More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1558 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2054  histidyl-tRNA synthetase  76.89 
 
 		 430 aa  654    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.526684  normal  0.664001 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1558  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 428 aa  861    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0108926 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1121  histidyl-tRNA synthetase  54.48 
 
 		 431 aa  413  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00227645 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 419 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 419 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 435 aa  318  1e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 423 aa  309  5e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 		 421 aa  306  6e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 423 aa  298  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3166  histidyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 420 aa  297  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.218543  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 424 aa  296  4e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 419 aa  296  4e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 426 aa  295  8e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 423 aa  293  4e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 415 aa  293  5e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 417 aa  293  5e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2121  histidyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 421 aa  292  8e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100215  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 429 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6102  Histidine--tRNA ligase  44.5 
 
 		 421 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 		 421 aa  290  2e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  39.61 
 
 		 420 aa  291  2e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 429 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 		 423 aa  289  7e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 		 423 aa  289  7e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 423 aa  288  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 423 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 423 aa  287  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 423 aa  287  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 423 aa  288  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 423 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 421 aa  287  2e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1340  histidyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 424 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 423 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 		 420 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 423 aa  286  7e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 414 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 423 aa  283  3.0000000000000004e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 414 aa  282  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 429 aa  282  9e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1950  histidyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 		 441 aa  281  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2054  histidyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 418 aa  281  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 420 aa  281  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 420 aa  281  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 433 aa  281  2e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 424 aa  279  8e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 		 419 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 		 426 aa  278  2e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 420 aa  276  4e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  40.48 
 
 		 422 aa  276  4e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 421 aa  276  4e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 421 aa  276  6e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  38.52 
 
 		 423 aa  275  8e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 430 aa  275  9e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12600  histidyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 423 aa  275  9e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0797227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 		 417 aa  275  9e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 429 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 429 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0397  histidyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 434 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00425435  normal  0.748396 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1619  histidyl-tRNA synthetase  38.75 
 
 		 436 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  35.87 
 
 		 415 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  36.54 
 
 		 424 aa  274  3e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1205  histidyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 		 441 aa  273  4.0000000000000004e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  39.81 
 
 		 424 aa  273  5.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 		 417 aa  272  8.000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0393  histidyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 429 aa  272  9e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 426 aa  272  9e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1013  histidyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 411 aa  271  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.422572  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 		 424 aa  272  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1786  histidyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 		 430 aa  271  1e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736899 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0013  histidyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 419 aa  272  1e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2855  histidyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 428 aa  271  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983012  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 		 418 aa  271  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0362  histidyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 422 aa  271  2e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0779555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 		 414 aa  271  2e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2311  histidyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 421 aa  271  2e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.202906  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1510  histidyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 426 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.707902  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  36.47 
 
 		 425 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1701  histidyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 421 aa  270  4e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0751975  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2365  histidyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 420 aa  270  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2590  histidyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 422 aa  268  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108947  normal  0.309926 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  36.3 
 
 		 424 aa  268  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1306  histidyl-tRNA synthetase  36.52 
 
 		 424 aa  268  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000890962  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 		 419 aa  268  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 		 420 aa  267  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1545  histidyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 		 424 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000365747  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 		 425 aa  266  4e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 429 aa  266  5e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 		 424 aa  266  5.999999999999999e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3809  histidyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 420 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.985695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 		 430 aa  266  5.999999999999999e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1117  histidyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 		 424 aa  266  7e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.727727  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 		 414 aa  266  7e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 		 424 aa  265  8e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 		 424 aa  265  8e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 		 424 aa  265  8e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  38.61 
 
 		 424 aa  265  8e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 		 424 aa  265  8e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 		 424 aa  265  8e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 		 424 aa  265  8e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 		 424 aa  265  8e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>