 
 		 921 aa  53.9  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.8 
 
 		 921 aa  53.9  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  33.9 
 
 		 1145 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3125  transcriptional activator domain-containing protein  23.02 
 
 		 1068 aa  53.5  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5022  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 947 aa  52.8  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362862  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5099  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  25.52 
 
 		 900 aa  52  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2524  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.82 
 
 		 914 aa  51.6  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.9975  normal  0.793034 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2722  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.57 
 
 		 947 aa  51.6  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4164  LuxR transcriptional regulator  27.61 
 
 		 960 aa  50.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950161  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5237  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  28.53 
 
 		 846 aa  50.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5021  putative transcriptional regulator  30.87 
 
 		 855 aa  50.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00982675  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  31.72 
 
 		 1204 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2742  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.33 
 
 		 930 aa  49.7  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.649414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4031  ATP-dependent transcription regulator LuxR  21.38 
 
 		 896 aa  49.7  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.924331  normal  0.36139 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.56 
 
 		 922 aa  50.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  27.25 
 
 		 907 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3996  transcriptional activator domain protein  30.59 
 
 		 1009 aa  49.3  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.306526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4809  regulatory protein, LuxR  28.07 
 
 		 717 aa  48.9  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.17127 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0601  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  25.91 
 
 		 901 aa  48.9  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000493174 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  27.35 
 
 		 933 aa  48.9  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.32 
 
 		 894 aa  48.1  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0292  hypothetical protein  21.48 
 
 		 954 aa  47.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0090168  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  49.12 
 
 		 766 aa  47  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2932  regulatory protein, LuxR  26.3 
 
 		 919 aa  46.2  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1633  tetratricopeptide TPR_4  25.74 
 
 		 1031 aa  46.6  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.720693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2376  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  26.4 
 
 		 897 aa  46.2  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000225223  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2469  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.03 
 
 		 860 aa  46.2  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.05 
 
 		 880 aa  46.2  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3564  MalT  25.32 
 
 		 695 aa  46.2  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4571  transcriptional activator domain protein  27.02 
 
 		 985 aa  45.4  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.723489 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4133  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  26.78 
 
 		 749 aa  45.8  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  26.01 
 
 		 896 aa  45.4  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0766  tetratricopeptide TPR_4  22.43 
 
 		 1000 aa  45.4  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106648  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13150  putative transcriptional regulator  29.7 
 
 		 906 aa  45.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.697366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1186  transcriptional regulator  28.84 
 
 		 906 aa  44.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.41 
 
 		 889 aa  44.7  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>